RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468824.1

SLC25A1-204, Transcript of solute carrier family 25 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A1, Length 307 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1-204ENST00000468824 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.28■■■■■ 5.48
SLC25A1-204ENST00000468824 CUL7Q14999 1698 aa49.18■■■■■ 5.46
SLC25A1-204ENST00000468824 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.09■■■■■ 5.45
SLC25A1-204ENST00000468824 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.02■■■■■ 5.44
SLC25A1-204ENST00000468824 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.75■■■■■ 5.39
SLC25A1-204ENST00000468824 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.7■■■■■ 5.39
SLC25A1-204ENST00000468824 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.65■■■■■ 5.38
SLC25A1-204ENST00000468824 IQGAP2Q13576 1575 aa48.62■■■■■ 5.37
SLC25A1-204ENST00000468824 MAPKBP1O60336 1514 aa48.62■■■■■ 5.37
SLC25A1-204ENST00000468824 PTPRGP23470 1445 aa48.6■■■■■ 5.37
SLC25A1-204ENST00000468824 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.59■■■■■ 5.37
SLC25A1-204ENST00000468824 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.58■■■■■ 5.37
SLC25A1-204ENST00000468824 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.56■■■■■ 5.36
SLC25A1-204ENST00000468824 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.53■■■■■ 5.36
SLC25A1-204ENST00000468824 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.53■■■■■ 5.36
SLC25A1-204ENST00000468824 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.51■■■■■ 5.36
SLC25A1-204ENST00000468824 DIP2BQ9P265 1576 aa48.42■■■■■ 5.34
SLC25A1-204ENST00000468824 DISP1Q96F81 1524 aa48.39■■■■■ 5.34
SLC25A1-204ENST00000468824 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.33■■■■■ 5.33
SLC25A1-204ENST00000468824 ABCC2Q92887 1545 aa48.3■■■■■ 5.32
SLC25A1-204ENST00000468824 UACAQ9BZF9 1416 aa48.24■■■■■ 5.31
SLC25A1-204ENST00000468824 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.23■■■■■ 5.31
SLC25A1-204ENST00000468824 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
SLC25A1-204ENST00000468824 KIAA0556O60303 1618 aa48.18■■■■■ 5.3
SLC25A1-204ENST00000468824 PRXQ9BXM0 1461 aa48.14■■■■■ 5.3
SLC25A1-204ENST00000468824 ASXL2Q76L83 1435 aa48.12■■■■■ 5.29
SLC25A1-204ENST00000468824 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.11■■■■■ 5.29
SLC25A1-204ENST00000468824 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.09■■■■■ 5.29
SLC25A1-204ENST00000468824 TSPOAP1O95153 1857 aa48.03■■■■■ 5.28
SLC25A1-204ENST00000468824 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.02■■■■■ 5.28
SLC25A1-204ENST00000468824 GOLGA3Q08378 1498 aa47.97■■■■■ 5.27
SLC25A1-204ENST00000468824 KDM6BO15054 1643 aa47.94■■■■■ 5.26
SLC25A1-204ENST00000468824 GLI2P10070 1586 aa47.93■■■■■ 5.26
SLC25A1-204ENST00000468824 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
SLC25A1-204ENST00000468824 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.84■■■■■ 5.25
SLC25A1-204ENST00000468824 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
SLC25A1-204ENST00000468824 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
SLC25A1-204ENST00000468824 ABCA8O94911 1581 aa47.73■■■■■ 5.23
SLC25A1-204ENST00000468824 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.68■■■■■ 5.22
SLC25A1-204ENST00000468824 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.67■■■■■ 5.22
SLC25A1-204ENST00000468824 EEA1Q15075 1411 aa47.66■■■■■ 5.22
SLC25A1-204ENST00000468824 P3H3Q8IVL6 736 aa47.59■■■■■ 5.21
SLC25A1-204ENST00000468824 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
SLC25A1-204ENST00000468824 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.56■■■■■ 5.2
SLC25A1-204ENST00000468824 SAMD9Q5K651 1589 aa47.47■■■■■ 5.19
SLC25A1-204ENST00000468824 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
SLC25A1-204ENST00000468824 KCNH8Q96L42 1107 aa47.46■■■■■ 5.19
SLC25A1-204ENST00000468824 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.4■■■■■ 5.18
SLC25A1-204ENST00000468824 ARID3CA6NKF2 412 aa47.39■■■■■ 5.18
SLC25A1-204ENST00000468824 CD109Q6YHK3 1445 aa47.38■■■■■ 5.17
SLC25A1-204ENST00000468824 ATP10BO94823 1461 aa47.36■■■■■ 5.17
SLC25A1-204ENST00000468824 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.34■■■■■ 5.17
SLC25A1-204ENST00000468824 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.32■■■■■ 5.17
SLC25A1-204ENST00000468824 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.31■■■■■ 5.16
SLC25A1-204ENST00000468824 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.25■■■■■ 5.15
SLC25A1-204ENST00000468824 KIF21BO75037 1637 aa47.24■■■■■ 5.15
SLC25A1-204ENST00000468824 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.2■■■■■ 5.15
SLC25A1-204ENST00000468824 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.14■■■■■ 5.14
SLC25A1-204ENST00000468824 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
SLC25A1-204ENST00000468824 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
SLC25A1-204ENST00000468824 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
SLC25A1-204ENST00000468824 ADGRL1O94910 1474 aa47.07■■■■■ 5.13
SLC25A1-204ENST00000468824 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.05■■■■■ 5.12
SLC25A1-204ENST00000468824 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.03■■■■■ 5.12
SLC25A1-204ENST00000468824 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.96■■■■■ 5.11
SLC25A1-204ENST00000468824 ARAP3Q8WWN8 1544 aa46.95■■■■■ 5.11
SLC25A1-204ENST00000468824 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
SLC25A1-204ENST00000468824 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.88■■■■■ 5.1
SLC25A1-204ENST00000468824 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.86■■■■■ 5.09
SLC25A1-204ENST00000468824 NEO1Q92859 1461 aa46.8■■■■■ 5.08
SLC25A1-204ENST00000468824 RAPGEF3O95398 923 aa46.7■■■■■ 5.07
SLC25A1-204ENST00000468824 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.69■■■■■ 5.06
SLC25A1-204ENST00000468824 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
SLC25A1-204ENST00000468824 FMN1Q68DA7 1419 aa46.66■■■■■ 5.06
SLC25A1-204ENST00000468824 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.62■■■■■ 5.057e-10■□□□□ 10.6
SLC25A1-204ENST00000468824 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.58■■■■■ 5.05
SLC25A1-204ENST00000468824 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.55■■■■■ 5.04
SLC25A1-204ENST00000468824 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.54■■■■■ 5.04
SLC25A1-204ENST00000468824 HECW1Q76N89 1606 aa46.54■■■■■ 5.04
SLC25A1-204ENST00000468824 FANCAO15360 1455 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC25A1-204ENST00000468824 AKNAQ7Z591 1439 aa46.52■■■■■ 5.04
SLC25A1-204ENST00000468824 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
SLC25A1-204ENST00000468824 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.47■■■■■ 5.03
SLC25A1-204ENST00000468824 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
SLC25A1-204ENST00000468824 RICTORQ6R327 1708 aa46.37■■■■■ 5.01
SLC25A1-204ENST00000468824 PLCH2O75038 1416 aa46.36■■■■■ 5.01
SLC25A1-204ENST00000468824 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.34■■■■■ 5.01
SLC25A1-204ENST00000468824 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.3■■■■■ 5
SLC25A1-204ENST00000468824 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
SLC25A1-204ENST00000468824 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.28■■■■■ 5
SLC25A1-204ENST00000468824 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
SLC25A1-204ENST00000468824 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.23■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 KIF14Q15058 1648 aa46.22■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.21■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.2■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.2■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 CLIP1P30622 1438 aa46.2■■■■■ 4.99
SLC25A1-204ENST00000468824 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.19■■■■■ 4.98
SLC25A1-204ENST00000468824 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.19■■■■■ 4.98
SLC25A1-204ENST00000468824 PTPRMP28827 1452 aa46.19■■■■■ 4.98
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