RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 CUL7Q14999 1698 aa49.17■■■■■ 5.46
CHTF18-209ENST00000479976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.16■■■■■ 5.46
CHTF18-209ENST00000479976 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.03■■■■■ 5.44
CHTF18-209ENST00000479976 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.03■■■■■ 5.44
CHTF18-209ENST00000479976 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.63■■■■■ 5.38
CHTF18-209ENST00000479976 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.61■■■■■ 5.37
CHTF18-209ENST00000479976 IQGAP2Q13576 1575 aa48.57■■■■■ 5.37
CHTF18-209ENST00000479976 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.55■■■■■ 5.36
CHTF18-209ENST00000479976 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.54■■■■■ 5.36
CHTF18-209ENST00000479976 PTPRGP23470 1445 aa48.52■■■■■ 5.36
CHTF18-209ENST00000479976 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.46■■■■■ 5.35
CHTF18-209ENST00000479976 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.45■■■■■ 5.35
CHTF18-209ENST00000479976 MAPKBP1O60336 1514 aa48.42■■■■■ 5.34
CHTF18-209ENST00000479976 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.35■■■■■ 5.33
CHTF18-209ENST00000479976 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.35■■■■■ 5.33
CHTF18-209ENST00000479976 DISP1Q96F81 1524 aa48.33■■■■■ 5.33
CHTF18-209ENST00000479976 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.3■■■■■ 5.32
CHTF18-209ENST00000479976 PRXQ9BXM0 1461 aa48.2■■■■■ 5.31
CHTF18-209ENST00000479976 DIP2BQ9P265 1576 aa48.2■■■■■ 5.31
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC2Q92887 1545 aa48.17■■■■■ 5.3
CHTF18-209ENST00000479976 UACAQ9BZF9 1416 aa48.15■■■■■ 5.3
CHTF18-209ENST00000479976 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.14■■■■■ 5.3
CHTF18-209ENST00000479976 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.13■■■■■ 5.3
CHTF18-209ENST00000479976 KIAA0556O60303 1618 aa48.11■■■■■ 5.29
CHTF18-209ENST00000479976 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48■■■■■ 5.27
CHTF18-209ENST00000479976 ASXL2Q76L83 1435 aa47.98■■■■■ 5.27
CHTF18-209ENST00000479976 GOLGA3Q08378 1498 aa47.97■■■■■ 5.27
CHTF18-209ENST00000479976 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.96■■■■■ 5.27
CHTF18-209ENST00000479976 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.91■■■■■ 5.26
CHTF18-209ENST00000479976 TSPOAP1O95153 1857 aa47.87■■■■■ 5.25
CHTF18-209ENST00000479976 EEA1Q15075 1411 aa47.81■■■■■ 5.24
CHTF18-209ENST00000479976 GLI2P10070 1586 aa47.78■■■■■ 5.24
CHTF18-209ENST00000479976 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
CHTF18-209ENST00000479976 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.76■■■■■ 5.24
CHTF18-209ENST00000479976 KDM6BO15054 1643 aa47.69■■■■■ 5.22
CHTF18-209ENST00000479976 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.67■■■■■ 5.22
CHTF18-209ENST00000479976 ABCA8O94911 1581 aa47.66■■■■■ 5.22
CHTF18-209ENST00000479976 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.63■■■■■ 5.22
CHTF18-209ENST00000479976 P3H3Q8IVL6 736 aa47.62■■■■■ 5.21
CHTF18-209ENST00000479976 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
CHTF18-209ENST00000479976 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.56■■■■■ 5.2
CHTF18-209ENST00000479976 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.52■■■■■ 5.2
CHTF18-209ENST00000479976 SAMD9Q5K651 1589 aa47.48■■■■■ 5.19
CHTF18-209ENST00000479976 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.45■■■■■ 5.19
CHTF18-209ENST00000479976 KCNH8Q96L42 1107 aa47.4■■■■■ 5.18
CHTF18-209ENST00000479976 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.39■■■■■ 5.18
CHTF18-209ENST00000479976 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
CHTF18-209ENST00000479976 KIF21BO75037 1637 aa47.36■■■■■ 5.17
CHTF18-209ENST00000479976 ARID3CA6NKF2 412 aa47.33■■■■■ 5.17
CHTF18-209ENST00000479976 ATP10BO94823 1461 aa47.32■■■■■ 5.17
CHTF18-209ENST00000479976 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
CHTF18-209ENST00000479976 CD109Q6YHK3 1445 aa47.26■■■■■ 5.16
CHTF18-209ENST00000479976 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.23■■■■■ 5.15
CHTF18-209ENST00000479976 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.23■■■■■ 5.15
CHTF18-209ENST00000479976 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.2■■■■■ 5.15
CHTF18-209ENST00000479976 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.19■■■■■ 5.14
CHTF18-209ENST00000479976 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.11■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.1■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.1■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.09■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
CHTF18-209ENST00000479976 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.95■■■■■ 5.11
CHTF18-209ENST00000479976 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.88■■■■■ 5.1
CHTF18-209ENST00000479976 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.82■■■■■ 5.09
CHTF18-209ENST00000479976 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.81■■■■■ 5.08
CHTF18-209ENST00000479976 ADGRL1O94910 1474 aa46.77■■■■■ 5.08
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.76■■■■■ 5.08
CHTF18-209ENST00000479976 FMN1Q68DA7 1419 aa46.72■■■■■ 5.07
CHTF18-209ENST00000479976 NEO1Q92859 1461 aa46.7■■■■■ 5.07
CHTF18-209ENST00000479976 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
CHTF18-209ENST00000479976 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
CHTF18-209ENST00000479976 RAPGEF3O95398 923 aa46.59■■■■■ 5.05
CHTF18-209ENST00000479976 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.58■■■■■ 5.054e-9■■□□□ 13.5
CHTF18-209ENST00000479976 HECW1Q76N89 1606 aa46.55■■■■■ 5.04
CHTF18-209ENST00000479976 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
CHTF18-209ENST00000479976 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.47■■■■■ 5.03
CHTF18-209ENST00000479976 FANCAO15360 1455 aa46.45■■■■■ 5.03
CHTF18-209ENST00000479976 AKNAQ7Z591 1439 aa46.44■■■■■ 5.02
CHTF18-209ENST00000479976 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.39■■■■■ 5.02
CHTF18-209ENST00000479976 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.39■■■■■ 5.02
CHTF18-209ENST00000479976 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.01
CHTF18-209ENST00000479976 PLCH2O75038 1416 aa46.33■■■■■ 5.01
CHTF18-209ENST00000479976 RICTORQ6R327 1708 aa46.28■■■■■ 5
CHTF18-209ENST00000479976 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.26■■■■■ 5
CHTF18-209ENST00000479976 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
CHTF18-209ENST00000479976 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.25■■■■■ 4.99
CHTF18-209ENST00000479976 CLIP1P30622 1438 aa46.2■■■■■ 4.99
CHTF18-209ENST00000479976 KIF14Q15058 1648 aa46.19■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.19■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.17■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.15■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.15■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
CHTF18-209ENST00000479976 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.12■■■■■ 4.97
CHTF18-209ENST00000479976 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.11■■■■■ 4.97
CHTF18-209ENST00000479976 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.09■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms