RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461592.1

CCZ1-202, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-202ENST00000461592 SHROOM2Q13796 1616 aa45.1■■■■■ 4.81
CCZ1-202ENST00000461592 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.08■■■■■ 4.81
CCZ1-202ENST00000461592 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.03■■■■■ 4.8
CCZ1-202ENST00000461592 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.03■■■■■ 4.8
CCZ1-202ENST00000461592 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
CCZ1-202ENST00000461592 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.81■■■■■ 4.76
CCZ1-202ENST00000461592 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.79■■■■■ 4.76
CCZ1-202ENST00000461592 IQGAP2Q13576 1575 aa44.77■■■■■ 4.76
CCZ1-202ENST00000461592 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.73■■■■■ 4.75
CCZ1-202ENST00000461592 EEA1Q15075 1411 aa44.73■■■■■ 4.75
CCZ1-202ENST00000461592 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
CCZ1-202ENST00000461592 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.69■■■■■ 4.74
CCZ1-202ENST00000461592 PRXQ9BXM0 1461 aa44.66■■■■■ 4.74
CCZ1-202ENST00000461592 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
CCZ1-202ENST00000461592 PTPRGP23470 1445 aa44.63■■■■■ 4.73
CCZ1-202ENST00000461592 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.59■■■■■ 4.73
CCZ1-202ENST00000461592 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.47■■■■■ 4.71
CCZ1-202ENST00000461592 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.44■■■■■ 4.7
CCZ1-202ENST00000461592 DISP1Q96F81 1524 aa44.4■■■■■ 4.7
CCZ1-202ENST00000461592 GOLGA3Q08378 1498 aa44.4■■■■■ 4.7
CCZ1-202ENST00000461592 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.3■■■■■ 4.68
CCZ1-202ENST00000461592 KIAA0556O60303 1618 aa44.29■■■■■ 4.68
CCZ1-202ENST00000461592 UACAQ9BZF9 1416 aa44.25■■■■■ 4.67
CCZ1-202ENST00000461592 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.16■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 MAPKBP1O60336 1514 aa44.14■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 ABCC2Q92887 1545 aa44.14■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 P3H3Q8IVL6 736 aa44.14■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.14■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.14■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
CCZ1-202ENST00000461592 KIF21BO75037 1637 aa44.1■■■■■ 4.65
CCZ1-202ENST00000461592 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.04■■■■■ 4.64
CCZ1-202ENST00000461592 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.96■■■■■ 4.63
CCZ1-202ENST00000461592 ASXL2Q76L83 1435 aa43.92■■■■■ 4.62
CCZ1-202ENST00000461592 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.9■■■■■ 4.62
CCZ1-202ENST00000461592 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.87■■■■■ 4.61
CCZ1-202ENST00000461592 DIP2BQ9P265 1576 aa43.85■■■■■ 4.61
CCZ1-202ENST00000461592 SAMD9Q5K651 1589 aa43.84■■■■■ 4.61
CCZ1-202ENST00000461592 ABCA8O94911 1581 aa43.8■■■■■ 4.6
CCZ1-202ENST00000461592 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
CCZ1-202ENST00000461592 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.73■■■■■ 4.59
CCZ1-202ENST00000461592 ARID3CA6NKF2 412 aa43.73■■■■■ 4.59
CCZ1-202ENST00000461592 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
CCZ1-202ENST00000461592 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
CCZ1-202ENST00000461592 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.73■■■■■ 4.59
CCZ1-202ENST00000461592 KCNH8Q96L42 1107 aa43.65■■■■■ 4.58
CCZ1-202ENST00000461592 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.64■■■■■ 4.58
CCZ1-202ENST00000461592 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
CCZ1-202ENST00000461592 GLI2P10070 1586 aa43.6■■■■■ 4.57
CCZ1-202ENST00000461592 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.58■■■■■ 4.57
CCZ1-202ENST00000461592 TSPOAP1O95153 1857 aa43.57■■■■■ 4.56
CCZ1-202ENST00000461592 ATP10BO94823 1461 aa43.53■■■■■ 4.56
CCZ1-202ENST00000461592 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
CCZ1-202ENST00000461592 FMN1Q68DA7 1419 aa43.45■■■■■ 4.55
CCZ1-202ENST00000461592 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.41■■■■■ 4.54
CCZ1-202ENST00000461592 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.41■■■■■ 4.54
CCZ1-202ENST00000461592 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.4■■■■■ 4.54
CCZ1-202ENST00000461592 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
CCZ1-202ENST00000461592 CD109Q6YHK3 1445 aa43.36■■■■■ 4.53
CCZ1-202ENST00000461592 KDM6BO15054 1643 aa43.36■■■■■ 4.53
CCZ1-202ENST00000461592 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.33■■■■■ 4.53
CCZ1-202ENST00000461592 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
CCZ1-202ENST00000461592 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.23■■■■■ 4.51
CCZ1-202ENST00000461592 CLIP1P30622 1438 aa43.2■■■■■ 4.51
CCZ1-202ENST00000461592 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
CCZ1-202ENST00000461592 HECW1Q76N89 1606 aa43.17■■■■■ 4.5
CCZ1-202ENST00000461592 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.17■■■■■ 4.5
CCZ1-202ENST00000461592 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
CCZ1-202ENST00000461592 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
CCZ1-202ENST00000461592 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.04■■■■■ 4.48
CCZ1-202ENST00000461592 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43■■■■■ 4.47
CCZ1-202ENST00000461592 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.97■■■■■ 4.47
CCZ1-202ENST00000461592 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
CCZ1-202ENST00000461592 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.91■■■■■ 4.46
CCZ1-202ENST00000461592 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.89■■■■■ 4.46
CCZ1-202ENST00000461592 CEP162Q5TB80 1403 aa42.88■■■■■ 4.46
CCZ1-202ENST00000461592 NEO1Q92859 1461 aa42.86■■■■■ 4.45
CCZ1-202ENST00000461592 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.85■■■■■ 4.45
CCZ1-202ENST00000461592 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
CCZ1-202ENST00000461592 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
CCZ1-202ENST00000461592 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
CCZ1-202ENST00000461592 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.8■■■■■ 4.44
CCZ1-202ENST00000461592 FANCAO15360 1455 aa42.74■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 KIF14Q15058 1648 aa42.72■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.71■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 RAPGEF3O95398 923 aa42.7■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.7■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.69■■■■■ 4.43
CCZ1-202ENST00000461592 AKNAQ7Z591 1439 aa42.69■■■■■ 4.42
CCZ1-202ENST00000461592 PLCH2O75038 1416 aa42.68■■■■■ 4.42
CCZ1-202ENST00000461592 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.63■■■■■ 4.41
CCZ1-202ENST00000461592 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
CCZ1-202ENST00000461592 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.55■■■■■ 4.4
CCZ1-202ENST00000461592 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.54■■■■■ 4.4
CCZ1-202ENST00000461592 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.52■■■■■ 4.4
CCZ1-202ENST00000461592 ADGRL1O94910 1474 aa42.51■■■■■ 4.4
CCZ1-202ENST00000461592 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.51■■■■■ 4.4
CCZ1-202ENST00000461592 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.49■■■■■ 4.39
CCZ1-202ENST00000461592 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.41■■■■■ 4.38
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