RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477375.5

IMP4-215, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene IMP4, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-215ENST00000477375 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.38■■■□□ 2.29
IMP4-215ENST00000477375 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.32■■■□□ 2.28
IMP4-215ENST00000477375 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.3■■■□□ 2.28
IMP4-215ENST00000477375 JPH4Q96JJ6 628 aa29.29■■■□□ 2.28
IMP4-215ENST00000477375 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
IMP4-215ENST00000477375 PRXQ9BXM0 1461 aa29.24■■■□□ 2.27
IMP4-215ENST00000477375 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.19■■■□□ 2.26
IMP4-215ENST00000477375 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.18■■■□□ 2.26
IMP4-215ENST00000477375 IQGAP2Q13576 1575 aa29.18■■■□□ 2.26
IMP4-215ENST00000477375 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
IMP4-215ENST00000477375 EEA1Q15075 1411 aa29.15■■■□□ 2.26
IMP4-215ENST00000477375 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.01■■■□□ 2.23
IMP4-215ENST00000477375 DISP1Q96F81 1524 aa28.99■■■□□ 2.23
IMP4-215ENST00000477375 KIF21BO75037 1637 aa28.98■■■□□ 2.23
IMP4-215ENST00000477375 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-215ENST00000477375 KIAA0556O60303 1618 aa28.93■■■□□ 2.22
IMP4-215ENST00000477375 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
IMP4-215ENST00000477375 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.89■■■□□ 2.22
IMP4-215ENST00000477375 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.88■■■□□ 2.21
IMP4-215ENST00000477375 PTPRGP23470 1445 aa28.87■■■□□ 2.21
IMP4-215ENST00000477375 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.85■■■□□ 2.21
IMP4-215ENST00000477375 GOLGA3Q08378 1498 aa28.78■■■□□ 2.2
IMP4-215ENST00000477375 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
IMP4-215ENST00000477375 SAMD9Q5K651 1589 aa28.75■■■□□ 2.19
IMP4-215ENST00000477375 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
IMP4-215ENST00000477375 P3H3Q8IVL6 736 aa28.71■■■□□ 2.19
IMP4-215ENST00000477375 UACAQ9BZF9 1416 aa28.69■■■□□ 2.18
IMP4-215ENST00000477375 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
IMP4-215ENST00000477375 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-215ENST00000477375 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-215ENST00000477375 ABCC2Q92887 1545 aa28.66■■■□□ 2.18
IMP4-215ENST00000477375 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.64■■■□□ 2.17
IMP4-215ENST00000477375 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
IMP4-215ENST00000477375 ABCA8O94911 1581 aa28.62■■■□□ 2.17
IMP4-215ENST00000477375 MAPKBP1O60336 1514 aa28.61■■■□□ 2.17
IMP4-215ENST00000477375 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
IMP4-215ENST00000477375 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.55■■■□□ 2.16
IMP4-215ENST00000477375 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.54■■■□□ 2.16
IMP4-215ENST00000477375 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
IMP4-215ENST00000477375 DIP2BQ9P265 1576 aa28.5■■■□□ 2.15
IMP4-215ENST00000477375 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.48■■■□□ 2.15
IMP4-215ENST00000477375 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.47■■■□□ 2.15
IMP4-215ENST00000477375 ASXL2Q76L83 1435 aa28.46■■■□□ 2.15
IMP4-215ENST00000477375 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.46■■■□□ 2.15
IMP4-215ENST00000477375 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.42■■■□□ 2.14
IMP4-215ENST00000477375 TSPOAP1O95153 1857 aa28.4■■■□□ 2.14
IMP4-215ENST00000477375 ARID3CA6NKF2 412 aa28.4■■■□□ 2.14
IMP4-215ENST00000477375 ATP10BO94823 1461 aa28.37■■■□□ 2.13
IMP4-215ENST00000477375 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
IMP4-215ENST00000477375 GLI2P10070 1586 aa28.3■■■□□ 2.12
IMP4-215ENST00000477375 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
IMP4-215ENST00000477375 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.3■■■□□ 2.12
IMP4-215ENST00000477375 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.29■■■□□ 2.12
IMP4-215ENST00000477375 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
IMP4-215ENST00000477375 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.24■■■□□ 2.11
IMP4-215ENST00000477375 CLIP1P30622 1438 aa28.24■■■□□ 2.11
IMP4-215ENST00000477375 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.23■■■□□ 2.11
IMP4-215ENST00000477375 FMN1Q68DA7 1419 aa28.23■■■□□ 2.11
IMP4-215ENST00000477375 KCNH8Q96L42 1107 aa28.2■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 HECW1Q76N89 1606 aa28.18■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.14■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
IMP4-215ENST00000477375 CEP162Q5TB80 1403 aa28.12■■■□□ 2.09
IMP4-215ENST00000477375 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.07■■■□□ 2.08
IMP4-215ENST00000477375 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.06■■■□□ 2.08
IMP4-215ENST00000477375 CD109Q6YHK3 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
IMP4-215ENST00000477375 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.03■■■□□ 2.08
IMP4-215ENST00000477375 KDM6BO15054 1643 aa28.03■■■□□ 2.08
IMP4-215ENST00000477375 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.99■■■□□ 2.07
IMP4-215ENST00000477375 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.98■■■□□ 2.07
IMP4-215ENST00000477375 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.96■■■□□ 2.07
IMP4-215ENST00000477375 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
IMP4-215ENST00000477375 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
IMP4-215ENST00000477375 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.94■■■□□ 2.06
IMP4-215ENST00000477375 KIF14Q15058 1648 aa27.92■■■□□ 2.06
IMP4-215ENST00000477375 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.91■■■□□ 2.06
IMP4-215ENST00000477375 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
IMP4-215ENST00000477375 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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IMP4-215ENST00000477375 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.75■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 NEO1Q92859 1461 aa27.75■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.75■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 PLCH2O75038 1416 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 FANCAO15360 1455 aa27.72■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.72■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.71■■■□□ 2.03
IMP4-215ENST00000477375 AKNAQ7Z591 1439 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 TIAM1Q13009 1591 aa27.67■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 PREX2Q70Z35 1606 aa27.67■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 RICTORQ6R327 1708 aa27.66■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 RAPGEF3O95398 923 aa27.64■■■□□ 2.02
IMP4-215ENST00000477375 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.63■■■□□ 2.01
IMP4-215ENST00000477375 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.62■■■□□ 2.01
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