RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461214.1

COL5A3-202, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL5A3, Length 828 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-202ENST00000461214 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.93■■□□□ 1.42
COL5A3-202ENST00000461214 IGF1RP08069 1367 aa23.92■■□□□ 1.42
COL5A3-202ENST00000461214 CEP170Q5SW79 1584 aa23.92■■□□□ 1.42
COL5A3-202ENST00000461214 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.9■■□□□ 1.42
COL5A3-202ENST00000461214 GRIN2AQ12879 1464 aa23.88■■□□□ 1.41
COL5A3-202ENST00000461214 PRXQ9BXM0 1461 aa23.87■■□□□ 1.41
COL5A3-202ENST00000461214 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.84■■□□□ 1.41
COL5A3-202ENST00000461214 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.84■■□□□ 1.41
COL5A3-202ENST00000461214 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.83■■□□□ 1.41
COL5A3-202ENST00000461214 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.82■■□□□ 1.4
COL5A3-202ENST00000461214 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.81■■□□□ 1.4
COL5A3-202ENST00000461214 NUP160Q12769 1436 aa23.8■■□□□ 1.4
COL5A3-202ENST00000461214 SHROOM2Q13796 1616 aa23.76■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 GOLGA3Q08378 1498 aa23.74■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.71■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
COL5A3-202ENST00000461214 KDM6BO15054 1643 aa23.68■■□□□ 1.38
COL5A3-202ENST00000461214 IQGAP2Q13576 1575 aa23.66■■□□□ 1.38
COL5A3-202ENST00000461214 JPH4Q96JJ6 628 aa23.63■■□□□ 1.37
COL5A3-202ENST00000461214 DIP2BQ9P265 1576 aa23.63■■□□□ 1.37
COL5A3-202ENST00000461214 TSPOAP1O95153 1857 aa23.6■■□□□ 1.37
COL5A3-202ENST00000461214 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.6■■□□□ 1.37
COL5A3-202ENST00000461214 MAPKBP1O60336 1514 aa23.58■■□□□ 1.36
COL5A3-202ENST00000461214 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.52■■□□□ 1.36
COL5A3-202ENST00000461214 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.5■■□□□ 1.35
COL5A3-202ENST00000461214 SAMD9Q5K651 1589 aa23.48■■□□□ 1.35
COL5A3-202ENST00000461214 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.45■■□□□ 1.34
COL5A3-202ENST00000461214 ADGRL1O94910 1474 aa23.44■■□□□ 1.34
COL5A3-202ENST00000461214 KIAA0556O60303 1618 aa23.44■■□□□ 1.34
COL5A3-202ENST00000461214 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.43■■□□□ 1.34
COL5A3-202ENST00000461214 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
COL5A3-202ENST00000461214 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
COL5A3-202ENST00000461214 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.37■■□□□ 1.33
COL5A3-202ENST00000461214 DISP1Q96F81 1524 aa23.34■■□□□ 1.33
COL5A3-202ENST00000461214 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.32■■□□□ 1.32
COL5A3-202ENST00000461214 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
COL5A3-202ENST00000461214 CEP162Q5TB80 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
COL5A3-202ENST00000461214 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.25■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 CLIP1P30622 1438 aa23.25■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 PTPRGP23470 1445 aa23.24■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 ASXL2Q76L83 1435 aa23.22■■□□□ 1.31
COL5A3-202ENST00000461214 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC2Q92887 1545 aa23.17■■□□□ 1.3
COL5A3-202ENST00000461214 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.17■■□□□ 1.3
COL5A3-202ENST00000461214 GLI2P10070 1586 aa23.15■■□□□ 1.3
COL5A3-202ENST00000461214 FBXO41Q8TF61 875 aa23.14■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.14■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.14■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 ABCA8O94911 1581 aa23.1■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 FMN1Q68DA7 1419 aa23.1■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 HECW1Q76N89 1606 aa23.09■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
COL5A3-202ENST00000461214 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.07■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.05■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.03■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.02■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.02■■□□□ 1.28
COL5A3-202ENST00000461214 UACAQ9BZF9 1416 aa23■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.99■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 P3H3Q8IVL6 736 aa22.98■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.96■■□□□ 1.27
COL5A3-202ENST00000461214 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
COL5A3-202ENST00000461214 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.91■■□□□ 1.26
COL5A3-202ENST00000461214 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.91■■□□□ 1.26
COL5A3-202ENST00000461214 TIAM1Q13009 1591 aa22.84■■□□□ 1.25
COL5A3-202ENST00000461214 KCNH8Q96L42 1107 aa22.83■■□□□ 1.25
COL5A3-202ENST00000461214 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.83■■□□□ 1.25
COL5A3-202ENST00000461214 MAP3K1Q13233 1512 aa22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-202ENST00000461214 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-202ENST00000461214 CD109Q6YHK3 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
COL5A3-202ENST00000461214 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
COL5A3-202ENST00000461214 ATP10BO94823 1461 aa22.77■■□□□ 1.24
COL5A3-202ENST00000461214 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.76■■□□□ 1.23
COL5A3-202ENST00000461214 PTPRMP28827 1452 aa22.74■■□□□ 1.23
COL5A3-202ENST00000461214 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.73■■□□□ 1.23
COL5A3-202ENST00000461214 KIF14Q15058 1648 aa22.7■■□□□ 1.22
COL5A3-202ENST00000461214 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
COL5A3-202ENST00000461214 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.65■■□□□ 1.22
COL5A3-202ENST00000461214 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
COL5A3-202ENST00000461214 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.64■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.62■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.62■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 ARID3CA6NKF2 412 aa22.61■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.61■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 ILDR2Q71H61 639 aa22.6■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.59■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 HSPA2P54652 639 aa22.59■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
COL5A3-202ENST00000461214 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.59■■□□□ 1.21
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