RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476787.1

PQLC3-208, Transcript of PQ loop repeat containing 3, human

TSL 3

Gene PQLC3, Length 469 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC3-208	ENST00000476787	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PQLC3-208	ENST00000476787	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PQLC3-208	ENST00000476787	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PQLC3-208	ENST00000476787	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PQLC3-208	ENST00000476787	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PQLC3-208	ENST00000476787	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PQLC3-208	ENST00000476787	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PQLC3-208	ENST00000476787	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PQLC3-208	ENST00000476787	PTPRG	P23470	1445 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PQLC3-208	ENST00000476787	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PQLC3-208	ENST00000476787	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
PQLC3-208	ENST00000476787	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PQLC3-208	ENST00000476787	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PQLC3-208	ENST00000476787	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PQLC3-208	ENST00000476787	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PQLC3-208	ENST00000476787	EEA1	Q15075	1411 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PQLC3-208	ENST00000476787	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PQLC3-208	ENST00000476787	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PQLC3-208	ENST00000476787	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PQLC3-208	ENST00000476787	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PQLC3-208	ENST00000476787	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PQLC3-208	ENST00000476787	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PQLC3-208	ENST00000476787	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PQLC3-208	ENST00000476787	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PQLC3-208	ENST00000476787	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
PQLC3-208	ENST00000476787	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PQLC3-208	ENST00000476787	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PQLC3-208	ENST00000476787	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PQLC3-208	ENST00000476787	KIF21B	O75037	1637 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PQLC3-208	ENST00000476787	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PQLC3-208	ENST00000476787	ABCA8	O94911	1581 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PQLC3-208	ENST00000476787	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PQLC3-208	ENST00000476787	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PQLC3-208	ENST00000476787	GLI2	P10070	1586 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PQLC3-208	ENST00000476787	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PQLC3-208	ENST00000476787	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PQLC3-208	ENST00000476787	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PQLC3-208	ENST00000476787	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PQLC3-208	ENST00000476787	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PQLC3-208	ENST00000476787	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	KDM6B	O15054	1643 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PQLC3-208	ENST00000476787	ATP10B	O94823	1461 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PQLC3-208	ENST00000476787	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-208	ENST00000476787	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PQLC3-208	ENST00000476787	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PQLC3-208	ENST00000476787	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-208	ENST00000476787	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PQLC3-208	ENST00000476787	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PQLC3-208	ENST00000476787	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PQLC3-208	ENST00000476787	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PQLC3-208	ENST00000476787	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PQLC3-208	ENST00000476787	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PQLC3-208	ENST00000476787	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PQLC3-208	ENST00000476787	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PQLC3-208	ENST00000476787	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.66
PQLC3-208	ENST00000476787	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PQLC3-208	ENST00000476787	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PQLC3-208	ENST00000476787	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PQLC3-208	ENST00000476787	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PQLC3-208	ENST00000476787	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PQLC3-208	ENST00000476787	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PQLC3-208	ENST00000476787	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PQLC3-208	ENST00000476787	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PQLC3-208	ENST00000476787	NEO1	Q92859	1461 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PQLC3-208	ENST00000476787	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.46	■■■□□ 2.63
PQLC3-208	ENST00000476787	CLIP1	P30622	1438 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PQLC3-208	ENST00000476787	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PQLC3-208	ENST00000476787	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PQLC3-208	ENST00000476787	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PQLC3-208	ENST00000476787	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	FANCA	O15360	1455 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PQLC3-208	ENST00000476787	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	KIF14	Q15058	1648 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	PLCH2	O75038	1416 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PQLC3-208	ENST00000476787	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PQLC3-208	ENST00000476787	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PQLC3-208	ENST00000476787	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PQLC3-208	ENST00000476787	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PQLC3-208	ENST00000476787	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PQLC3-208	ENST00000476787	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PQLC3-208	ENST00000476787	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PQLC3-208	ENST00000476787	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.11	■■■□□ 2.57

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