RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468211.6

PTCH1-210, Transcript of patched 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTCH1, Length 1,254 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1-210ENST00000468211 KIF27Q86VH2 1401 aa42.8■■■■■ 4.44
PTCH1-210ENST00000468211 CUL7Q14999 1698 aa42.72■■■■■ 4.43
PTCH1-210ENST00000468211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.58■■■■■ 4.41
PTCH1-210ENST00000468211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.5■■■■■ 4.39
PTCH1-210ENST00000468211 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.44■■■■■ 4.38
PTCH1-210ENST00000468211 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.38■■■■■ 4.37
PTCH1-210ENST00000468211 IQGAP2Q13576 1575 aa42.22■■■■■ 4.35
PTCH1-210ENST00000468211 MAPKBP1O60336 1514 aa42.21■■■■■ 4.35
PTCH1-210ENST00000468211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
PTCH1-210ENST00000468211 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.17■■■■■ 4.34
PTCH1-210ENST00000468211 PTPRGP23470 1445 aa42.15■■■■■ 4.34
PTCH1-210ENST00000468211 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.13■■■■■ 4.34
PTCH1-210ENST00000468211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
PTCH1-210ENST00000468211 DIP2BQ9P265 1576 aa42.11■■■■■ 4.33
PTCH1-210ENST00000468211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.11■■■■■ 4.33
PTCH1-210ENST00000468211 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.1■■■■■ 4.33
PTCH1-210ENST00000468211 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.08■■■■■ 4.33
PTCH1-210ENST00000468211 DISP1Q96F81 1524 aa42.05■■■■■ 4.32
PTCH1-210ENST00000468211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.96■■■■■ 4.31
PTCH1-210ENST00000468211 ABCC2Q92887 1545 aa41.92■■■■■ 4.3
PTCH1-210ENST00000468211 TSPOAP1O95153 1857 aa41.89■■■■■ 4.3
PTCH1-210ENST00000468211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.87■■■■■ 4.29
PTCH1-210ENST00000468211 KIAA0556O60303 1618 aa41.86■■■■■ 4.29
PTCH1-210ENST00000468211 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
PTCH1-210ENST00000468211 UACAQ9BZF9 1416 aa41.84■■■■■ 4.29
PTCH1-210ENST00000468211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PTCH1-210ENST00000468211 ASXL2Q76L83 1435 aa41.78■■■■■ 4.28
PTCH1-210ENST00000468211 PRXQ9BXM0 1461 aa41.77■■■■■ 4.28
PTCH1-210ENST00000468211 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.7■■■■■ 4.27
PTCH1-210ENST00000468211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.69■■■■■ 4.27
PTCH1-210ENST00000468211 KDM6BO15054 1643 aa41.68■■■■■ 4.26
PTCH1-210ENST00000468211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
PTCH1-210ENST00000468211 GLI2P10070 1586 aa41.64■■■■■ 4.26
PTCH1-210ENST00000468211 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
PTCH1-210ENST00000468211 GOLGA3Q08378 1498 aa41.57■■■■■ 4.25
PTCH1-210ENST00000468211 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PTCH1-210ENST00000468211 ABCA8O94911 1581 aa41.48■■■■■ 4.23
PTCH1-210ENST00000468211 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.47■■■■■ 4.23
PTCH1-210ENST00000468211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.45■■■■■ 4.23
PTCH1-210ENST00000468211 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.38■■■■■ 4.21
PTCH1-210ENST00000468211 P3H3Q8IVL6 736 aa41.32■■■■■ 4.21
PTCH1-210ENST00000468211 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PTCH1-210ENST00000468211 SAMD9Q5K651 1589 aa41.25■■■■■ 4.19
PTCH1-210ENST00000468211 EEA1Q15075 1411 aa41.25■■■■■ 4.19
PTCH1-210ENST00000468211 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.22■■■■■ 4.19
PTCH1-210ENST00000468211 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.22■■■■■ 4.19
PTCH1-210ENST00000468211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
PTCH1-210ENST00000468211 KCNH8Q96L42 1107 aa41.18■■■■■ 4.18
PTCH1-210ENST00000468211 ARID3CA6NKF2 412 aa41.16■■■■■ 4.18
PTCH1-210ENST00000468211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.16■■■■■ 4.18
PTCH1-210ENST00000468211 ATP10BO94823 1461 aa41.12■■■■■ 4.17
PTCH1-210ENST00000468211 CD109Q6YHK3 1445 aa41.1■■■■■ 4.17
PTCH1-210ENST00000468211 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.07■■■■■ 4.16
PTCH1-210ENST00000468211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.06■■■■■ 4.16
PTCH1-210ENST00000468211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
PTCH1-210ENST00000468211 KIF21BO75037 1637 aa41.01■■■■■ 4.16
PTCH1-210ENST00000468211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.97■■■■■ 4.15
PTCH1-210ENST00000468211 ADGRL1O94910 1474 aa40.91■■■■■ 4.14
PTCH1-210ENST00000468211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PTCH1-210ENST00000468211 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.88■■■■■ 4.13
PTCH1-210ENST00000468211 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.87■■■■■ 4.13
PTCH1-210ENST00000468211 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.8■■■■■ 4.12
PTCH1-210ENST00000468211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PTCH1-210ENST00000468211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
PTCH1-210ENST00000468211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.78■■■■■ 4.12
PTCH1-210ENST00000468211 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.75■■■■■ 4.11
PTCH1-210ENST00000468211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
PTCH1-210ENST00000468211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.6■■■■■ 4.09
PTCH1-210ENST00000468211 NEO1Q92859 1461 aa40.59■■■■■ 4.09
PTCH1-210ENST00000468211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.59■■■■■ 4.09
PTCH1-210ENST00000468211 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PTCH1-210ENST00000468211 RAPGEF3O95398 923 aa40.54■■■■■ 4.08
PTCH1-210ENST00000468211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
PTCH1-210ENST00000468211 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.52■■■■■ 4.08
PTCH1-210ENST00000468211 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.51■■■■■ 4.08
PTCH1-210ENST00000468211 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.48■■■■■ 4.07
PTCH1-210ENST00000468211 FMN1Q68DA7 1419 aa40.41■■■■■ 4.06
PTCH1-210ENST00000468211 HECW1Q76N89 1606 aa40.39■■■■■ 4.06
PTCH1-210ENST00000468211 RICTORQ6R327 1708 aa40.37■■■■■ 4.05
PTCH1-210ENST00000468211 FANCAO15360 1455 aa40.37■■■■■ 4.05
PTCH1-210ENST00000468211 AKNAQ7Z591 1439 aa40.36■■■■■ 4.05
PTCH1-210ENST00000468211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
PTCH1-210ENST00000468211 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.34■■■■■ 4.05
PTCH1-210ENST00000468211 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.31■■■■■ 4.04
PTCH1-210ENST00000468211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.31■■■■■ 4.04
PTCH1-210ENST00000468211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
PTCH1-210ENST00000468211 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.28■■■■■ 4.04
PTCH1-210ENST00000468211 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.22■■■■■ 4.03
PTCH1-210ENST00000468211 KIF14Q15058 1648 aa40.21■■■■■ 4.03
PTCH1-210ENST00000468211 PLCH2O75038 1416 aa40.21■■■■■ 4.03
PTCH1-210ENST00000468211 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.21■■■■■ 4.03
PTCH1-210ENST00000468211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.18■■■■■ 4.02
PTCH1-210ENST00000468211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.16■■■■■ 4.02
PTCH1-210ENST00000468211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 PTPRMP28827 1452 aa40.12■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 MADDQ8WXG6 1647 aa40.11■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
PTCH1-210ENST00000468211 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.1■■■■■ 4.01
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