RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 GRIN2AQ12879 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
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ATG4B-217ENST00000475693 CEP170Q5SW79 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
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ATG4B-217ENST00000475693 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.31■■□□□ 1.96
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ATG4B-217ENST00000475693 PTPRKQ15262 1439 aa27.28■■□□□ 1.96
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ATG4B-217ENST00000475693 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.26■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ATG4B-217ENST00000475693 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.23■■□□□ 1.95
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