RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 IQGAP2Q13576 1575 aa23.99■■□□□ 1.43
SRRT-210ENST00000477529 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.96■■□□□ 1.43
SRRT-210ENST00000477529 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
SRRT-210ENST00000477529 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.9■■□□□ 1.42
SRRT-210ENST00000477529 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SRRT-210ENST00000477529 PRXQ9BXM0 1461 aa23.87■■□□□ 1.41
SRRT-210ENST00000477529 EEA1Q15075 1411 aa23.81■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 JPH4Q96JJ6 628 aa23.8■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 KIF21BO75037 1637 aa23.79■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 KIAA0556O60303 1618 aa23.77■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.77■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.77■■□□□ 1.4
SRRT-210ENST00000477529 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.75■■□□□ 1.39
SRRT-210ENST00000477529 DISP1Q96F81 1524 aa23.73■■□□□ 1.39
SRRT-210ENST00000477529 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.65■■□□□ 1.38
SRRT-210ENST00000477529 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.64■■□□□ 1.37
SRRT-210ENST00000477529 SAMD9Q5K651 1589 aa23.63■■□□□ 1.37
SRRT-210ENST00000477529 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 GOLGA3Q08378 1498 aa23.56■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 MAPKBP1O60336 1514 aa23.55■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 ABCC2Q92887 1545 aa23.53■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 PTPRGP23470 1445 aa23.52■■□□□ 1.36
SRRT-210ENST00000477529 TSPOAP1O95153 1857 aa23.51■■□□□ 1.35
SRRT-210ENST00000477529 DIP2BQ9P265 1576 aa23.49■■□□□ 1.35
SRRT-210ENST00000477529 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.48■■□□□ 1.35
SRRT-210ENST00000477529 ABCA8O94911 1581 aa23.48■■□□□ 1.35
SRRT-210ENST00000477529 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.43■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 UACAQ9BZF9 1416 aa23.42■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.41■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.39■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.39■■□□□ 1.34
SRRT-210ENST00000477529 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.35■■□□□ 1.33
SRRT-210ENST00000477529 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SRRT-210ENST00000477529 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.32■■□□□ 1.32
SRRT-210ENST00000477529 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.3■■□□□ 1.32
SRRT-210ENST00000477529 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
SRRT-210ENST00000477529 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.28■■□□□ 1.32
SRRT-210ENST00000477529 GLI2P10070 1586 aa23.27■■□□□ 1.32
SRRT-210ENST00000477529 ASXL2Q76L83 1435 aa23.26■■□□□ 1.31
SRRT-210ENST00000477529 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.25■■□□□ 1.31
SRRT-210ENST00000477529 P3H3Q8IVL6 736 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-210ENST00000477529 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-210ENST00000477529 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.23■■□□□ 1.31
SRRT-210ENST00000477529 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.19■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 HECW1Q76N89 1606 aa23.16■■□□□ 1.3
SRRT-210ENST00000477529 ATP10BO94823 1461 aa23.13■■□□□ 1.29
SRRT-210ENST00000477529 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.12■■□□□ 1.29
SRRT-210ENST00000477529 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-210ENST00000477529 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SRRT-210ENST00000477529 KDM6BO15054 1643 aa23.11■■□□□ 1.29
SRRT-210ENST00000477529 FMN1Q68DA7 1419 aa23.06■■□□□ 1.28
SRRT-210ENST00000477529 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SRRT-210ENST00000477529 ARID3CA6NKF2 412 aa23■■□□□ 1.27
SRRT-210ENST00000477529 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-210ENST00000477529 CLIP1P30622 1438 aa22.99■■□□□ 1.27
SRRT-210ENST00000477529 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.98■■□□□ 1.27
SRRT-210ENST00000477529 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.97■■□□□ 1.27
SRRT-210ENST00000477529 KIF14Q15058 1648 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 CEP162Q5TB80 1403 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
SRRT-210ENST00000477529 CD109Q6YHK3 1445 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.87■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 KCNH8Q96L42 1107 aa22.87■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 RICTORQ6R327 1708 aa22.85■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SRRT-210ENST00000477529 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SRRT-210ENST00000477529 PREX2Q70Z35 1606 aa22.81■■□□□ 1.24
SRRT-210ENST00000477529 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.78■■□□□ 1.24
SRRT-210ENST00000477529 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.76■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.76■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 NEO1Q92859 1461 aa22.75■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.75■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SRRT-210ENST00000477529 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.69■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 FANCAO15360 1455 aa22.69■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 TIAM1Q13009 1591 aa22.67■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.66■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SRRT-210ENST00000477529 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.64■■□□□ 1.21
SRRT-210ENST00000477529 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.63■■□□□ 1.21
SRRT-210ENST00000477529 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.62■■□□□ 1.21
SRRT-210ENST00000477529 PLCH2O75038 1416 aa22.62■■□□□ 1.21
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