RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460900.1

CRIP1-204, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP1, Length 1,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-204ENST00000460900 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.47■■■■□ 3.75
CRIP1-204ENST00000460900 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.46■■■■□ 3.75
CRIP1-204ENST00000460900 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.45■■■■□ 3.75
CRIP1-204ENST00000460900 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.43■■■■□ 3.74
CRIP1-204ENST00000460900 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.38■■■■□ 3.74
CRIP1-204ENST00000460900 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.27■■■■□ 3.72
CRIP1-204ENST00000460900 PRXQ9BXM0 1461 aa38.26■■■■□ 3.72
CRIP1-204ENST00000460900 EEA1Q15075 1411 aa38.25■■■■□ 3.71
CRIP1-204ENST00000460900 IQGAP2Q13576 1575 aa38.23■■■■□ 3.71
CRIP1-204ENST00000460900 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
CRIP1-204ENST00000460900 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.1■■■■□ 3.69
CRIP1-204ENST00000460900 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.07■■■■□ 3.69
CRIP1-204ENST00000460900 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.01■■■■□ 3.68
CRIP1-204ENST00000460900 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
CRIP1-204ENST00000460900 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.97■■■■□ 3.67
CRIP1-204ENST00000460900 DISP1Q96F81 1524 aa37.96■■■■□ 3.67
CRIP1-204ENST00000460900 PTPRGP23470 1445 aa37.96■■■■□ 3.67
CRIP1-204ENST00000460900 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
CRIP1-204ENST00000460900 KIAA0556O60303 1618 aa37.86■■■■□ 3.65
CRIP1-204ENST00000460900 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.84■■■■□ 3.65
CRIP1-204ENST00000460900 KIF21BO75037 1637 aa37.83■■■■□ 3.65
CRIP1-204ENST00000460900 GOLGA3Q08378 1498 aa37.83■■■■□ 3.65
CRIP1-204ENST00000460900 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.81■■■■□ 3.64
CRIP1-204ENST00000460900 UACAQ9BZF9 1416 aa37.69■■■■□ 3.62
CRIP1-204ENST00000460900 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.66■■■■□ 3.62
CRIP1-204ENST00000460900 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.63■■■■□ 3.62
CRIP1-204ENST00000460900 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC2Q92887 1545 aa37.61■■■■□ 3.61
CRIP1-204ENST00000460900 P3H3Q8IVL6 736 aa37.61■■■■□ 3.61
CRIP1-204ENST00000460900 MAPKBP1O60336 1514 aa37.6■■■■□ 3.61
CRIP1-204ENST00000460900 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CRIP1-204ENST00000460900 SAMD9Q5K651 1589 aa37.56■■■■□ 3.6
CRIP1-204ENST00000460900 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.51■■■■□ 3.6
CRIP1-204ENST00000460900 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-204ENST00000460900 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-204ENST00000460900 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.46■■■■□ 3.59
CRIP1-204ENST00000460900 ABCA8O94911 1581 aa37.45■■■■□ 3.59
CRIP1-204ENST00000460900 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.44■■■■□ 3.58
CRIP1-204ENST00000460900 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.4■■■■□ 3.58
CRIP1-204ENST00000460900 ASXL2Q76L83 1435 aa37.39■■■■□ 3.58
CRIP1-204ENST00000460900 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CRIP1-204ENST00000460900 DIP2BQ9P265 1576 aa37.38■■■■□ 3.57
CRIP1-204ENST00000460900 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.37■■■■□ 3.57
CRIP1-204ENST00000460900 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.25■■■■□ 3.55
CRIP1-204ENST00000460900 ARID3CA6NKF2 412 aa37.22■■■■□ 3.55
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.19■■■■□ 3.54
CRIP1-204ENST00000460900 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.18■■■■□ 3.54
CRIP1-204ENST00000460900 GLI2P10070 1586 aa37.16■■■■□ 3.54
CRIP1-204ENST00000460900 ATP10BO94823 1461 aa37.16■■■■□ 3.54
CRIP1-204ENST00000460900 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
CRIP1-204ENST00000460900 TSPOAP1O95153 1857 aa37.13■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 FMN1Q68DA7 1419 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 KCNH8Q96L42 1107 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIP1-204ENST00000460900 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.98■■■■□ 3.51
CRIP1-204ENST00000460900 CLIP1P30622 1438 aa36.96■■■■□ 3.51
CRIP1-204ENST00000460900 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CRIP1-204ENST00000460900 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
CRIP1-204ENST00000460900 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.9■■■■□ 3.5
CRIP1-204ENST00000460900 HECW1Q76N89 1606 aa36.89■■■■□ 3.5
CRIP1-204ENST00000460900 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.88■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 CD109Q6YHK3 1445 aa36.87■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.85■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 KDM6BO15054 1643 aa36.84■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.84■■■■□ 3.49
CRIP1-204ENST00000460900 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.78■■■■□ 3.48
CRIP1-204ENST00000460900 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.77■■■■□ 3.48
CRIP1-204ENST00000460900 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.76■■■■□ 3.48
CRIP1-204ENST00000460900 CEP162Q5TB80 1403 aa36.75■■■■□ 3.47
CRIP1-204ENST00000460900 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CRIP1-204ENST00000460900 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CRIP1-204ENST00000460900 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.66■■■■□ 3.46
CRIP1-204ENST00000460900 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP1-204ENST00000460900 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.63■■■■□ 3.45
CRIP1-204ENST00000460900 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
CRIP1-204ENST00000460900 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
CRIP1-204ENST00000460900 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
CRIP1-204ENST00000460900 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.53■■■■□ 3.44
CRIP1-204ENST00000460900 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.52■■■■□ 3.44
CRIP1-204ENST00000460900 NEO1Q92859 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
CRIP1-204ENST00000460900 KIF14Q15058 1648 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP1-204ENST00000460900 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.47■■■■□ 3.43
CRIP1-204ENST00000460900 FANCAO15360 1455 aa36.41■■■■□ 3.42
CRIP1-204ENST00000460900 PLCH2O75038 1416 aa36.39■■■■□ 3.42
CRIP1-204ENST00000460900 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP1-204ENST00000460900 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.37■■■■□ 3.41
CRIP1-204ENST00000460900 AKNAQ7Z591 1439 aa36.36■■■■□ 3.41
CRIP1-204ENST00000460900 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.32■■■■□ 3.4
CRIP1-204ENST00000460900 RAPGEF3O95398 923 aa36.32■■■■□ 3.4
CRIP1-204ENST00000460900 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.31■■■■□ 3.4
CRIP1-204ENST00000460900 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.28■■■■□ 3.4
CRIP1-204ENST00000460900 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CRIP1-204ENST00000460900 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.24■■■■□ 3.39
CRIP1-204ENST00000460900 ADGRL1O94910 1474 aa36.22■■■■□ 3.39
CRIP1-204ENST00000460900 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.19■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.18■■■■□ 3.38
CRIP1-204ENST00000460900 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms