RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477624.1

TMA7-202, Transcript of translation machinery associated 7 homolog, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMA7, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA7-202ENST00000477624 KIF27Q86VH2 1401 aa37.2■■■■□ 3.55
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TMA7-202ENST00000477624 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
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TMA7-202ENST00000477624 CUL7Q14999 1698 aa37.05■■■■□ 3.52
TMA7-202ENST00000477624 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.04■■■■□ 3.52
TMA7-202ENST00000477624 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.04■■■■□ 3.52
TMA7-202ENST00000477624 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.04■■■■□ 3.52
TMA7-202ENST00000477624 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.01■■■■□ 3.52
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TMA7-202ENST00000477624 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.78■■■■□ 3.48
TMA7-202ENST00000477624 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.73■■■■□ 3.47
TMA7-202ENST00000477624 IQGAP2Q13576 1575 aa36.72■■■■□ 3.47
TMA7-202ENST00000477624 DISP1Q96F81 1524 aa36.67■■■■□ 3.46
TMA7-202ENST00000477624 ABCC2Q92887 1545 aa36.65■■■■□ 3.46
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TMA7-202ENST00000477624 ASXL2Q76L83 1435 aa36.59■■■■□ 3.45
TMA7-202ENST00000477624 UACAQ9BZF9 1416 aa36.57■■■■□ 3.44
TMA7-202ENST00000477624 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.56■■■■□ 3.44
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TMA7-202ENST00000477624 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.53■■■■□ 3.44
TMA7-202ENST00000477624 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.5■■■■□ 3.43
TMA7-202ENST00000477624 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.49■■■■□ 3.43
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TMA7-202ENST00000477624 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.43■■■■□ 3.42
TMA7-202ENST00000477624 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
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TMA7-202ENST00000477624 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TMA7-202ENST00000477624 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
TMA7-202ENST00000477624 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
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TMA7-202ENST00000477624 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.23■■■■□ 3.39
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TMA7-202ENST00000477624 KCNH8Q96L42 1107 aa36.1■■■■□ 3.37
TMA7-202ENST00000477624 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.07■■■■□ 3.37
TMA7-202ENST00000477624 P3H3Q8IVL6 736 aa36.06■■■■□ 3.36
TMA7-202ENST00000477624 ADGRL1O94910 1474 aa36.01■■■■□ 3.36
TMA7-202ENST00000477624 ARID3CA6NKF2 412 aa35.99■■■■□ 3.35
TMA7-202ENST00000477624 CD109Q6YHK3 1445 aa35.99■■■■□ 3.35
TMA7-202ENST00000477624 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.98■■■■□ 3.35
TMA7-202ENST00000477624 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.93■■■■□ 3.34
TMA7-202ENST00000477624 ATP10BO94823 1461 aa35.9■■■■□ 3.34
TMA7-202ENST00000477624 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.88■■■■□ 3.33
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TMA7-202ENST00000477624 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TMA7-202ENST00000477624 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.67■■■■□ 3.3
TMA7-202ENST00000477624 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.65■■■■□ 3.3
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TMA7-202ENST00000477624 KIF21BO75037 1637 aa35.56■■■■□ 3.28
TMA7-202ENST00000477624 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.55■■■■□ 3.28
TMA7-202ENST00000477624 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.52■■■■□ 3.28
TMA7-202ENST00000477624 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
TMA7-202ENST00000477624 NEO1Q92859 1461 aa35.46■■■■□ 3.27
TMA7-202ENST00000477624 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.44■■■■□ 3.26
TMA7-202ENST00000477624 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.39■■■■□ 3.26
TMA7-202ENST00000477624 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.38■■■■□ 3.25
TMA7-202ENST00000477624 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.32■■■■□ 3.25
TMA7-202ENST00000477624 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.3■■■■□ 3.24
TMA7-202ENST00000477624 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
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TMA7-202ENST00000477624 PTPRMP28827 1452 aa35.28■■■■□ 3.24
TMA7-202ENST00000477624 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
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TMA7-202ENST00000477624 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
TMA7-202ENST00000477624 FANCAO15360 1455 aa35.23■■■■□ 3.23
TMA7-202ENST00000477624 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.23■■■■□ 3.23
TMA7-202ENST00000477624 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
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TMA7-202ENST00000477624 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
TMA7-202ENST00000477624 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.15■■■■□ 3.22
TMA7-202ENST00000477624 MADDQ8WXG6 1647 aa35.14■■■■□ 3.22
TMA7-202ENST00000477624 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.11■■■■□ 3.21
TMA7-202ENST00000477624 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.1■■■■□ 3.21
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TMA7-202ENST00000477624 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.07■■■■□ 3.2
TMA7-202ENST00000477624 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.05■■■■□ 3.2
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TMA7-202ENST00000477624 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.04■■■■□ 3.2
TMA7-202ENST00000477624 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.04■■■■□ 3.2
TMA7-202ENST00000477624 HECW1Q76N89 1606 aa34.99■■■■□ 3.19
TMA7-202ENST00000477624 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.99■■■■□ 3.19
TMA7-202ENST00000477624 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
TMA7-202ENST00000477624 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.96■■■■□ 3.19
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