RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.35■■■■□ 3.25
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.34■■■■□ 3.25
ACTB-211ENST00000480301 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.33■■■■□ 3.25
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.32■■■■□ 3.24
ACTB-211ENST00000480301 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
ACTB-211ENST00000480301 PRXQ9BXM0 1461 aa35.2■■■■□ 3.23
ACTB-211ENST00000480301 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.17■■■■□ 3.22
ACTB-211ENST00000480301 EEA1Q15075 1411 aa35.12■■■■□ 3.21
ACTB-211ENST00000480301 IQGAP2Q13576 1575 aa35.08■■■■□ 3.21
ACTB-211ENST00000480301 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ACTB-211ENST00000480301 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.94■■■■□ 3.18
ACTB-211ENST00000480301 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.92■■■■□ 3.18
ACTB-211ENST00000480301 DISP1Q96F81 1524 aa34.91■■■■□ 3.18
ACTB-211ENST00000480301 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.89■■■■□ 3.18
ACTB-211ENST00000480301 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.87■■■■□ 3.17
ACTB-211ENST00000480301 PTPRGP23470 1445 aa34.86■■■■□ 3.17
ACTB-211ENST00000480301 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
ACTB-211ENST00000480301 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0556O60303 1618 aa34.76■■■■□ 3.15
ACTB-211ENST00000480301 KIF21BO75037 1637 aa34.74■■■■□ 3.15
ACTB-211ENST00000480301 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.72■■■■□ 3.15
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA3Q08378 1498 aa34.71■■■■□ 3.15
ACTB-211ENST00000480301 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.66■■■■□ 3.14
ACTB-211ENST00000480301 UACAQ9BZF9 1416 aa34.62■■■■□ 3.13
ACTB-211ENST00000480301 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.58■■■■□ 3.13
ACTB-211ENST00000480301 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.58■■■■□ 3.13
ACTB-211ENST00000480301 P3H3Q8IVL6 736 aa34.54■■■■□ 3.12
ACTB-211ENST00000480301 ABCC2Q92887 1545 aa34.54■■■■□ 3.12
ACTB-211ENST00000480301 MAPKBP1O60336 1514 aa34.52■■■■□ 3.12
ACTB-211ENST00000480301 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
ACTB-211ENST00000480301 SAMD9Q5K651 1589 aa34.5■■■■□ 3.11
ACTB-211ENST00000480301 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
ACTB-211ENST00000480301 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.46■■■■□ 3.11
ACTB-211ENST00000480301 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.42■■■■□ 3.1
ACTB-211ENST00000480301 ABCA8O94911 1581 aa34.41■■■■□ 3.1
ACTB-211ENST00000480301 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.41■■■■□ 3.1
ACTB-211ENST00000480301 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.37■■■■□ 3.09
ACTB-211ENST00000480301 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.34■■■■□ 3.09
ACTB-211ENST00000480301 ASXL2Q76L83 1435 aa34.34■■■■□ 3.09
ACTB-211ENST00000480301 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.34■■■■□ 3.09
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.31■■■■□ 3.08
ACTB-211ENST00000480301 DIP2BQ9P265 1576 aa34.31■■■■□ 3.08
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.2■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.18■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 ATP10BO94823 1461 aa34.16■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 ARID3CA6NKF2 412 aa34.16■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.14■■■■□ 3.06
ACTB-211ENST00000480301 GLI2P10070 1586 aa34.13■■■■□ 3.05
ACTB-211ENST00000480301 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
ACTB-211ENST00000480301 KCNH8Q96L42 1107 aa34.03■■■■□ 3.04
ACTB-211ENST00000480301 FMN1Q68DA7 1419 aa34.03■■■■□ 3.04
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
ACTB-211ENST00000480301 TSPOAP1O95153 1857 aa33.97■■■■□ 3.03
ACTB-211ENST00000480301 CLIP1P30622 1438 aa33.95■■■■□ 3.02
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.93■■■■□ 3.02
ACTB-211ENST00000480301 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
ACTB-211ENST00000480301 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.89■■■■□ 3.02
ACTB-211ENST00000480301 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.86■■■■□ 3.01
ACTB-211ENST00000480301 CD109Q6YHK3 1445 aa33.85■■■■□ 3.01
ACTB-211ENST00000480301 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
ACTB-211ENST00000480301 HECW1Q76N89 1606 aa33.84■■■■□ 3.01
ACTB-211ENST00000480301 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.8■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.79■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.78■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 CEP162Q5TB80 1403 aa33.78■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.78■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 KDM6BO15054 1643 aa33.76■■■■□ 3
ACTB-211ENST00000480301 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.74■■■□□ 2.99
ACTB-211ENST00000480301 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
ACTB-211ENST00000480301 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
ACTB-211ENST00000480301 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
ACTB-211ENST00000480301 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.66■■■□□ 2.98
ACTB-211ENST00000480301 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.65■■■□□ 2.98
ACTB-211ENST00000480301 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.972e-34■■■■□ 20.9
ACTB-211ENST00000480301 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.61■■■□□ 2.97
ACTB-211ENST00000480301 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
ACTB-211ENST00000480301 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.54■■■□□ 2.96
ACTB-211ENST00000480301 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.52■■■□□ 2.96
ACTB-211ENST00000480301 NEO1Q92859 1461 aa33.5■■■□□ 2.95
ACTB-211ENST00000480301 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.49■■■□□ 2.95
ACTB-211ENST00000480301 KIF14Q15058 1648 aa33.47■■■□□ 2.95
ACTB-211ENST00000480301 PLCH2O75038 1416 aa33.45■■■□□ 2.94
ACTB-211ENST00000480301 FANCAO15360 1455 aa33.41■■■□□ 2.94
ACTB-211ENST00000480301 AKNAQ7Z591 1439 aa33.39■■■□□ 2.94
ACTB-211ENST00000480301 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.37■■■□□ 2.93
ACTB-211ENST00000480301 RAPGEF3O95398 923 aa33.36■■■□□ 2.93
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.33■■■□□ 2.93
ACTB-211ENST00000480301 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.32■■■□□ 2.92
ACTB-211ENST00000480301 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.31■■■□□ 2.92
ACTB-211ENST00000480301 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.29■■■□□ 2.92
ACTB-211ENST00000480301 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
ACTB-211ENST00000480301 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.25■■■□□ 2.91
ACTB-211ENST00000480301 ADGRL1O94910 1474 aa33.24■■■□□ 2.91
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.23■■■□□ 2.91
ACTB-211ENST00000480301 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.23■■■□□ 2.91
ACTB-211ENST00000480301 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.19■■■□□ 2.9
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