RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479263.5

PRKCZ-215, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 1,747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-215	ENST00000479263	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PRKCZ-215	ENST00000479263	GRIN2A	Q12879	1464 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	SYNJ2	O15056	1496 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PRKCZ-215	ENST00000479263	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PRKCZ-215	ENST00000479263	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PRKCZ-215	ENST00000479263	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PRKCZ-215	ENST00000479263	FBLN2	P98095	1184 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PRKCZ-215	ENST00000479263	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PRKCZ-215	ENST00000479263	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.81	■■■■□ 3
PRKCZ-215	ENST00000479263	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.81	■■■■□ 3
PRKCZ-215	ENST00000479263	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.79	■■■■□ 3
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.78	■■■■□ 3
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUP160	Q12769	1436 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PRKCZ-215	ENST00000479263	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PRKCZ-215	ENST00000479263	CHD1	O14646	1710 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PRKCZ-215	ENST00000479263	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PRKCZ-215	ENST00000479263	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
PRKCZ-215	ENST00000479263	APLP2	Q06481	763 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PRKCZ-215	ENST00000479263	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PRKCZ-215	ENST00000479263	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PRKCZ-215	ENST00000479263	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PRKCZ-215	ENST00000479263	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PRKCZ-215	ENST00000479263	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PRKCZ-215	ENST00000479263	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PRKCZ-215	ENST00000479263	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PRKCZ-215	ENST00000479263	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.45	■■■□□ 2.94
PRKCZ-215	ENST00000479263	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRKCZ-215	ENST00000479263	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PRKCZ-215	ENST00000479263	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PRKCZ-215	ENST00000479263	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PRKCZ-215	ENST00000479263	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PRKCZ-215	ENST00000479263	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PRKCZ-215	ENST00000479263	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PRKCZ-215	ENST00000479263	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PRKCZ-215	ENST00000479263	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PRKCZ-215	ENST00000479263	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PRKCZ-215	ENST00000479263	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PRKCZ-215	ENST00000479263	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PRKCZ-215	ENST00000479263	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PRKCZ-215	ENST00000479263	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCA8	O94911	1581 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRKCZ-215	ENST00000479263	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRKCZ-215	ENST00000479263	PTPRG	P23470	1445 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PRKCZ-215	ENST00000479263	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PRKCZ-215	ENST00000479263	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33	■■■□□ 2.87
PRKCZ-215	ENST00000479263	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
PRKCZ-215	ENST00000479263	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRKCZ-215	ENST00000479263	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PRKCZ-215	ENST00000479263	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PRKCZ-215	ENST00000479263	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PRKCZ-215	ENST00000479263	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PRKCZ-215	ENST00000479263	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PRKCZ-215	ENST00000479263	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PRKCZ-215	ENST00000479263	ATP10B	O94823	1461 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PRKCZ-215	ENST00000479263	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PRKCZ-215	ENST00000479263	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRKCZ-215	ENST00000479263	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRKCZ-215	ENST00000479263	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PRKCZ-215	ENST00000479263	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PRKCZ-215	ENST00000479263	KIF14	Q15058	1648 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PRKCZ-215	ENST00000479263	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PRKCZ-215	ENST00000479263	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PRKCZ-215	ENST00000479263	ITGAE	P38570	1179 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PRKCZ-215	ENST00000479263	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
PRKCZ-215	ENST00000479263	HRC	P23327	699 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRKCZ-215	ENST00000479263	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PRKCZ-215	ENST00000479263	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PRKCZ-215	ENST00000479263	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PRKCZ-215	ENST00000479263	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PRKCZ-215	ENST00000479263	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PRKCZ-215	ENST00000479263	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PRKCZ-215	ENST00000479263	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PRKCZ-215	ENST00000479263	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PRKCZ-215	ENST00000479263	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PRKCZ-215	ENST00000479263	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.35	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRKCZ-215	ENST00000479263	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRKCZ-215	ENST00000479263	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.27	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms