RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469804.1

KPNA4-202, Transcript of karyopherin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene KPNA4, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4-202ENST00000469804 PRXQ9BXM0 1461 aa42.51■■■■■ 4.4
KPNA4-202ENST00000469804 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
KPNA4-202ENST00000469804 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.48■■■■■ 4.39
KPNA4-202ENST00000469804 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.47■■■■■ 4.39
KPNA4-202ENST00000469804 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.46■■■■■ 4.39
KPNA4-202ENST00000469804 ARAP1Q96P48 1450 aa42.43■■■■■ 4.38
KPNA4-202ENST00000469804 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.36■■■■■ 4.37
KPNA4-202ENST00000469804 IQGAP2Q13576 1575 aa42.34■■■■■ 4.37
KPNA4-202ENST00000469804 JPH4Q96JJ6 628 aa42.33■■■■■ 4.37
KPNA4-202ENST00000469804 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
KPNA4-202ENST00000469804 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.26■■■■■ 4.36
KPNA4-202ENST00000469804 KIF21BO75037 1637 aa42.23■■■■■ 4.35
KPNA4-202ENST00000469804 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.07■■■■■ 4.33
KPNA4-202ENST00000469804 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.01■■■■■ 4.32
KPNA4-202ENST00000469804 DISP1Q96F81 1524 aa42■■■■■ 4.31
KPNA4-202ENST00000469804 KIAA0556O60303 1618 aa41.96■■■■■ 4.31
KPNA4-202ENST00000469804 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.95■■■■■ 4.31
KPNA4-202ENST00000469804 GOLGA3Q08378 1498 aa41.93■■■■■ 4.3
KPNA4-202ENST00000469804 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
KPNA4-202ENST00000469804 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.83■■■■■ 4.29
KPNA4-202ENST00000469804 PTPRGP23470 1445 aa41.78■■■■■ 4.28
KPNA4-202ENST00000469804 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
KPNA4-202ENST00000469804 SAMD9Q5K651 1589 aa41.76■■■■■ 4.27
KPNA4-202ENST00000469804 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.74■■■■■ 4.27
KPNA4-202ENST00000469804 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
KPNA4-202ENST00000469804 P3H3Q8IVL6 736 aa41.63■■■■■ 4.25
KPNA4-202ENST00000469804 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.54■■■■■ 4.24
KPNA4-202ENST00000469804 UACAQ9BZF9 1416 aa41.53■■■■■ 4.24
KPNA4-202ENST00000469804 ABCC2Q92887 1545 aa41.51■■■■■ 4.24
KPNA4-202ENST00000469804 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.5■■■■■ 4.23
KPNA4-202ENST00000469804 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.49■■■■■ 4.23
KPNA4-202ENST00000469804 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.47■■■■■ 4.23
KPNA4-202ENST00000469804 ABCA8O94911 1581 aa41.46■■■■■ 4.23
KPNA4-202ENST00000469804 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.41■■■■■ 4.22
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KPNA4-202ENST00000469804 MAPKBP1O60336 1514 aa41.34■■■■■ 4.21
KPNA4-202ENST00000469804 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
KPNA4-202ENST00000469804 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.31■■■■■ 4.2
KPNA4-202ENST00000469804 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.3■■■■■ 4.2
KPNA4-202ENST00000469804 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.26■■■■■ 4.2
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KPNA4-202ENST00000469804 CLIP1P30622 1438 aa41.18■■■■■ 4.18
KPNA4-202ENST00000469804 ASXL2Q76L83 1435 aa41.16■■■■■ 4.18
KPNA4-202ENST00000469804 ARID3CA6NKF2 412 aa41.15■■■■■ 4.18
KPNA4-202ENST00000469804 DIP2BQ9P265 1576 aa41.15■■■■■ 4.18
KPNA4-202ENST00000469804 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
KPNA4-202ENST00000469804 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.1■■■■■ 4.17
KPNA4-202ENST00000469804 FMN1Q68DA7 1419 aa41.09■■■■■ 4.17
KPNA4-202ENST00000469804 CEP162Q5TB80 1403 aa41.08■■■■■ 4.17
KPNA4-202ENST00000469804 ATP10BO94823 1461 aa41.07■■■■■ 4.16
KPNA4-202ENST00000469804 HECW1Q76N89 1606 aa41■■■■■ 4.15
KPNA4-202ENST00000469804 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.98■■■■■ 4.15
KPNA4-202ENST00000469804 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.98■■■■■ 4.15
KPNA4-202ENST00000469804 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
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KPNA4-202ENST00000469804 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
KPNA4-202ENST00000469804 TSPOAP1O95153 1857 aa40.9■■■■■ 4.14
KPNA4-202ENST00000469804 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
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KPNA4-202ENST00000469804 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
KPNA4-202ENST00000469804 GLI2P10070 1586 aa40.88■■■■■ 4.13
KPNA4-202ENST00000469804 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.83■■■■■ 4.13
KPNA4-202ENST00000469804 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.78■■■■■ 4.12
KPNA4-202ENST00000469804 KCNH8Q96L42 1107 aa40.78■■■■■ 4.12
KPNA4-202ENST00000469804 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
KPNA4-202ENST00000469804 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
KPNA4-202ENST00000469804 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.69■■■■■ 4.1
KPNA4-202ENST00000469804 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.64■■■■■ 4.1
KPNA4-202ENST00000469804 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.64■■■■■ 4.1
KPNA4-202ENST00000469804 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.63■■■■■ 4.09
KPNA4-202ENST00000469804 CD109Q6YHK3 1445 aa40.54■■■■■ 4.08
KPNA4-202ENST00000469804 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.54■■■■■ 4.08
KPNA4-202ENST00000469804 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.52■■■■■ 4.08
KPNA4-202ENST00000469804 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.52■■■■■ 4.08
KPNA4-202ENST00000469804 KIF14Q15058 1648 aa40.51■■■■■ 4.08
KPNA4-202ENST00000469804 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.082e-9■■□□□ 12.5
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KPNA4-202ENST00000469804 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
KPNA4-202ENST00000469804 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.45■■■■■ 4.07
KPNA4-202ENST00000469804 KDM6BO15054 1643 aa40.42■■■■■ 4.06
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KPNA4-202ENST00000469804 TIAM1Q13009 1591 aa40.31■■■■■ 4.04
KPNA4-202ENST00000469804 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
KPNA4-202ENST00000469804 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.24■■■■■ 4.03
KPNA4-202ENST00000469804 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.23■■■■■ 4.03
KPNA4-202ENST00000469804 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.19■■■■■ 4.02
KPNA4-202ENST00000469804 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
KPNA4-202ENST00000469804 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.18■■■■■ 4.02
KPNA4-202ENST00000469804 NEO1Q92859 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
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KPNA4-202ENST00000469804 MAP3K1Q13233 1512 aa40.12■■■■■ 4.01
KPNA4-202ENST00000469804 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.11■■■■■ 4.01
KPNA4-202ENST00000469804 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.1■■■■■ 4.01
KPNA4-202ENST00000469804 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
KPNA4-202ENST00000469804 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.08■■■■■ 4.01
KPNA4-202ENST00000469804 AKNAQ7Z591 1439 aa40.08■■■■■ 4.01
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