RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473188.5

FRMD4B-209, Transcript of FERM domain containing 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FRMD4B, Length 923 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4B-209ENST00000473188 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.72■■■■■ 4.27
FRMD4B-209ENST00000473188 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
FRMD4B-209ENST00000473188 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.71■■■■■ 4.27
FRMD4B-209ENST00000473188 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.59■■■■■ 4.25
FRMD4B-209ENST00000473188 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.37■■■■■ 4.21
FRMD4B-209ENST00000473188 IQGAP2Q13576 1575 aa41.28■■■■■ 4.2
FRMD4B-209ENST00000473188 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.18■■■■■ 4.18
FRMD4B-209ENST00000473188 PTPRGP23470 1445 aa41.14■■■■■ 4.18
FRMD4B-209ENST00000473188 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
FRMD4B-209ENST00000473188 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.12■■■■■ 4.17
FRMD4B-209ENST00000473188 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
FRMD4B-209ENST00000473188 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.1■■■■■ 4.17
FRMD4B-209ENST00000473188 PRXQ9BXM0 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
FRMD4B-209ENST00000473188 DISP1Q96F81 1524 aa41.04■■■■■ 4.16
FRMD4B-209ENST00000473188 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.03■■■■■ 4.16
FRMD4B-209ENST00000473188 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.97■■■■■ 4.15
FRMD4B-209ENST00000473188 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.96■■■■■ 4.15
FRMD4B-209ENST00000473188 MAPKBP1O60336 1514 aa40.93■■■■■ 4.14
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.92■■■■■ 4.14
FRMD4B-209ENST00000473188 KIAA0556O60303 1618 aa40.89■■■■■ 4.14
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.85■■■■■ 4.13
FRMD4B-209ENST00000473188 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.85■■■■■ 4.13
FRMD4B-209ENST00000473188 EEA1Q15075 1411 aa40.83■■■■■ 4.13
FRMD4B-209ENST00000473188 UACAQ9BZF9 1416 aa40.83■■■■■ 4.13
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCC2Q92887 1545 aa40.81■■■■■ 4.12
FRMD4B-209ENST00000473188 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.79■■■■■ 4.12
FRMD4B-209ENST00000473188 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
FRMD4B-209ENST00000473188 GOLGA3Q08378 1498 aa40.77■■■■■ 4.12
FRMD4B-209ENST00000473188 DIP2BQ9P265 1576 aa40.75■■■■■ 4.11
FRMD4B-209ENST00000473188 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.74■■■■■ 4.11
FRMD4B-209ENST00000473188 ASXL2Q76L83 1435 aa40.63■■■■■ 4.09
FRMD4B-209ENST00000473188 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.61■■■■■ 4.09
FRMD4B-209ENST00000473188 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.59■■■■■ 4.09
FRMD4B-209ENST00000473188 P3H3Q8IVL6 736 aa40.56■■■■■ 4.08
FRMD4B-209ENST00000473188 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
FRMD4B-209ENST00000473188 TSPOAP1O95153 1857 aa40.49■■■■■ 4.07
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA8O94911 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF21BO75037 1637 aa40.46■■■■■ 4.07
FRMD4B-209ENST00000473188 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
FRMD4B-209ENST00000473188 SAMD9Q5K651 1589 aa40.42■■■■■ 4.06
FRMD4B-209ENST00000473188 GLI2P10070 1586 aa40.41■■■■■ 4.06
FRMD4B-209ENST00000473188 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
FRMD4B-209ENST00000473188 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.34■■■■■ 4.05
FRMD4B-209ENST00000473188 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.32■■■■■ 4.04
FRMD4B-209ENST00000473188 ARID3CA6NKF2 412 aa40.27■■■■■ 4.04
FRMD4B-209ENST00000473188 KDM6BO15054 1643 aa40.25■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.23■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.21■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 KCNH8Q96L42 1107 aa40.21■■■■■ 4.03
FRMD4B-209ENST00000473188 ATP10BO94823 1461 aa40.19■■■■■ 4.02
FRMD4B-209ENST00000473188 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.16■■■■■ 4.02
FRMD4B-209ENST00000473188 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.13■■■■■ 4.01
FRMD4B-209ENST00000473188 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.07■■■■■ 4.01
FRMD4B-209ENST00000473188 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FRMD4B-209ENST00000473188 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
FRMD4B-209ENST00000473188 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
FRMD4B-209ENST00000473188 CD109Q6YHK3 1445 aa40.03■■■■■ 4
FRMD4B-209ENST00000473188 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
FRMD4B-209ENST00000473188 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40■■■■□ 3.99
FRMD4B-209ENST00000473188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
FRMD4B-209ENST00000473188 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.94■■■■□ 3.98
FRMD4B-209ENST00000473188 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.9■■■■□ 3.98
FRMD4B-209ENST00000473188 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.82■■■■□ 3.96
FRMD4B-209ENST00000473188 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.81■■■■□ 3.96
FRMD4B-209ENST00000473188 FMN1Q68DA7 1419 aa39.8■■■■□ 3.96
FRMD4B-209ENST00000473188 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
FRMD4B-209ENST00000473188 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
FRMD4B-209ENST00000473188 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.66■■■■□ 3.94
FRMD4B-209ENST00000473188 HECW1Q76N89 1606 aa39.65■■■■□ 3.94
FRMD4B-209ENST00000473188 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.61■■■■□ 3.93
FRMD4B-209ENST00000473188 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.59■■■■□ 3.93
FRMD4B-209ENST00000473188 NEO1Q92859 1461 aa39.56■■■■□ 3.92
FRMD4B-209ENST00000473188 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.56■■■■□ 3.922e-31■■■■■ 281
FRMD4B-209ENST00000473188 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
FRMD4B-209ENST00000473188 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.5■■■■□ 3.91
FRMD4B-209ENST00000473188 CLIP1P30622 1438 aa39.49■■■■□ 3.91
FRMD4B-209ENST00000473188 RAPGEF3O95398 923 aa39.47■■■■□ 3.91
FRMD4B-209ENST00000473188 ADGRL1O94910 1474 aa39.45■■■■□ 3.91
FRMD4B-209ENST00000473188 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.43■■■■□ 3.9
FRMD4B-209ENST00000473188 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.43■■■■□ 3.9
FRMD4B-209ENST00000473188 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
FRMD4B-209ENST00000473188 FANCAO15360 1455 aa39.42■■■■□ 3.9
FRMD4B-209ENST00000473188 AKNAQ7Z591 1439 aa39.39■■■■□ 3.9
FRMD4B-209ENST00000473188 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
FRMD4B-209ENST00000473188 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.35■■■■□ 3.89
FRMD4B-209ENST00000473188 KIF14Q15058 1648 aa39.32■■■■□ 3.89
FRMD4B-209ENST00000473188 PLCH2O75038 1416 aa39.32■■■■□ 3.89
FRMD4B-209ENST00000473188 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.32■■■■□ 3.88
FRMD4B-209ENST00000473188 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.31■■■■□ 3.88
FRMD4B-209ENST00000473188 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
FRMD4B-209ENST00000473188 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.29■■■■□ 3.88
FRMD4B-209ENST00000473188 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.24■■■■□ 3.87
FRMD4B-209ENST00000473188 RICTORQ6R327 1708 aa39.23■■■■□ 3.87
FRMD4B-209ENST00000473188 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.21■■■■□ 3.87
FRMD4B-209ENST00000473188 CEP162Q5TB80 1403 aa39.18■■■■□ 3.86
FRMD4B-209ENST00000473188 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.16■■■■□ 3.86
FRMD4B-209ENST00000473188 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.13■■■■□ 3.85
FRMD4B-209ENST00000473188 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms