RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473172.5

ACSS2-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 2, human

TSL 3

Gene ACSS2, Length 665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS2-208	ENST00000473172	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ACSS2-208	ENST00000473172	CUL7	Q14999	1698 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ACSS2-208	ENST00000473172	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.81	■■■■□ 3
ACSS2-208	ENST00000473172	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.78	■■■■□ 3
ACSS2-208	ENST00000473172	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
ACSS2-208	ENST00000473172	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ACSS2-208	ENST00000473172	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
ACSS2-208	ENST00000473172	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ACSS2-208	ENST00000473172	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.58	■■■□□ 2.97
ACSS2-208	ENST00000473172	PTPRG	P23470	1445 aa		33.53	■■■□□ 2.96
ACSS2-208	ENST00000473172	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ACSS2-208	ENST00000473172	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ACSS2-208	ENST00000473172	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.39	■■■□□ 2.94
ACSS2-208	ENST00000473172	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ACSS2-208	ENST00000473172	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ACSS2-208	ENST00000473172	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ACSS2-208	ENST00000473172	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ACSS2-208	ENST00000473172	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ACSS2-208	ENST00000473172	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ACSS2-208	ENST00000473172	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ACSS2-208	ENST00000473172	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ACSS2-208	ENST00000473172	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ACSS2-208	ENST00000473172	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ACSS2-208	ENST00000473172	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ACSS2-208	ENST00000473172	KDM6B	O15054	1643 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ACSS2-208	ENST00000473172	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ACSS2-208	ENST00000473172	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.07	■■■□□ 2.89
ACSS2-208	ENST00000473172	GLI2	P10070	1586 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ACSS2-208	ENST00000473172	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
ACSS2-208	ENST00000473172	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.01	■■■□□ 2.88
ACSS2-208	ENST00000473172	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
ACSS2-208	ENST00000473172	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ACSS2-208	ENST00000473172	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
ACSS2-208	ENST00000473172	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ACSS2-208	ENST00000473172	ABCA8	O94911	1581 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	EEA1	Q15075	1411 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ACSS2-208	ENST00000473172	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ACSS2-208	ENST00000473172	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ACSS2-208	ENST00000473172	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
ACSS2-208	ENST00000473172	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ACSS2-208	ENST00000473172	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
ACSS2-208	ENST00000473172	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ACSS2-208	ENST00000473172	ATP10B	O94823	1461 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ACSS2-208	ENST00000473172	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ACSS2-208	ENST00000473172	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ACSS2-208	ENST00000473172	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.61	■■■□□ 2.81
ACSS2-208	ENST00000473172	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
ACSS2-208	ENST00000473172	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
ACSS2-208	ENST00000473172	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ACSS2-208	ENST00000473172	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ACSS2-208	ENST00000473172	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ACSS2-208	ENST00000473172	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ACSS2-208	ENST00000473172	KIF21B	O75037	1637 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ACSS2-208	ENST00000473172	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
ACSS2-208	ENST00000473172	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ACSS2-208	ENST00000473172	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ACSS2-208	ENST00000473172	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ACSS2-208	ENST00000473172	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ACSS2-208	ENST00000473172	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ACSS2-208	ENST00000473172	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ACSS2-208	ENST00000473172	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ACSS2-208	ENST00000473172	NEO1	Q92859	1461 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ACSS2-208	ENST00000473172	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
ACSS2-208	ENST00000473172	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ACSS2-208	ENST00000473172	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.13	■■■□□ 2.73
ACSS2-208	ENST00000473172	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ACSS2-208	ENST00000473172	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ACSS2-208	ENST00000473172	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ACSS2-208	ENST00000473172	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ACSS2-208	ENST00000473172	FANCA	O15360	1455 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ACSS2-208	ENST00000473172	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ACSS2-208	ENST00000473172	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ACSS2-208	ENST00000473172	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ACSS2-208	ENST00000473172	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
ACSS2-208	ENST00000473172	HECW1	Q76N89	1606 aa		32	■■■□□ 2.71
ACSS2-208	ENST00000473172	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ACSS2-208	ENST00000473172	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ACSS2-208	ENST00000473172	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
ACSS2-208	ENST00000473172	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.95	■■■□□ 2.7
ACSS2-208	ENST00000473172	PLCH2	O75038	1416 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ACSS2-208	ENST00000473172	PTPRM	P28827	1452 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ACSS2-208	ENST00000473172	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ACSS2-208	ENST00000473172	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.89	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	KIF14	Q15058	1648 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ACSS2-208	ENST00000473172	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.82	■■■□□ 2.69

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