RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.85■■■□□ 2.05
ATG4B-216ENST00000475195 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.8■■■□□ 2.04
ATG4B-216ENST00000475195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.8■■■□□ 2.04
ATG4B-216ENST00000475195 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.78■■■□□ 2.04
ATG4B-216ENST00000475195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.04
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ATG4B-216ENST00000475195 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.69■■■□□ 2.02
ATG4B-216ENST00000475195 EEA1Q15075 1411 aa27.67■■■□□ 2.02
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ATG4B-216ENST00000475195 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.51■■□□□ 1.99
ATG4B-216ENST00000475195 DISP1Q96F81 1524 aa27.48■■□□□ 1.99
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ATG4B-216ENST00000475195 KIF21BO75037 1637 aa27.35■■□□□ 1.97
ATG4B-216ENST00000475195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ATG4B-216ENST00000475195 KIAA0556O60303 1618 aa27.34■■□□□ 1.97
ATG4B-216ENST00000475195 GOLGA3Q08378 1498 aa27.33■■□□□ 1.97
ATG4B-216ENST00000475195 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.33■■□□□ 1.97
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ATG4B-216ENST00000475195 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ATG4B-216ENST00000475195 MAPKBP1O60336 1514 aa27.21■■□□□ 1.95
ATG4B-216ENST00000475195 ABCC2Q92887 1545 aa27.19■■□□□ 1.94
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ATG4B-216ENST00000475195 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.13■■□□□ 1.93
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ATG4B-216ENST00000475195 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.11■■□□□ 1.93
ATG4B-216ENST00000475195 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.11■■□□□ 1.93
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ATG4B-216ENST00000475195 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.07■■□□□ 1.92
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ATG4B-216ENST00000475195 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.02■■□□□ 1.92
ATG4B-216ENST00000475195 ASXL2Q76L83 1435 aa27.01■■□□□ 1.91
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ATG4B-216ENST00000475195 DIP2BQ9P265 1576 aa27.01■■□□□ 1.91
ATG4B-216ENST00000475195 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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ATG4B-216ENST00000475195 ATP10BO94823 1461 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-216ENST00000475195 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.9■■□□□ 1.9
ATG4B-216ENST00000475195 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
ATG4B-216ENST00000475195 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.86■■□□□ 1.89
ATG4B-216ENST00000475195 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ATG4B-216ENST00000475195 FMN1Q68DA7 1419 aa26.79■■□□□ 1.88
ATG4B-216ENST00000475195 ARID3CA6NKF2 412 aa26.76■■□□□ 1.87
ATG4B-216ENST00000475195 KCNH8Q96L42 1107 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG4B-216ENST00000475195 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.74■■□□□ 1.87
ATG4B-216ENST00000475195 TSPOAP1O95153 1857 aa26.73■■□□□ 1.87
ATG4B-216ENST00000475195 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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ATG4B-216ENST00000475195 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG4B-216ENST00000475195 CD109Q6YHK3 1445 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG4B-216ENST00000475195 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.63■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.62■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 HECW1Q76N89 1606 aa26.61■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.59■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.59■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ATG4B-216ENST00000475195 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ATG4B-216ENST00000475195 KDM6BO15054 1643 aa26.57■■□□□ 1.84
ATG4B-216ENST00000475195 CEP162Q5TB80 1403 aa26.54■■□□□ 1.84
ATG4B-216ENST00000475195 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ATG4B-216ENST00000475195 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
ATG4B-216ENST00000475195 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.51■■□□□ 1.83
ATG4B-216ENST00000475195 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ATG4B-216ENST00000475195 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.49■■□□□ 1.83
ATG4B-216ENST00000475195 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.46■■□□□ 1.83
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ATG4B-216ENST00000475195 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.46■■□□□ 1.83
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ATG4B-216ENST00000475195 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.41■■□□□ 1.82
ATG4B-216ENST00000475195 NEO1Q92859 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
ATG4B-216ENST00000475195 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.37■■□□□ 1.81
ATG4B-216ENST00000475195 PLCH2O75038 1416 aa26.35■■□□□ 1.81
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ATG4B-216ENST00000475195 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.25■■□□□ 1.79
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ATG4B-216ENST00000475195 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.23■■□□□ 1.79
ATG4B-216ENST00000475195 RAPGEF3O95398 923 aa26.23■■□□□ 1.79
ATG4B-216ENST00000475195 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ATG4B-216ENST00000475195 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.16■■□□□ 1.78
ATG4B-216ENST00000475195 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.16■■□□□ 1.78
ATG4B-216ENST00000475195 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.16■■□□□ 1.78
ATG4B-216ENST00000475195 ADGRL1O94910 1474 aa26.14■■□□□ 1.78
ATG4B-216ENST00000475195 RICTORQ6R327 1708 aa26.14■■□□□ 1.77
ATG4B-216ENST00000475195 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.14■■□□□ 1.77
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