RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478672.1

CCZ1-204, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1, Length 2,062 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-204ENST00000478672 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.57■■■■■ 4.41
CCZ1-204ENST00000478672 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CCZ1-204ENST00000478672 SYNJ2O15056 1496 aa42.54■■■■■ 4.4
CCZ1-204ENST00000478672 FBLN2P98095 1184 aa42.53■■■■■ 4.4
CCZ1-204ENST00000478672 GRIN2AQ12879 1464 aa42.52■■■■■ 4.4
CCZ1-204ENST00000478672 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
CCZ1-204ENST00000478672 P3H3Q8IVL6 736 aa42.43■■■■■ 4.38
CCZ1-204ENST00000478672 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.37■■■■■ 4.37
CCZ1-204ENST00000478672 IQGAP2Q13576 1575 aa42.35■■■■■ 4.37
CCZ1-204ENST00000478672 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.3■■■■■ 4.36
CCZ1-204ENST00000478672 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.29■■■■■ 4.36
CCZ1-204ENST00000478672 APLP2Q06481 763 aa42.28■■■■■ 4.36
CCZ1-204ENST00000478672 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.24■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 CEP170Q5SW79 1584 aa42.24■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 SAMD9Q5K651 1589 aa42.22■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 NUP160Q12769 1436 aa42.2■■■■■ 4.35
CCZ1-204ENST00000478672 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.12■■■■■ 4.33
CCZ1-204ENST00000478672 CHD1O14646 1710 aa42.1■■■■■ 4.33
CCZ1-204ENST00000478672 FMN1Q68DA7 1419 aa42.05■■■■■ 4.32
CCZ1-204ENST00000478672 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CCZ1-204ENST00000478672 JPH4Q96JJ6 628 aa41.98■■■■■ 4.31
CCZ1-204ENST00000478672 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
CCZ1-204ENST00000478672 DISP1Q96F81 1524 aa41.95■■■■■ 4.31
CCZ1-204ENST00000478672 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.93■■■■■ 4.3
CCZ1-204ENST00000478672 KIAA0556O60303 1618 aa41.91■■■■■ 4.3
CCZ1-204ENST00000478672 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.9■■■■■ 4.3
CCZ1-204ENST00000478672 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
CCZ1-204ENST00000478672 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.82■■■■■ 4.28
CCZ1-204ENST00000478672 TIAM1Q13009 1591 aa41.79■■■■■ 4.28
CCZ1-204ENST00000478672 MAP3K1Q13233 1512 aa41.79■■■■■ 4.28
CCZ1-204ENST00000478672 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CCZ1-204ENST00000478672 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.66■■■■■ 4.26
CCZ1-204ENST00000478672 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.63■■■■■ 4.25
CCZ1-204ENST00000478672 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
CCZ1-204ENST00000478672 HECW1Q76N89 1606 aa41.59■■■■■ 4.25
CCZ1-204ENST00000478672 SHROOM2Q13796 1616 aa41.58■■■■■ 4.25
CCZ1-204ENST00000478672 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.56■■■■■ 4.24
CCZ1-204ENST00000478672 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.5■■■■■ 4.23
CCZ1-204ENST00000478672 ARID3CA6NKF2 412 aa41.49■■■■■ 4.23
CCZ1-204ENST00000478672 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.49■■■■■ 4.23
CCZ1-204ENST00000478672 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
CCZ1-204ENST00000478672 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.46■■■■■ 4.23
CCZ1-204ENST00000478672 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 PTPRGP23470 1445 aa41.44■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 OSCARQ8IYS5 282 aa41.41■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.4■■■■■ 4.22
CCZ1-204ENST00000478672 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
CCZ1-204ENST00000478672 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
CCZ1-204ENST00000478672 ABCA8O94911 1581 aa41.31■■■■■ 4.2
CCZ1-204ENST00000478672 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.27■■■■■ 4.2
CCZ1-204ENST00000478672 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.27■■■■■ 4.2
CCZ1-204ENST00000478672 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.27■■■■■ 4.2
CCZ1-204ENST00000478672 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
CCZ1-204ENST00000478672 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CCZ1-204ENST00000478672 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.19■■■■■ 4.18
CCZ1-204ENST00000478672 UACAQ9BZF9 1416 aa41.16■■■■■ 4.18
CCZ1-204ENST00000478672 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CCZ1-204ENST00000478672 NCOA2Q15596 1464 aa41.15■■■■■ 4.18
CCZ1-204ENST00000478672 ATP10BO94823 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
CCZ1-204ENST00000478672 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CCZ1-204ENST00000478672 ARHGEF11O15085 1522 aa41.01■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 ABCC2Q92887 1545 aa41■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.99■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.98■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.97■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 ITGAEP38570 1179 aa40.95■■■■■ 4.15
CCZ1-204ENST00000478672 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.88■■■■■ 4.14
CCZ1-204ENST00000478672 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.13
CCZ1-204ENST00000478672 HRCP23327 699 aa40.8■■■■■ 4.12
CCZ1-204ENST00000478672 KIF14Q15058 1648 aa40.8■■■■■ 4.12
CCZ1-204ENST00000478672 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.78■■■■■ 4.12
CCZ1-204ENST00000478672 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.75■■■■■ 4.11
CCZ1-204ENST00000478672 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.74■■■■■ 4.11
CCZ1-204ENST00000478672 MIA2Q96PC5 1412 aa40.73■■■■■ 4.11
CCZ1-204ENST00000478672 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
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CCZ1-204ENST00000478672 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
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CCZ1-204ENST00000478672 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
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CCZ1-204ENST00000478672 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.58■■■■■ 4.09
CCZ1-204ENST00000478672 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
CCZ1-204ENST00000478672 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CCZ1-204ENST00000478672 PTPRKQ15262 1439 aa40.5■■■■■ 4.07
CCZ1-204ENST00000478672 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.49■■■■■ 4.07
CCZ1-204ENST00000478672 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.49■■■■■ 4.07
CCZ1-204ENST00000478672 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.44■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.43■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
CCZ1-204ENST00000478672 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.41■■■■■ 4.06
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