RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479003.5

CHKB-208, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-208	ENST00000479003	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CHKB-208	ENST00000479003	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-208	ENST00000479003	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-208	ENST00000479003	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CHKB-208	ENST00000479003	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-208	ENST00000479003	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CHKB-208	ENST00000479003	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
CHKB-208	ENST00000479003	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
CHKB-208	ENST00000479003	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
CHKB-208	ENST00000479003	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CHKB-208	ENST00000479003	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CHKB-208	ENST00000479003	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
CHKB-208	ENST00000479003	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CHKB-208	ENST00000479003	IQGAP2	Q13576	1575 aa		41.76	■■■■■ 4.28
CHKB-208	ENST00000479003	FBLN2	P98095	1184 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CHKB-208	ENST00000479003	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.75	■■■■■ 4.27
CHKB-208	ENST00000479003	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.7	■■■■■ 4.27
CHKB-208	ENST00000479003	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.69	■■■■■ 4.27
CHKB-208	ENST00000479003	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.67	■■■■■ 4.26
CHKB-208	ENST00000479003	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		41.66	■■■■■ 4.26
CHKB-208	ENST00000479003	NUP160	Q12769	1436 aa		41.58	■■■■■ 4.25
CHKB-208	ENST00000479003	APLP2	Q06481	763 aa		41.54	■■■■■ 4.24
CHKB-208	ENST00000479003	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CHKB-208	ENST00000479003	CHD1	O14646	1710 aa		41.51	■■■■■ 4.24
CHKB-208	ENST00000479003	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
CHKB-208	ENST00000479003	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.42	■■■■■ 4.22
CHKB-208	ENST00000479003	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.38	■■■■■ 4.21
CHKB-208	ENST00000479003	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.35	■■■■■ 4.21
CHKB-208	ENST00000479003	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CHKB-208	ENST00000479003	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CHKB-208	ENST00000479003	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	41.31	■■■■■ 4.2
CHKB-208	ENST00000479003	TIAM1	Q13009	1591 aa		41.28	■■■■■ 4.2
CHKB-208	ENST00000479003	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.26	■■■■■ 4.2
CHKB-208	ENST00000479003	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.26	■■■■■ 4.2
CHKB-208	ENST00000479003	MAP3K1	Q13233	1512 aa		41.23	■■■■■ 4.19
CHKB-208	ENST00000479003	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.23	■■■■■ 4.19
CHKB-208	ENST00000479003	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.19	■■■■■ 4.18
CHKB-208	ENST00000479003	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.13	■■■■■ 4.17
CHKB-208	ENST00000479003	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.11	■■■■■ 4.17
CHKB-208	ENST00000479003	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CHKB-208	ENST00000479003	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
CHKB-208	ENST00000479003	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.03	■■■■■ 4.16
CHKB-208	ENST00000479003	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CHKB-208	ENST00000479003	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CHKB-208	ENST00000479003	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41	■■■■■ 4.15
CHKB-208	ENST00000479003	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
CHKB-208	ENST00000479003	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CHKB-208	ENST00000479003	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CHKB-208	ENST00000479003	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	40.9	■■■■■ 4.14
CHKB-208	ENST00000479003	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
CHKB-208	ENST00000479003	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CHKB-208	ENST00000479003	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CHKB-208	ENST00000479003	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CHKB-208	ENST00000479003	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CHKB-208	ENST00000479003	PTPRG	P23470	1445 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CHKB-208	ENST00000479003	ABCA8	O94911	1581 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CHKB-208	ENST00000479003	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CHKB-208	ENST00000479003	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CHKB-208	ENST00000479003	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CHKB-208	ENST00000479003	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
CHKB-208	ENST00000479003	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CHKB-208	ENST00000479003	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CHKB-208	ENST00000479003	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CHKB-208	ENST00000479003	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CHKB-208	ENST00000479003	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CHKB-208	ENST00000479003	UACA	Q9BZF9	1416 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CHKB-208	ENST00000479003	ATP10B	O94823	1461 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CHKB-208	ENST00000479003	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
CHKB-208	ENST00000479003	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
CHKB-208	ENST00000479003	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CHKB-208	ENST00000479003	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CHKB-208	ENST00000479003	ABCC2	Q92887	1545 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CHKB-208	ENST00000479003	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
CHKB-208	ENST00000479003	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
CHKB-208	ENST00000479003	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.35	■■■■■ 4.05
CHKB-208	ENST00000479003	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
CHKB-208	ENST00000479003	ITGAE	P38570	1179 aa		40.31	■■■■■ 4.04
CHKB-208	ENST00000479003	KIF14	Q15058	1648 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CHKB-208	ENST00000479003	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CHKB-208	ENST00000479003	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CHKB-208	ENST00000479003	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.25	■■■■■ 4.03
CHKB-208	ENST00000479003	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CHKB-208	ENST00000479003	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CHKB-208	ENST00000479003	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.17	■■■■■ 4.02
CHKB-208	ENST00000479003	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
CHKB-208	ENST00000479003	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.15	■■■■■ 4.02
CHKB-208	ENST00000479003	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CHKB-208	ENST00000479003	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
CHKB-208	ENST00000479003	MIER1	Q8N108	512 aa		40.11	■■■■■ 4.01
CHKB-208	ENST00000479003	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CHKB-208	ENST00000479003	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CHKB-208	ENST00000479003	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4
CHKB-208	ENST00000479003	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.04	■■■■■ 4
CHKB-208	ENST00000479003	MAPKBP1	O60336	1514 aa		40.04	■■■■■ 4
CHKB-208	ENST00000479003	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.02	■■■■■ 4

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