RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 JPH4Q96JJ6 628 aa24.28■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.18■■□□□ 1.46
ZBED1-204ENST00000461691 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.15■■□□□ 1.46
ZBED1-204ENST00000461691 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
ZBED1-204ENST00000461691 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED1-204ENST00000461691 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED1-204ENST00000461691 IQGAP2Q13576 1575 aa23.98■■□□□ 1.43
ZBED1-204ENST00000461691 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED1-204ENST00000461691 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
ZBED1-204ENST00000461691 MAPKBP1O60336 1514 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED1-204ENST00000461691 PTPRGP23470 1445 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED1-204ENST00000461691 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.9■■□□□ 1.42
ZBED1-204ENST00000461691 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED1-204ENST00000461691 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ZBED1-204ENST00000461691 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.86■■□□□ 1.41
ZBED1-204ENST00000461691 DIP2BQ9P265 1576 aa23.84■■□□□ 1.41
ZBED1-204ENST00000461691 DISP1Q96F81 1524 aa23.82■■□□□ 1.4
ZBED1-204ENST00000461691 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.82■■□□□ 1.4
ZBED1-204ENST00000461691 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.79■■□□□ 1.4
ZBED1-204ENST00000461691 ABCC2Q92887 1545 aa23.78■■□□□ 1.4
ZBED1-204ENST00000461691 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.75■■□□□ 1.39
ZBED1-204ENST00000461691 KIAA0556O60303 1618 aa23.75■■□□□ 1.39
ZBED1-204ENST00000461691 UACAQ9BZF9 1416 aa23.75■■□□□ 1.39
ZBED1-204ENST00000461691 PRXQ9BXM0 1461 aa23.72■■□□□ 1.39
ZBED1-204ENST00000461691 TSPOAP1O95153 1857 aa23.71■■□□□ 1.39
ZBED1-204ENST00000461691 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.68■■□□□ 1.38
ZBED1-204ENST00000461691 ASXL2Q76L83 1435 aa23.67■■□□□ 1.38
ZBED1-204ENST00000461691 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ZBED1-204ENST00000461691 GOLGA3Q08378 1498 aa23.66■■□□□ 1.38
ZBED1-204ENST00000461691 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.64■■□□□ 1.37
ZBED1-204ENST00000461691 KDM6BO15054 1643 aa23.62■■□□□ 1.37
ZBED1-204ENST00000461691 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ZBED1-204ENST00000461691 GLI2P10070 1586 aa23.61■■□□□ 1.37
ZBED1-204ENST00000461691 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.58■■□□□ 1.37
ZBED1-204ENST00000461691 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ZBED1-204ENST00000461691 EEA1Q15075 1411 aa23.53■■□□□ 1.36
ZBED1-204ENST00000461691 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA8O94911 1581 aa23.52■■□□□ 1.36
ZBED1-204ENST00000461691 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.49■■□□□ 1.35
ZBED1-204ENST00000461691 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.48■■□□□ 1.35
ZBED1-204ENST00000461691 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ZBED1-204ENST00000461691 P3H3Q8IVL6 736 aa23.44■■□□□ 1.34
ZBED1-204ENST00000461691 SAMD9Q5K651 1589 aa23.42■■□□□ 1.34
ZBED1-204ENST00000461691 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.42■■□□□ 1.34
ZBED1-204ENST00000461691 KCNH8Q96L42 1107 aa23.36■■□□□ 1.33
ZBED1-204ENST00000461691 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.35■■□□□ 1.33
ZBED1-204ENST00000461691 KIF21BO75037 1637 aa23.33■■□□□ 1.33
ZBED1-204ENST00000461691 ATP10BO94823 1461 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 ARID3CA6NKF2 412 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 CD109Q6YHK3 1445 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.29■■□□□ 1.32
ZBED1-204ENST00000461691 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.26■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.26■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.25■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.23■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-204ENST00000461691 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED1-204ENST00000461691 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-204ENST00000461691 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-204ENST00000461691 ADGRL1O94910 1474 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED1-204ENST00000461691 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.11■■□□□ 1.29
ZBED1-204ENST00000461691 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-204ENST00000461691 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.08■■□□□ 1.29
ZBED1-204ENST00000461691 NEO1Q92859 1461 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.02■■□□□ 1.28
ZBED1-204ENST00000461691 FMN1Q68DA7 1419 aa23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-204ENST00000461691 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ZBED1-204ENST00000461691 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.276e-10■■□□□ 13
ZBED1-204ENST00000461691 HECW1Q76N89 1606 aa22.97■■□□□ 1.27
ZBED1-204ENST00000461691 RAPGEF3O95398 923 aa22.96■■□□□ 1.27
ZBED1-204ENST00000461691 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ZBED1-204ENST00000461691 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.95■■□□□ 1.26
ZBED1-204ENST00000461691 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.94■■□□□ 1.26
ZBED1-204ENST00000461691 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.93■■□□□ 1.26
ZBED1-204ENST00000461691 FANCAO15360 1455 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-204ENST00000461691 AKNAQ7Z591 1439 aa22.91■■□□□ 1.26
ZBED1-204ENST00000461691 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ZBED1-204ENST00000461691 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-204ENST00000461691 RICTORQ6R327 1708 aa22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-204ENST00000461691 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.83■■□□□ 1.25
ZBED1-204ENST00000461691 PLCH2O75038 1416 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.82■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 KIF14Q15058 1648 aa22.81■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.8■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 CLIP1P30622 1438 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.78■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.77■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.77■■□□□ 1.24
ZBED1-204ENST00000461691 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.4 ms