RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477375.5

IMP4-215, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene IMP4, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IMP4-215	ENST00000477375	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		29.38	■■■□□ 2.29
IMP4-215	ENST00000477375	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.32	■■■□□ 2.28
IMP4-215	ENST00000477375	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.3	■■■□□ 2.28
IMP4-215	ENST00000477375	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.29	■■■□□ 2.28
IMP4-215	ENST00000477375	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
IMP4-215	ENST00000477375	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.24	■■■□□ 2.27
IMP4-215	ENST00000477375	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.19	■■■□□ 2.26
IMP4-215	ENST00000477375	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.18	■■■□□ 2.26
IMP4-215	ENST00000477375	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.18	■■■□□ 2.26
IMP4-215	ENST00000477375	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
IMP4-215	ENST00000477375	EEA1	Q15075	1411 aa		29.15	■■■□□ 2.26
IMP4-215	ENST00000477375	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.01	■■■□□ 2.23
IMP4-215	ENST00000477375	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.99	■■■□□ 2.23
IMP4-215	ENST00000477375	KIF21B	O75037	1637 aa		28.98	■■■□□ 2.23
IMP4-215	ENST00000477375	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.94	■■■□□ 2.22
IMP4-215	ENST00000477375	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.93	■■■□□ 2.22
IMP4-215	ENST00000477375	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
IMP4-215	ENST00000477375	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.89	■■■□□ 2.22
IMP4-215	ENST00000477375	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.88	■■■□□ 2.21
IMP4-215	ENST00000477375	PTPRG	P23470	1445 aa		28.87	■■■□□ 2.21
IMP4-215	ENST00000477375	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.85	■■■□□ 2.21
IMP4-215	ENST00000477375	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.78	■■■□□ 2.2
IMP4-215	ENST00000477375	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
IMP4-215	ENST00000477375	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.75	■■■□□ 2.19
IMP4-215	ENST00000477375	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
IMP4-215	ENST00000477375	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.71	■■■□□ 2.19
IMP4-215	ENST00000477375	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.69	■■■□□ 2.18
IMP4-215	ENST00000477375	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
IMP4-215	ENST00000477375	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.66	■■■□□ 2.18
IMP4-215	ENST00000477375	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.66	■■■□□ 2.18
IMP4-215	ENST00000477375	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.66	■■■□□ 2.18
IMP4-215	ENST00000477375	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.64	■■■□□ 2.17
IMP4-215	ENST00000477375	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.63	■■■□□ 2.17
IMP4-215	ENST00000477375	ABCA8	O94911	1581 aa		28.62	■■■□□ 2.17
IMP4-215	ENST00000477375	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.61	■■■□□ 2.17
IMP4-215	ENST00000477375	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
IMP4-215	ENST00000477375	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.55	■■■□□ 2.16
IMP4-215	ENST00000477375	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.54	■■■□□ 2.16
IMP4-215	ENST00000477375	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.53	■■■□□ 2.16
IMP4-215	ENST00000477375	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.5	■■■□□ 2.15
IMP4-215	ENST00000477375	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.48	■■■□□ 2.15
IMP4-215	ENST00000477375	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.47	■■■□□ 2.15
IMP4-215	ENST00000477375	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.46	■■■□□ 2.15
IMP4-215	ENST00000477375	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.46	■■■□□ 2.15
IMP4-215	ENST00000477375	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.42	■■■□□ 2.14
IMP4-215	ENST00000477375	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.4	■■■□□ 2.14
IMP4-215	ENST00000477375	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.4	■■■□□ 2.14
IMP4-215	ENST00000477375	ATP10B	O94823	1461 aa		28.37	■■■□□ 2.13
IMP4-215	ENST00000477375	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
IMP4-215	ENST00000477375	GLI2	P10070	1586 aa		28.3	■■■□□ 2.12
IMP4-215	ENST00000477375	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
IMP4-215	ENST00000477375	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.3	■■■□□ 2.12
IMP4-215	ENST00000477375	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.29	■■■□□ 2.12
IMP4-215	ENST00000477375	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.12
IMP4-215	ENST00000477375	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.24	■■■□□ 2.11
IMP4-215	ENST00000477375	CLIP1	P30622	1438 aa		28.24	■■■□□ 2.11
IMP4-215	ENST00000477375	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.23	■■■□□ 2.11
IMP4-215	ENST00000477375	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.23	■■■□□ 2.11
IMP4-215	ENST00000477375	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.2	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.18	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.14	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
IMP4-215	ENST00000477375	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.12	■■■□□ 2.09
IMP4-215	ENST00000477375	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.07	■■■□□ 2.08
IMP4-215	ENST00000477375	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.06	■■■□□ 2.08
IMP4-215	ENST00000477375	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IMP4-215	ENST00000477375	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IMP4-215	ENST00000477375	KDM6B	O15054	1643 aa		28.03	■■■□□ 2.08
IMP4-215	ENST00000477375	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.99	■■■□□ 2.07
IMP4-215	ENST00000477375	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.98	■■■□□ 2.07
IMP4-215	ENST00000477375	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		27.96	■■■□□ 2.07
IMP4-215	ENST00000477375	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07
IMP4-215	ENST00000477375	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
IMP4-215	ENST00000477375	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.94	■■■□□ 2.06
IMP4-215	ENST00000477375	KIF14	Q15058	1648 aa		27.92	■■■□□ 2.06
IMP4-215	ENST00000477375	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.91	■■■□□ 2.06
IMP4-215	ENST00000477375	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
IMP4-215	ENST00000477375	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
IMP4-215	ENST00000477375	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.82	■■■□□ 2.04
IMP4-215	ENST00000477375	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.77	■■■□□ 2.04
IMP4-215	ENST00000477375	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	NEO1	Q92859	1461 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.75	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	PLCH2	O75038	1416 aa		27.73	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	FANCA	O15360	1455 aa		27.72	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.72	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.71	■■■□□ 2.03
IMP4-215	ENST00000477375	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.68	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.68	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.68	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.67	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.67	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.66	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.64	■■■□□ 2.02
IMP4-215	ENST00000477375	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.63	■■■□□ 2.01
IMP4-215	ENST00000477375	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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