RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478866.5

NDUFS2-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 1,076 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-208	ENST00000478866	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.75	■■■□□ 2.83
NDUFS2-208	ENST00000478866	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		32.75	■■■□□ 2.83
NDUFS2-208	ENST00000478866	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
NDUFS2-208	ENST00000478866	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NDUFS2-208	ENST00000478866	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NDUFS2-208	ENST00000478866	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NDUFS2-208	ENST00000478866	EEA1	Q15075	1411 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NDUFS2-208	ENST00000478866	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NDUFS2-208	ENST00000478866	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
NDUFS2-208	ENST00000478866	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.49	■■■□□ 2.79
NDUFS2-208	ENST00000478866	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NDUFS2-208	ENST00000478866	PTPRG	P23470	1445 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NDUFS2-208	ENST00000478866	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NDUFS2-208	ENST00000478866	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
NDUFS2-208	ENST00000478866	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
NDUFS2-208	ENST00000478866	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.33	■■■□□ 2.77
NDUFS2-208	ENST00000478866	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.29	■■■□□ 2.76
NDUFS2-208	ENST00000478866	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.28	■■■□□ 2.76
NDUFS2-208	ENST00000478866	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NDUFS2-208	ENST00000478866	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NDUFS2-208	ENST00000478866	KIF21B	O75037	1637 aa		32.17	■■■□□ 2.74
NDUFS2-208	ENST00000478866	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NDUFS2-208	ENST00000478866	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NDUFS2-208	ENST00000478866	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
NDUFS2-208	ENST00000478866	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NDUFS2-208	ENST00000478866	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
NDUFS2-208	ENST00000478866	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NDUFS2-208	ENST00000478866	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NDUFS2-208	ENST00000478866	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.03	■■■□□ 2.72
NDUFS2-208	ENST00000478866	ABCC2	Q92887	1545 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NDUFS2-208	ENST00000478866	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.94	■■■□□ 2.7
NDUFS2-208	ENST00000478866	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.91	■■■□□ 2.7
NDUFS2-208	ENST00000478866	SAMD9	Q5K651	1589 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NDUFS2-208	ENST00000478866	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NDUFS2-208	ENST00000478866	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.85	■■■□□ 2.69
NDUFS2-208	ENST00000478866	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.85	■■■□□ 2.69
NDUFS2-208	ENST00000478866	ABCA8	O94911	1581 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NDUFS2-208	ENST00000478866	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NDUFS2-208	ENST00000478866	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.82	■■■□□ 2.68
NDUFS2-208	ENST00000478866	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.81	■■■□□ 2.68
NDUFS2-208	ENST00000478866	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
NDUFS2-208	ENST00000478866	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.71	■■■□□ 2.67
NDUFS2-208	ENST00000478866	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.7	■■■□□ 2.67
NDUFS2-208	ENST00000478866	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.68	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.65	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.64	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	ATP10B	O94823	1461 aa		31.64	■■■□□ 2.66
NDUFS2-208	ENST00000478866	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NDUFS2-208	ENST00000478866	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NDUFS2-208	ENST00000478866	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NDUFS2-208	ENST00000478866	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
NDUFS2-208	ENST00000478866	GLI2	P10070	1586 aa		31.57	■■■□□ 2.64
NDUFS2-208	ENST00000478866	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
NDUFS2-208	ENST00000478866	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
NDUFS2-208	ENST00000478866	CLIP1	P30622	1438 aa		31.51	■■■□□ 2.64
NDUFS2-208	ENST00000478866	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.5	■■■□□ 2.63
NDUFS2-208	ENST00000478866	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.47	■■■□□ 2.63
NDUFS2-208	ENST00000478866	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.42	■■■□□ 2.62
NDUFS2-208	ENST00000478866	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.41	■■■□□ 2.62
NDUFS2-208	ENST00000478866	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.36	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.33	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.32	■■■□□ 2.61
NDUFS2-208	ENST00000478866	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
NDUFS2-208	ENST00000478866	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.28	■■■□□ 2.6
NDUFS2-208	ENST00000478866	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.28	■■■□□ 2.6
NDUFS2-208	ENST00000478866	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
NDUFS2-208	ENST00000478866	KDM6B	O15054	1643 aa		31.25	■■■□□ 2.59
NDUFS2-208	ENST00000478866	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.21	■■■□□ 2.59
NDUFS2-208	ENST00000478866	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.21	■■■□□ 2.59
NDUFS2-208	ENST00000478866	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
NDUFS2-208	ENST00000478866	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.2	■■■□□ 2.58
NDUFS2-208	ENST00000478866	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.14	■■■□□ 2.58
NDUFS2-208	ENST00000478866	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
NDUFS2-208	ENST00000478866	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
NDUFS2-208	ENST00000478866	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.1	■■■□□ 2.57	1e-6	■■■■□ 23.9
NDUFS2-208	ENST00000478866	NEO1	Q92859	1461 aa		31.06	■■■□□ 2.56
NDUFS2-208	ENST00000478866	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.05	■■■□□ 2.56
NDUFS2-208	ENST00000478866	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.01	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	PLCH2	O75038	1416 aa		31	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	KIF14	Q15058	1648 aa		31	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	FANCA	O15360	1455 aa		30.98	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.98	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		30.97	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	AKNA	Q7Z591	1439 aa		30.96	■■■□□ 2.55
NDUFS2-208	ENST00000478866	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		30.94	■■■□□ 2.54
NDUFS2-208	ENST00000478866	RAPGEF3	O95398	923 aa		30.94	■■■□□ 2.54
NDUFS2-208	ENST00000478866	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		30.9	■■■□□ 2.54
NDUFS2-208	ENST00000478866	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	30.87	■■■□□ 2.53
NDUFS2-208	ENST00000478866	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		30.84	■■■□□ 2.53
NDUFS2-208	ENST00000478866	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		30.83	■■■□□ 2.53
NDUFS2-208	ENST00000478866	ADGRL1	O94910	1474 aa		30.82	■■■□□ 2.52
NDUFS2-208	ENST00000478866	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		30.81	■■■□□ 2.52
NDUFS2-208	ENST00000478866	APLP2	Q06481	763 aa		30.8	■■■□□ 2.52
NDUFS2-208	ENST00000478866	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52

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