RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.57	□□□□□ -0.24
IL6-208	ENST00000464710	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.55	□□□□□ -0.24
IL6-208	ENST00000464710	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
IL6-208	ENST00000464710	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.54	□□□□□ -0.24
IL6-208	ENST00000464710	GOLGA3	Q08378	1498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.51	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	KIF21B	O75037	1637 aa		13.5	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.49	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
IL6-208	ENST00000464710	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IL6-208	ENST00000464710	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.45	□□□□□ -0.26
IL6-208	ENST00000464710	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
IL6-208	ENST00000464710	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
IL6-208	ENST00000464710	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
IL6-208	ENST00000464710	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	PTPRG	P23470	1445 aa		13.39	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.38	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.37	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	DISP1	Q96F81	1524 aa		13.35	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	ARAP1	Q96P48	1450 aa		13.34	□□□□□ -0.27
IL6-208	ENST00000464710	CLIP1	P30622	1438 aa		13.31	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.31	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.3	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.3	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.28	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.28	□□□□□ -0.28
IL6-208	ENST00000464710	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.26	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.26	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.24	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.23	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.22	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
IL6-208	ENST00000464710	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.18	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.17	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.16	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	APLP2	Q06481	763 aa		13.16	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.15	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	ABCA8	O94911	1581 aa		13.15	□□□□□ -0.3
IL6-208	ENST00000464710	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.14	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	ATP10B	O94823	1461 aa		13.13	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.12	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.1	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.09	□□□□□ -0.31
IL6-208	ENST00000464710	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.06	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.05	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
IL6-208	ENST00000464710	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IL6-208	ENST00000464710	CD109	Q6YHK3	1445 aa		12.95	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		12.93	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	TIAM1	Q13009	1591 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	DIP2B	Q9P265	1576 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		12.91	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.9	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
IL6-208	ENST00000464710	GLI2	P10070	1586 aa		12.9	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	TSPOAP1	O95153	1857 aa		12.87	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	KIF14	Q15058	1648 aa		12.87	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		12.87	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		12.86	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	PLCH2	O75038	1416 aa		12.86	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.85	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	NCOA2	Q15596	1464 aa		12.85	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		12.84	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		12.84	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		12.84	□□□□□ -0.35
IL6-208	ENST00000464710	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		12.82	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
IL6-208	ENST00000464710	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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