RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460231.5

PCNP-202, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNP, Length 2,165 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-202ENST00000460231 ARAP1Q96P48 1450 aa22.83■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.82■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 GRIN2AQ12879 1464 aa22.82■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 P3H3Q8IVL6 736 aa22.82■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PCNP-202ENST00000460231 CEP170Q5SW79 1584 aa22.76■■□□□ 1.23
PCNP-202ENST00000460231 CHD1O14646 1710 aa22.7■■□□□ 1.23
PCNP-202ENST00000460231 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.7■■□□□ 1.22
PCNP-202ENST00000460231 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PCNP-202ENST00000460231 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.67■■□□□ 1.22
PCNP-202ENST00000460231 IQGAP2Q13576 1575 aa22.66■■□□□ 1.22
PCNP-202ENST00000460231 NUP160Q12769 1436 aa22.65■■□□□ 1.22
PCNP-202ENST00000460231 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.62■■□□□ 1.21
PCNP-202ENST00000460231 SAMD9Q5K651 1589 aa22.61■■□□□ 1.21
PCNP-202ENST00000460231 DISP1Q96F81 1524 aa22.55■■□□□ 1.2
PCNP-202ENST00000460231 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
PCNP-202ENST00000460231 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.54■■□□□ 1.2
PCNP-202ENST00000460231 JPH4Q96JJ6 628 aa22.51■■□□□ 1.19
PCNP-202ENST00000460231 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PCNP-202ENST00000460231 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PCNP-202ENST00000460231 KIAA0556O60303 1618 aa22.46■■□□□ 1.19
PCNP-202ENST00000460231 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.45■■□□□ 1.18
PCNP-202ENST00000460231 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PCNP-202ENST00000460231 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.45■■□□□ 1.18
PCNP-202ENST00000460231 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.41■■□□□ 1.18
PCNP-202ENST00000460231 ARID3CA6NKF2 412 aa22.4■■□□□ 1.18
PCNP-202ENST00000460231 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.39■■□□□ 1.17
PCNP-202ENST00000460231 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PCNP-202ENST00000460231 FMN1Q68DA7 1419 aa22.36■■□□□ 1.17
PCNP-202ENST00000460231 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.36■■□□□ 1.17
PCNP-202ENST00000460231 SHROOM2Q13796 1616 aa22.34■■□□□ 1.17
PCNP-202ENST00000460231 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.32■■□□□ 1.16
PCNP-202ENST00000460231 APLP2Q06481 763 aa22.32■■□□□ 1.16
PCNP-202ENST00000460231 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.32■■□□□ 1.16
PCNP-202ENST00000460231 TIAM1Q13009 1591 aa22.31■■□□□ 1.16
PCNP-202ENST00000460231 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PCNP-202ENST00000460231 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.27■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.24■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 OSCARQ8IYS5 282 aa22.23■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.23■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
PCNP-202ENST00000460231 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.2■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 PTPRGP23470 1445 aa22.18■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 MAP3K1Q13233 1512 aa22.18■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 HECW1Q76N89 1606 aa22.16■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 ABCA8O94911 1581 aa22.15■■□□□ 1.14
PCNP-202ENST00000460231 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.12■■□□□ 1.13
PCNP-202ENST00000460231 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.07■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 ATP10BO94823 1461 aa22.06■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.06■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 UACAQ9BZF9 1416 aa22.03■■□□□ 1.12
PCNP-202ENST00000460231 NCOA2Q15596 1464 aa22■■□□□ 1.11
PCNP-202ENST00000460231 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.98■■□□□ 1.11
PCNP-202ENST00000460231 ABCC2Q92887 1545 aa21.97■■□□□ 1.11
PCNP-202ENST00000460231 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PCNP-202ENST00000460231 KIF14Q15058 1648 aa21.95■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.95■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 ARHGEF11O15085 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.92■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 ITGAEP38570 1179 aa21.91■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PCNP-202ENST00000460231 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.87■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.85■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.84■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.84■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PCNP-202ENST00000460231 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.82■■□□□ 1.08
PCNP-202ENST00000460231 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PCNP-202ENST00000460231 KCNH8Q96L42 1107 aa21.8■■□□□ 1.08
PCNP-202ENST00000460231 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.78■■□□□ 1.08
PCNP-202ENST00000460231 PTPRKQ15262 1439 aa21.78■■□□□ 1.08
PCNP-202ENST00000460231 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PCNP-202ENST00000460231 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.76■■□□□ 1.07
PCNP-202ENST00000460231 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.74■■□□□ 1.07
PCNP-202ENST00000460231 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.73■■□□□ 1.07
PCNP-202ENST00000460231 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.073e-6■□□□□ 8.5
PCNP-202ENST00000460231 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 ASXL2Q76L83 1435 aa21.68■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.66■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 MIA2Q96PC5 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.65■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.64■■□□□ 1.06
PCNP-202ENST00000460231 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PCNP-202ENST00000460231 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.63■■□□□ 1.05
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