RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.32■□□□□ 0.68
NISCH-206ENST00000474188 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.23■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 KIF27Q86VH2 1401 aa19.22■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-206ENST00000474188 MAPKBP1O60336 1514 aa19.19■□□□□ 0.66
NISCH-206ENST00000474188 DIP2BQ9P265 1576 aa19.18■□□□□ 0.66
NISCH-206ENST00000474188 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.16■□□□□ 0.66
NISCH-206ENST00000474188 CUL7Q14999 1698 aa19.14■□□□□ 0.66
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NISCH-206ENST00000474188 ABCC2Q92887 1545 aa19.01■□□□□ 0.63
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NISCH-206ENST00000474188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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NISCH-206ENST00000474188 CD109Q6YHK3 1445 aa18.65■□□□□ 0.58
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NISCH-206ENST00000474188 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.64■□□□□ 0.58
NISCH-206ENST00000474188 ATP10BO94823 1461 aa18.63■□□□□ 0.57
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NISCH-206ENST00000474188 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-206ENST00000474188 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-206ENST00000474188 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-206ENST00000474188 NEO1Q92859 1461 aa18.36■□□□□ 0.53
NISCH-206ENST00000474188 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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NISCH-206ENST00000474188 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-206ENST00000474188 PTPRMP28827 1452 aa18.33■□□□□ 0.53
NISCH-206ENST00000474188 EEA1Q15075 1411 aa18.33■□□□□ 0.53
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NISCH-206ENST00000474188 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 AKNAQ7Z591 1439 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-206ENST00000474188 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.27■□□□□ 0.52
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NISCH-206ENST00000474188 RICTORQ6R327 1708 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-206ENST00000474188 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.25■□□□□ 0.51
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NISCH-206ENST00000474188 FANCAO15360 1455 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-206ENST00000474188 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-206ENST00000474188 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NISCH-206ENST00000474188 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-206ENST00000474188 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-206ENST00000474188 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NISCH-206ENST00000474188 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
NISCH-206ENST00000474188 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.15■□□□□ 0.5
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NISCH-206ENST00000474188 HSPA2P54652 639 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-206ENST00000474188 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-206ENST00000474188 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.13■□□□□ 0.49
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