RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 JPH4Q96JJ6 628 aa39.65■■■■□ 3.94
C9orf3-216ENST00000478603 CUL7Q14999 1698 aa39.63■■■■□ 3.93
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.46■■■■□ 3.91
C9orf3-216ENST00000478603 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.45■■■■□ 3.91
C9orf3-216ENST00000478603 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.2■■■■□ 3.87
C9orf3-216ENST00000478603 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.19■■■■□ 3.86
C9orf3-216ENST00000478603 IQGAP2Q13576 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
C9orf3-216ENST00000478603 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.85
C9orf3-216ENST00000478603 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.11■■■■□ 3.85
C9orf3-216ENST00000478603 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRGP23470 1445 aa39.06■■■■□ 3.84
C9orf3-216ENST00000478603 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.06■■■■□ 3.84
C9orf3-216ENST00000478603 MAPKBP1O60336 1514 aa39.04■■■■□ 3.84
C9orf3-216ENST00000478603 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.01■■■■□ 3.84
C9orf3-216ENST00000478603 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.98■■■■□ 3.83
C9orf3-216ENST00000478603 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.97■■■■□ 3.83
C9orf3-216ENST00000478603 DISP1Q96F81 1524 aa38.95■■■■□ 3.83
C9orf3-216ENST00000478603 DIP2BQ9P265 1576 aa38.94■■■■□ 3.82
C9orf3-216ENST00000478603 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.9■■■■□ 3.82
C9orf3-216ENST00000478603 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.84■■■■□ 3.81
C9orf3-216ENST00000478603 ABCC2Q92887 1545 aa38.82■■■■□ 3.8
C9orf3-216ENST00000478603 KIAA0556O60303 1618 aa38.81■■■■□ 3.8
C9orf3-216ENST00000478603 UACAQ9BZF9 1416 aa38.78■■■■□ 3.8
C9orf3-216ENST00000478603 PRXQ9BXM0 1461 aa38.78■■■■□ 3.8
C9orf3-216ENST00000478603 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.76■■■■□ 3.8
C9orf3-216ENST00000478603 TSPOAP1O95153 1857 aa38.73■■■■□ 3.79
C9orf3-216ENST00000478603 ASXL2Q76L83 1435 aa38.68■■■■□ 3.78
C9orf3-216ENST00000478603 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.61■■■■□ 3.77
C9orf3-216ENST00000478603 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.6■■■■□ 3.77
C9orf3-216ENST00000478603 GOLGA3Q08378 1498 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-216ENST00000478603 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
C9orf3-216ENST00000478603 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
C9orf3-216ENST00000478603 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.54■■■■□ 3.76
C9orf3-216ENST00000478603 KDM6BO15054 1643 aa38.53■■■■□ 3.76
C9orf3-216ENST00000478603 GLI2P10070 1586 aa38.52■■■■□ 3.76
C9orf3-216ENST00000478603 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
C9orf3-216ENST00000478603 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
C9orf3-216ENST00000478603 ABCA8O94911 1581 aa38.43■■■■□ 3.74
C9orf3-216ENST00000478603 EEA1Q15075 1411 aa38.38■■■■□ 3.74
C9orf3-216ENST00000478603 P3H3Q8IVL6 736 aa38.37■■■■□ 3.73
C9orf3-216ENST00000478603 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.35■■■■□ 3.73
C9orf3-216ENST00000478603 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
C9orf3-216ENST00000478603 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.33■■■■□ 3.73
C9orf3-216ENST00000478603 SAMD9Q5K651 1589 aa38.27■■■■□ 3.72
C9orf3-216ENST00000478603 ARID3CA6NKF2 412 aa38.2■■■■□ 3.71
C9orf3-216ENST00000478603 KCNH8Q96L42 1107 aa38.19■■■■□ 3.7
C9orf3-216ENST00000478603 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
C9orf3-216ENST00000478603 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.17■■■■□ 3.7
C9orf3-216ENST00000478603 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
C9orf3-216ENST00000478603 KIF21BO75037 1637 aa38.12■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 ATP10BO94823 1461 aa38.11■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.11■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.1■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.09■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 CD109Q6YHK3 1445 aa38.07■■■■□ 3.69
C9orf3-216ENST00000478603 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.04■■■■□ 3.68
C9orf3-216ENST00000478603 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.03■■■■□ 3.68
C9orf3-216ENST00000478603 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-216ENST00000478603 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.98■■■■□ 3.67
C9orf3-216ENST00000478603 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
C9orf3-216ENST00000478603 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
C9orf3-216ENST00000478603 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
C9orf3-216ENST00000478603 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.9■■■■□ 3.66
C9orf3-216ENST00000478603 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.86■■■■□ 3.65
C9orf3-216ENST00000478603 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
C9orf3-216ENST00000478603 ADGRL1O94910 1474 aa37.79■■■■□ 3.64
C9orf3-216ENST00000478603 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.71■■■■□ 3.63
C9orf3-216ENST00000478603 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.67■■■■□ 3.62
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.64■■■■□ 3.62
C9orf3-216ENST00000478603 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
C9orf3-216ENST00000478603 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.61■■■■□ 3.61
C9orf3-216ENST00000478603 NEO1Q92859 1461 aa37.6■■■■□ 3.61
C9orf3-216ENST00000478603 FMN1Q68DA7 1419 aa37.56■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 RAPGEF3O95398 923 aa37.55■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.55■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.52■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 HECW1Q76N89 1606 aa37.51■■■■□ 3.6
C9orf3-216ENST00000478603 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.48■■■■□ 3.59
C9orf3-216ENST00000478603 FANCAO15360 1455 aa37.42■■■■□ 3.58
C9orf3-216ENST00000478603 AKNAQ7Z591 1439 aa37.41■■■■□ 3.58
C9orf3-216ENST00000478603 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.39■■■■□ 3.58
C9orf3-216ENST00000478603 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.37■■■■□ 3.57
C9orf3-216ENST00000478603 RICTORQ6R327 1708 aa37.36■■■■□ 3.57
C9orf3-216ENST00000478603 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
C9orf3-216ENST00000478603 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
C9orf3-216ENST00000478603 KIF14Q15058 1648 aa37.29■■■■□ 3.56
C9orf3-216ENST00000478603 PLCH2O75038 1416 aa37.28■■■■□ 3.56
C9orf3-216ENST00000478603 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.25■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.24■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.21■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.21■■■■□ 3.55
C9orf3-216ENST00000478603 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.19■■■■□ 3.54
C9orf3-216ENST00000478603 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
C9orf3-216ENST00000478603 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.18■■■■□ 3.54
C9orf3-216ENST00000478603 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.18■■■■□ 3.54
C9orf3-216ENST00000478603 CLIP1P30622 1438 aa37.17■■■■□ 3.54
C9orf3-216ENST00000478603 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms