RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 NUP160Q12769 1436 aa37.46■■■■□ 3.59
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C9orf3-209ENST00000460573 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.31■■■■□ 3.56
C9orf3-209ENST00000460573 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.29■■■■□ 3.56
C9orf3-209ENST00000460573 SHROOM2Q13796 1616 aa37.28■■■■□ 3.56
C9orf3-209ENST00000460573 PRXQ9BXM0 1461 aa37.26■■■■□ 3.56
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C9orf3-209ENST00000460573 JPH4Q96JJ6 628 aa37.16■■■■□ 3.54
C9orf3-209ENST00000460573 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.11■■■■□ 3.53
C9orf3-209ENST00000460573 KIF21BO75037 1637 aa37.01■■■■□ 3.52
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C9orf3-209ENST00000460573 GOLGA3Q08378 1498 aa36.83■■■■□ 3.49
C9orf3-209ENST00000460573 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.47
C9orf3-209ENST00000460573 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.75■■■■□ 3.47
C9orf3-209ENST00000460573 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.75■■■■□ 3.47
C9orf3-209ENST00000460573 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
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C9orf3-209ENST00000460573 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.66■■■■□ 3.46
C9orf3-209ENST00000460573 PTPRGP23470 1445 aa36.65■■■■□ 3.46
C9orf3-209ENST00000460573 DISP1Q96F81 1524 aa36.62■■■■□ 3.45
C9orf3-209ENST00000460573 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.62■■■■□ 3.45
C9orf3-209ENST00000460573 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.6■■■■□ 3.45
C9orf3-209ENST00000460573 KIAA0556O60303 1618 aa36.56■■■■□ 3.44
C9orf3-209ENST00000460573 MAPKBP1O60336 1514 aa36.55■■■■□ 3.44
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C9orf3-209ENST00000460573 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.48■■■■□ 3.43
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C9orf3-209ENST00000460573 DIP2BQ9P265 1576 aa36.42■■■■□ 3.42
C9orf3-209ENST00000460573 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.41■■■■□ 3.42
C9orf3-209ENST00000460573 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
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C9orf3-209ENST00000460573 UACAQ9BZF9 1416 aa36.36■■■■□ 3.41
C9orf3-209ENST00000460573 P3H3Q8IVL6 736 aa36.34■■■■□ 3.41
C9orf3-209ENST00000460573 TSPOAP1O95153 1857 aa36.31■■■■□ 3.4
C9orf3-209ENST00000460573 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf3-209ENST00000460573 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.29■■■■□ 3.4
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C9orf3-209ENST00000460573 ASXL2Q76L83 1435 aa36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-209ENST00000460573 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-209ENST00000460573 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-209ENST00000460573 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.23■■■■□ 3.39
C9orf3-209ENST00000460573 CLIP1P30622 1438 aa36.17■■■■□ 3.38
C9orf3-209ENST00000460573 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
C9orf3-209ENST00000460573 ABCA8O94911 1581 aa36.14■■■■□ 3.38
C9orf3-209ENST00000460573 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.13■■■■□ 3.37
C9orf3-209ENST00000460573 KDM6BO15054 1643 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf3-209ENST00000460573 CEP162Q5TB80 1403 aa36.09■■■■□ 3.37
C9orf3-209ENST00000460573 FMN1Q68DA7 1419 aa36.09■■■■□ 3.37
C9orf3-209ENST00000460573 GLI2P10070 1586 aa36.05■■■■□ 3.36
C9orf3-209ENST00000460573 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.02■■■■□ 3.36
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C9orf3-209ENST00000460573 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.88■■■■□ 3.33
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C9orf3-209ENST00000460573 KCNH8Q96L42 1107 aa35.85■■■■□ 3.33
C9orf3-209ENST00000460573 ATP10BO94823 1461 aa35.85■■■■□ 3.33
C9orf3-209ENST00000460573 HECW1Q76N89 1606 aa35.83■■■■□ 3.33
C9orf3-209ENST00000460573 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.83■■■■□ 3.33
C9orf3-209ENST00000460573 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
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C9orf3-209ENST00000460573 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
C9orf3-209ENST00000460573 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.75■■■■□ 3.31
C9orf3-209ENST00000460573 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
C9orf3-209ENST00000460573 CD109Q6YHK3 1445 aa35.72■■■■□ 3.31
C9orf3-209ENST00000460573 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.66■■■■□ 3.3
C9orf3-209ENST00000460573 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.66■■■■□ 3.3
C9orf3-209ENST00000460573 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.65■■■■□ 3.3
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C9orf3-209ENST00000460573 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
C9orf3-209ENST00000460573 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf3-209ENST00000460573 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.45■■■■□ 3.27
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C9orf3-209ENST00000460573 MAP3K1Q13233 1512 aa35.35■■■■□ 3.25
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C9orf3-209ENST00000460573 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.32■■■■□ 3.24
C9orf3-209ENST00000460573 TIAM1Q13009 1591 aa35.32■■■■□ 3.24
C9orf3-209ENST00000460573 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.31■■■■□ 3.24
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C9orf3-209ENST00000460573 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
C9orf3-209ENST00000460573 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.3■■■■□ 3.24
C9orf3-209ENST00000460573 NEO1Q92859 1461 aa35.28■■■■□ 3.24
C9orf3-209ENST00000460573 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.24■■■■□ 3.23
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C9orf3-209ENST00000460573 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.2■■■■□ 3.23
C9orf3-209ENST00000460573 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.18■■■■□ 3.22
C9orf3-209ENST00000460573 RAPGEF3O95398 923 aa35.16■■■■□ 3.22
C9orf3-209ENST00000460573 PLCH2O75038 1416 aa35.15■■■■□ 3.22
C9orf3-209ENST00000460573 FANCAO15360 1455 aa35.13■■■■□ 3.21
C9orf3-209ENST00000460573 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
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