RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.07■□□□□ 0.96
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PTPRN-210ENST00000460801 TIAM1Q13009 1591 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRN-210ENST00000460801 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRN-210ENST00000460801 WDR62O43379 1518 aa21.01■□□□□ 0.95
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PTPRN-210ENST00000460801 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21■□□□□ 0.95
PTPRN-210ENST00000460801 P3H3Q8IVL6 736 aa20.99■□□□□ 0.95
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PTPRN-210ENST00000460801 SAMD9Q5K651 1589 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRN-210ENST00000460801 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRN-210ENST00000460801 GRIN2BQ13224 1484 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRN-210ENST00000460801 ADAMTS12P58397 1594 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRN-210ENST00000460801 FMN1Q68DA7 1419 aa20.91■□□□□ 0.94
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PTPRN-210ENST00000460801 ERCC6Q03468 1493 aa20.88■□□□□ 0.93
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PTPRN-210ENST00000460801 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRN-210ENST00000460801 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRN-210ENST00000460801 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PTPRN-210ENST00000460801 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.74■□□□□ 0.91
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PTPRN-210ENST00000460801 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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PTPRN-210ENST00000460801 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRN-210ENST00000460801 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRN-210ENST00000460801 HECW1Q76N89 1606 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRN-210ENST00000460801 SYNJ2O15056 1496 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRN-210ENST00000460801 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRN-210ENST00000460801 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.61■□□□□ 0.89
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PTPRN-210ENST00000460801 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRN-210ENST00000460801 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PTPRN-210ENST00000460801 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PTPRN-210ENST00000460801 HFM1A2PYH4 1435 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRN-210ENST00000460801 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRN-210ENST00000460801 MIA2Q96PC5 1412 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRN-210ENST00000460801 ARID3CA6NKF2 412 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRN-210ENST00000460801 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRN-210ENST00000460801 NAIPQ13075 1403 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRN-210ENST00000460801 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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PTPRN-210ENST00000460801 CHD1O14646 1710 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRN-210ENST00000460801 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRN-210ENST00000460801 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRN-210ENST00000460801 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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PTPRN-210ENST00000460801 ATP10BO94823 1461 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 KIF14Q15058 1648 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 ROCK1Q13464 1354 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 SHROOM2Q13796 1616 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 ABCC5O15440 1437 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 PTPRGP23470 1445 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRN-210ENST00000460801 KDM6BO15054 1643 aa20.13■□□□□ 0.81
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