RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.63■■■□□ 2.97
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.6■■■□□ 2.97
CTPS1-206ENST00000470271 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
CTPS1-206ENST00000470271 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.56■■■□□ 2.96
CTPS1-206ENST00000470271 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.42■■■□□ 2.94
CTPS1-206ENST00000470271 PRXQ9BXM0 1461 aa33.4■■■□□ 2.94
CTPS1-206ENST00000470271 IQGAP2Q13576 1575 aa33.38■■■□□ 2.93
CTPS1-206ENST00000470271 EEA1Q15075 1411 aa33.36■■■□□ 2.93
CTPS1-206ENST00000470271 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.36■■■□□ 2.93
CTPS1-206ENST00000470271 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.26■■■□□ 2.91
CTPS1-206ENST00000470271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.23■■■□□ 2.91
CTPS1-206ENST00000470271 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
CTPS1-206ENST00000470271 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.21■■■□□ 2.91
CTPS1-206ENST00000470271 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
CTPS1-206ENST00000470271 DISP1Q96F81 1524 aa33.17■■■□□ 2.9
CTPS1-206ENST00000470271 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.16■■■□□ 2.9
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRGP23470 1445 aa33.15■■■□□ 2.9
CTPS1-206ENST00000470271 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0556O60303 1618 aa33.06■■■□□ 2.88
CTPS1-206ENST00000470271 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.06■■■□□ 2.88
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA3Q08378 1498 aa33.02■■■□□ 2.88
CTPS1-206ENST00000470271 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.02■■■□□ 2.88
CTPS1-206ENST00000470271 KIF21BO75037 1637 aa33.01■■■□□ 2.87
CTPS1-206ENST00000470271 UACAQ9BZF9 1416 aa32.92■■■□□ 2.86
CTPS1-206ENST00000470271 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.89■■■□□ 2.86
CTPS1-206ENST00000470271 MAPKBP1O60336 1514 aa32.88■■■□□ 2.85
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC2Q92887 1545 aa32.86■■■□□ 2.85
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD9Q5K651 1589 aa32.8■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 P3H3Q8IVL6 736 aa32.8■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.8■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.77■■■□□ 2.84
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.75■■■□□ 2.83
CTPS1-206ENST00000470271 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.75■■■□□ 2.83
CTPS1-206ENST00000470271 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.73■■■□□ 2.83
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA8O94911 1581 aa32.71■■■□□ 2.83
CTPS1-206ENST00000470271 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.71■■■□□ 2.83
CTPS1-206ENST00000470271 DIP2BQ9P265 1576 aa32.68■■■□□ 2.82
CTPS1-206ENST00000470271 ASXL2Q76L83 1435 aa32.67■■■□□ 2.82
CTPS1-206ENST00000470271 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
CTPS1-206ENST00000470271 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.64■■■□□ 2.82
CTPS1-206ENST00000470271 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.61■■■□□ 2.81
CTPS1-206ENST00000470271 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.52■■■□□ 2.8
CTPS1-206ENST00000470271 GLI2P10070 1586 aa32.49■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.48■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 ARID3CA6NKF2 412 aa32.47■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 ATP10BO94823 1461 aa32.46■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.46■■■□□ 2.79
CTPS1-206ENST00000470271 TSPOAP1O95153 1857 aa32.44■■■□□ 2.78
CTPS1-206ENST00000470271 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CTPS1-206ENST00000470271 FMN1Q68DA7 1419 aa32.35■■■□□ 2.77
CTPS1-206ENST00000470271 KCNH8Q96L42 1107 aa32.35■■■□□ 2.77
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.33■■■□□ 2.77
CTPS1-206ENST00000470271 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CTPS1-206ENST00000470271 CLIP1P30622 1438 aa32.23■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.22■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 CD109Q6YHK3 1445 aa32.21■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 KDM6BO15054 1643 aa32.21■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.21■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 HECW1Q76N89 1606 aa32.2■■■□□ 2.75
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.19■■■□□ 2.74
CTPS1-206ENST00000470271 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CTPS1-206ENST00000470271 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.15■■■□□ 2.74
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.12■■■□□ 2.73
CTPS1-206ENST00000470271 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.08■■■□□ 2.73
CTPS1-206ENST00000470271 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.07■■■□□ 2.72
CTPS1-206ENST00000470271 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CTPS1-206ENST00000470271 CEP162Q5TB80 1403 aa32.05■■■□□ 2.72
CTPS1-206ENST00000470271 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CTPS1-206ENST00000470271 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
CTPS1-206ENST00000470271 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32■■■□□ 2.71
CTPS1-206ENST00000470271 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.99■■■□□ 2.71
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.97■■■□□ 2.71
CTPS1-206ENST00000470271 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.71
CTPS1-206ENST00000470271 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
CTPS1-206ENST00000470271 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.91■■■□□ 2.7
CTPS1-206ENST00000470271 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.91■■■□□ 2.7
CTPS1-206ENST00000470271 NEO1Q92859 1461 aa31.89■■■□□ 2.7
CTPS1-206ENST00000470271 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.87■■■□□ 2.69
CTPS1-206ENST00000470271 KIF14Q15058 1648 aa31.85■■■□□ 2.69
CTPS1-206ENST00000470271 FANCAO15360 1455 aa31.8■■■□□ 2.68
CTPS1-206ENST00000470271 PLCH2O75038 1416 aa31.79■■■□□ 2.68
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.77■■■□□ 2.68
CTPS1-206ENST00000470271 AKNAQ7Z591 1439 aa31.75■■■□□ 2.67
CTPS1-206ENST00000470271 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.75■■■□□ 2.67
CTPS1-206ENST00000470271 RAPGEF3O95398 923 aa31.71■■■□□ 2.67
CTPS1-206ENST00000470271 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.68■■■□□ 2.66
CTPS1-206ENST00000470271 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.67■■■□□ 2.66
CTPS1-206ENST00000470271 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CTPS1-206ENST00000470271 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.64■■■□□ 2.66
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.64■■■□□ 2.66
CTPS1-206ENST00000470271 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.64■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRL1O94910 1474 aa31.62■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 RICTORQ6R327 1708 aa31.6■■■□□ 2.65
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