RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463216.5

TTC3-212, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 842 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-212ENST00000463216 IGF1RP08069 1367 aa41.87■■■■■ 4.29
TTC3-212ENST00000463216 CUL7Q14999 1698 aa41.78■■■■■ 4.28
TTC3-212ENST00000463216 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.68■■■■■ 4.26
TTC3-212ENST00000463216 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.63■■■■■ 4.26
TTC3-212ENST00000463216 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
TTC3-212ENST00000463216 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.51■■■■■ 4.23
TTC3-212ENST00000463216 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
TTC3-212ENST00000463216 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.46■■■■■ 4.23
TTC3-212ENST00000463216 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.41■■■■■ 4.22
TTC3-212ENST00000463216 PTPRGP23470 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
TTC3-212ENST00000463216 MAPKBP1O60336 1514 aa41.34■■■■■ 4.21
TTC3-212ENST00000463216 IQGAP2Q13576 1575 aa41.33■■■■■ 4.21
TTC3-212ENST00000463216 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
TTC3-212ENST00000463216 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.33■■■■■ 4.21
TTC3-212ENST00000463216 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.32■■■■■ 4.2
TTC3-212ENST00000463216 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.25■■■■■ 4.19
TTC3-212ENST00000463216 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.25■■■■■ 4.19
TTC3-212ENST00000463216 DIP2BQ9P265 1576 aa41.23■■■■■ 4.19
TTC3-212ENST00000463216 DISP1Q96F81 1524 aa41.1■■■■■ 4.17
TTC3-212ENST00000463216 TSPOAP1O95153 1857 aa41.09■■■■■ 4.17
TTC3-212ENST00000463216 ABCC2Q92887 1545 aa41.06■■■■■ 4.16
TTC3-212ENST00000463216 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.02■■■■■ 4.16
TTC3-212ENST00000463216 UACAQ9BZF9 1416 aa41.01■■■■■ 4.15
TTC3-212ENST00000463216 ASXL2Q76L83 1435 aa40.95■■■■■ 4.15
TTC3-212ENST00000463216 KIAA0556O60303 1618 aa40.95■■■■■ 4.15
TTC3-212ENST00000463216 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.95■■■■■ 4.15
TTC3-212ENST00000463216 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.92■■■■■ 4.14
TTC3-212ENST00000463216 KDM6BO15054 1643 aa40.9■■■■■ 4.14
TTC3-212ENST00000463216 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.9■■■■■ 4.14
TTC3-212ENST00000463216 PRXQ9BXM0 1461 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC3-212ENST00000463216 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.77■■■■■ 4.12
TTC3-212ENST00000463216 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
TTC3-212ENST00000463216 GLI2P10070 1586 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC3-212ENST00000463216 GOLGA3Q08378 1498 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC3-212ENST00000463216 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
TTC3-212ENST00000463216 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
TTC3-212ENST00000463216 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.6■■■■■ 4.09
TTC3-212ENST00000463216 P3H3Q8IVL6 736 aa40.57■■■■■ 4.09
TTC3-212ENST00000463216 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.56■■■■■ 4.08
TTC3-212ENST00000463216 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.55■■■■■ 4.08
TTC3-212ENST00000463216 ABCA8O94911 1581 aa40.53■■■■■ 4.08
TTC3-212ENST00000463216 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
TTC3-212ENST00000463216 KCNH8Q96L42 1107 aa40.5■■■■■ 4.07
TTC3-212ENST00000463216 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.47■■■■■ 4.07
TTC3-212ENST00000463216 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.45■■■■■ 4.07
TTC3-212ENST00000463216 ARID3CA6NKF2 412 aa40.45■■■■■ 4.07
TTC3-212ENST00000463216 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TTC3-212ENST00000463216 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TTC3-212ENST00000463216 EEA1Q15075 1411 aa40.35■■■■■ 4.05
TTC3-212ENST00000463216 CD109Q6YHK3 1445 aa40.33■■■■■ 4.05
TTC3-212ENST00000463216 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.29■■■■■ 4.04
TTC3-212ENST00000463216 SAMD9Q5K651 1589 aa40.28■■■■■ 4.04
TTC3-212ENST00000463216 ATP10BO94823 1461 aa40.24■■■■■ 4.03
TTC3-212ENST00000463216 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.21■■■■■ 4.03
TTC3-212ENST00000463216 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
TTC3-212ENST00000463216 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
TTC3-212ENST00000463216 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.17■■■■■ 4.02
TTC3-212ENST00000463216 ADGRL1O94910 1474 aa40.16■■■■■ 4.02
TTC3-212ENST00000463216 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.12■■■■■ 4.01
TTC3-212ENST00000463216 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.1■■■■■ 4.01
TTC3-212ENST00000463216 KIF21BO75037 1637 aa40.04■■■■■ 4
TTC3-212ENST00000463216 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
TTC3-212ENST00000463216 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.98■■■■□ 3.99
TTC3-212ENST00000463216 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
TTC3-212ENST00000463216 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.93■■■■□ 3.98
TTC3-212ENST00000463216 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.91■■■■□ 3.98
TTC3-212ENST00000463216 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.89■■■■□ 3.98
TTC3-212ENST00000463216 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.87■■■■□ 3.97
TTC3-212ENST00000463216 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.82■■■■□ 3.96
TTC3-212ENST00000463216 RAPGEF3O95398 923 aa39.8■■■■□ 3.96
TTC3-212ENST00000463216 NEO1Q92859 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
TTC3-212ENST00000463216 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
TTC3-212ENST00000463216 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
TTC3-212ENST00000463216 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.948e-9■■■■□ 23.3
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TTC3-212ENST00000463216 FMN1Q68DA7 1419 aa39.59■■■■□ 3.93
TTC3-212ENST00000463216 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.59■■■■□ 3.93
TTC3-212ENST00000463216 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.59■■■■□ 3.93
TTC3-212ENST00000463216 FANCAO15360 1455 aa39.58■■■■□ 3.93
TTC3-212ENST00000463216 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.58■■■■□ 3.93
TTC3-212ENST00000463216 AKNAQ7Z591 1439 aa39.57■■■■□ 3.92
TTC3-212ENST00000463216 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
TTC3-212ENST00000463216 HECW1Q76N89 1606 aa39.54■■■■□ 3.92
TTC3-212ENST00000463216 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
TTC3-212ENST00000463216 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.54■■■■□ 3.92
TTC3-212ENST00000463216 RICTORQ6R327 1708 aa39.46■■■■□ 3.91
TTC3-212ENST00000463216 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
TTC3-212ENST00000463216 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.41■■■■□ 3.9
TTC3-212ENST00000463216 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.39■■■■□ 3.9
TTC3-212ENST00000463216 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.37■■■■□ 3.89
TTC3-212ENST00000463216 PLCH2O75038 1416 aa39.37■■■■□ 3.89
TTC3-212ENST00000463216 PTPRMP28827 1452 aa39.36■■■■□ 3.89
TTC3-212ENST00000463216 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.32■■■■□ 3.89
TTC3-212ENST00000463216 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.32■■■■□ 3.89
TTC3-212ENST00000463216 KIF14Q15058 1648 aa39.3■■■■□ 3.88
TTC3-212ENST00000463216 MADDQ8WXG6 1647 aa39.3■■■■□ 3.88
TTC3-212ENST00000463216 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.29■■■■□ 3.88
TTC3-212ENST00000463216 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.28■■■■□ 3.88
TTC3-212ENST00000463216 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.28■■■■□ 3.88
TTC3-212ENST00000463216 CLIP1P30622 1438 aa39.27■■■■□ 3.88
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