RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472351.5

SZRD1-204, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-204ENST00000472351 CUL7Q14999 1698 aa25.05■■□□□ 1.6
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SZRD1-204ENST00000472351 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.92■■□□□ 1.58
SZRD1-204ENST00000472351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.88■■□□□ 1.57
SZRD1-204ENST00000472351 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.86■■□□□ 1.57
SZRD1-204ENST00000472351 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
SZRD1-204ENST00000472351 MAPKBP1O60336 1514 aa24.82■■□□□ 1.56
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SZRD1-204ENST00000472351 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.74■■□□□ 1.55
SZRD1-204ENST00000472351 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
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SZRD1-204ENST00000472351 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SZRD1-204ENST00000472351 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.67■■□□□ 1.54
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SZRD1-204ENST00000472351 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.23■■□□□ 1.47
SZRD1-204ENST00000472351 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
SZRD1-204ENST00000472351 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.2■■□□□ 1.46
SZRD1-204ENST00000472351 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.18■■□□□ 1.46
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SZRD1-204ENST00000472351 SAMD9Q5K651 1589 aa24.15■■□□□ 1.46
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SZRD1-204ENST00000472351 CD109Q6YHK3 1445 aa24.13■■□□□ 1.45
SZRD1-204ENST00000472351 KCNH8Q96L42 1107 aa24.13■■□□□ 1.45
SZRD1-204ENST00000472351 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.12■■□□□ 1.45
SZRD1-204ENST00000472351 ADGRL1O94910 1474 aa24.08■■□□□ 1.45
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SZRD1-204ENST00000472351 ARID3CA6NKF2 412 aa24.07■■□□□ 1.44
SZRD1-204ENST00000472351 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.06■■□□□ 1.44
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SZRD1-204ENST00000472351 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SZRD1-204ENST00000472351 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.93■■□□□ 1.42
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SZRD1-204ENST00000472351 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.87■■□□□ 1.41
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SZRD1-204ENST00000472351 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.76■■□□□ 1.39
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SZRD1-204ENST00000472351 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.75■■□□□ 1.39
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SZRD1-204ENST00000472351 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.72■■□□□ 1.39
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SZRD1-204ENST00000472351 PLCH2O75038 1416 aa23.57■■□□□ 1.36
SZRD1-204ENST00000472351 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.55■■□□□ 1.36
SZRD1-204ENST00000472351 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SZRD1-204ENST00000472351 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.54■■□□□ 1.36
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SZRD1-204ENST00000472351 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.52■■□□□ 1.36
SZRD1-204ENST00000472351 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.5■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.5■■□□□ 1.35
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