RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 JPH4Q96JJ6 628 aa40.73■■■■■ 4.11
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SMKR1-201ENST00000462322 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.52■■■■■ 4.08
SMKR1-201ENST00000462322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
SMKR1-201ENST00000462322 IQGAP2Q13576 1575 aa40.36■■■■■ 4.05
SMKR1-201ENST00000462322 PRXQ9BXM0 1461 aa40.29■■■■■ 4.04
SMKR1-201ENST00000462322 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
SMKR1-201ENST00000462322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.23■■■■■ 4.03
SMKR1-201ENST00000462322 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.18■■■■■ 4.02
SMKR1-201ENST00000462322 EEA1Q15075 1411 aa40.17■■■■■ 4.02
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRGP23470 1445 aa40.15■■■■■ 4.02
SMKR1-201ENST00000462322 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
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SMKR1-201ENST00000462322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.11■■■■■ 4.01
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SMKR1-201ENST00000462322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.07■■■■■ 4.01
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SMKR1-201ENST00000462322 P3H3Q8IVL6 736 aa39.68■■■■□ 3.94
SMKR1-201ENST00000462322 DIP2BQ9P265 1576 aa39.64■■■■□ 3.94
SMKR1-201ENST00000462322 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.64■■■■□ 3.94
SMKR1-201ENST00000462322 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.62■■■■□ 3.93
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SMKR1-201ENST00000462322 ASXL2Q76L83 1435 aa39.6■■■■□ 3.93
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SMKR1-201ENST00000462322 ARID3CA6NKF2 412 aa39.33■■■■□ 3.89
SMKR1-201ENST00000462322 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.29■■■■□ 3.88
SMKR1-201ENST00000462322 ATP10BO94823 1461 aa39.25■■■■□ 3.87
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SMKR1-201ENST00000462322 CD109Q6YHK3 1445 aa39.03■■■■□ 3.84
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SMKR1-201ENST00000462322 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
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SMKR1-201ENST00000462322 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.24■■■■□ 3.71
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