RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478336.5

ARF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARF1, Length 930 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-208ENST00000478336 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.33■■■■■ 4.05
ARF1-208ENST00000478336 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.3■■■■■ 4.04
ARF1-208ENST00000478336 PRXQ9BXM0 1461 aa40.28■■■■■ 4.04
ARF1-208ENST00000478336 EEA1Q15075 1411 aa40.27■■■■■ 4.04
ARF1-208ENST00000478336 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.25■■■■■ 4.03
ARF1-208ENST00000478336 JPH4Q96JJ6 628 aa40.23■■■■■ 4.03
ARF1-208ENST00000478336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
ARF1-208ENST00000478336 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.17■■■■■ 4.02
ARF1-208ENST00000478336 IQGAP2Q13576 1575 aa40.13■■■■■ 4.01
ARF1-208ENST00000478336 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.02■■■■■ 4
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ARF1-208ENST00000478336 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.87■■■■□ 3.97
ARF1-208ENST00000478336 DISP1Q96F81 1524 aa39.86■■■■□ 3.97
ARF1-208ENST00000478336 KIAA0556O60303 1618 aa39.76■■■■□ 3.96
ARF1-208ENST00000478336 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.75■■■■□ 3.95
ARF1-208ENST00000478336 PTPRGP23470 1445 aa39.7■■■■□ 3.95
ARF1-208ENST00000478336 GOLGA3Q08378 1498 aa39.67■■■■□ 3.94
ARF1-208ENST00000478336 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.62■■■■□ 3.93
ARF1-208ENST00000478336 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ARF1-208ENST00000478336 SAMD9Q5K651 1589 aa39.54■■■■□ 3.92
ARF1-208ENST00000478336 UACAQ9BZF9 1416 aa39.47■■■■□ 3.91
ARF1-208ENST00000478336 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.46■■■■□ 3.91
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ARF1-208ENST00000478336 ABCC2Q92887 1545 aa39.43■■■■□ 3.9
ARF1-208ENST00000478336 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
ARF1-208ENST00000478336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
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ARF1-208ENST00000478336 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.37■■■■□ 3.89
ARF1-208ENST00000478336 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.35■■■■□ 3.89
ARF1-208ENST00000478336 P3H3Q8IVL6 736 aa39.34■■■■□ 3.89
ARF1-208ENST00000478336 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.34■■■■□ 3.89
ARF1-208ENST00000478336 ABCA8O94911 1581 aa39.33■■■■□ 3.89
ARF1-208ENST00000478336 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
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ARF1-208ENST00000478336 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.24■■■■□ 3.87
ARF1-208ENST00000478336 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
ARF1-208ENST00000478336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.18■■■■□ 3.86
ARF1-208ENST00000478336 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.17■■■■□ 3.86
ARF1-208ENST00000478336 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.15■■■■□ 3.86
ARF1-208ENST00000478336 DIP2BQ9P265 1576 aa39.13■■■■□ 3.85
ARF1-208ENST00000478336 ASXL2Q76L83 1435 aa39.12■■■■□ 3.85
ARF1-208ENST00000478336 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.11■■■■□ 3.85
ARF1-208ENST00000478336 FAM69CQ0P6D2 419 aa39■■■■□ 3.83
ARF1-208ENST00000478336 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
ARF1-208ENST00000478336 ATP10BO94823 1461 aa38.97■■■■□ 3.83
ARF1-208ENST00000478336 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.94■■■■□ 3.82
ARF1-208ENST00000478336 FMN1Q68DA7 1419 aa38.94■■■■□ 3.82
ARF1-208ENST00000478336 GLI2P10070 1586 aa38.92■■■■□ 3.82
ARF1-208ENST00000478336 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.91■■■■□ 3.82
ARF1-208ENST00000478336 CLIP1P30622 1438 aa38.89■■■■□ 3.82
ARF1-208ENST00000478336 ARID3CA6NKF2 412 aa38.88■■■■□ 3.81
ARF1-208ENST00000478336 HECW1Q76N89 1606 aa38.78■■■■□ 3.8
ARF1-208ENST00000478336 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.76■■■■□ 3.8
ARF1-208ENST00000478336 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.74■■■■□ 3.79
ARF1-208ENST00000478336 CEP162Q5TB80 1403 aa38.74■■■■□ 3.79
ARF1-208ENST00000478336 TSPOAP1O95153 1857 aa38.74■■■■□ 3.79
ARF1-208ENST00000478336 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
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ARF1-208ENST00000478336 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
ARF1-208ENST00000478336 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
ARF1-208ENST00000478336 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.66■■■■□ 3.78
ARF1-208ENST00000478336 KCNH8Q96L42 1107 aa38.66■■■■□ 3.78
ARF1-208ENST00000478336 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.64■■■■□ 3.78
ARF1-208ENST00000478336 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.62■■■■□ 3.77
ARF1-208ENST00000478336 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
ARF1-208ENST00000478336 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.59■■■■□ 3.77
ARF1-208ENST00000478336 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.57■■■■□ 3.77
ARF1-208ENST00000478336 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.56■■■■□ 3.76
ARF1-208ENST00000478336 CD109Q6YHK3 1445 aa38.55■■■■□ 3.76
ARF1-208ENST00000478336 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.52■■■■□ 3.76
ARF1-208ENST00000478336 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.52■■■■□ 3.76
ARF1-208ENST00000478336 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.5■■■■□ 3.75
ARF1-208ENST00000478336 KDM6BO15054 1643 aa38.45■■■■□ 3.75
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ARF1-208ENST00000478336 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.36■■■■□ 3.73
ARF1-208ENST00000478336 KIF14Q15058 1648 aa38.31■■■■□ 3.72
ARF1-208ENST00000478336 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
ARF1-208ENST00000478336 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.29■■■■□ 3.72
ARF1-208ENST00000478336 NEO1Q92859 1461 aa38.22■■■■□ 3.71
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ARF1-208ENST00000478336 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.17■■■■□ 3.7
ARF1-208ENST00000478336 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.16■■■■□ 3.7
ARF1-208ENST00000478336 PLCH2O75038 1416 aa38.15■■■■□ 3.7
ARF1-208ENST00000478336 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.14■■■■□ 3.7
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ARF1-208ENST00000478336 AKNAQ7Z591 1439 aa38.05■■■■□ 3.68
ARF1-208ENST00000478336 PREX2Q70Z35 1606 aa38.02■■■■□ 3.68
ARF1-208ENST00000478336 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38■■■■□ 3.67
ARF1-208ENST00000478336 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.98■■■■□ 3.67
ARF1-208ENST00000478336 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.98■■■■□ 3.67
ARF1-208ENST00000478336 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.97■■■■□ 3.67
ARF1-208ENST00000478336 MAP3K1Q13233 1512 aa37.97■■■■□ 3.67
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