RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 JPH4Q96JJ6 628 aa40.52■■■■■ 4.08
HOXB3-202ENST00000460160 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.47■■■■■ 4.07
HOXB3-202ENST00000460160 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
HOXB3-202ENST00000460160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.28■■■■■ 4.04
HOXB3-202ENST00000460160 IQGAP2Q13576 1575 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXB3-202ENST00000460160 PRXQ9BXM0 1461 aa40.05■■■■■ 4
HOXB3-202ENST00000460160 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.01■■■■■ 4
HOXB3-202ENST00000460160 ADCY10Q96PN6 1610 aa40■■■■□ 3.99
HOXB3-202ENST00000460160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.97■■■■□ 3.99
HOXB3-202ENST00000460160 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.97■■■■□ 3.99
HOXB3-202ENST00000460160 DISP1Q96F81 1524 aa39.96■■■■□ 3.99
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRGP23470 1445 aa39.95■■■■□ 3.99
HOXB3-202ENST00000460160 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.94■■■■□ 3.98
HOXB3-202ENST00000460160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.86■■■■□ 3.97
HOXB3-202ENST00000460160 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
HOXB3-202ENST00000460160 EEA1Q15075 1411 aa39.83■■■■□ 3.97
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0556O60303 1618 aa39.83■■■■□ 3.97
HOXB3-202ENST00000460160 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
HOXB3-202ENST00000460160 MAPKBP1O60336 1514 aa39.8■■■■□ 3.96
HOXB3-202ENST00000460160 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXB3-202ENST00000460160 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.74■■■■□ 3.95
HOXB3-202ENST00000460160 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC2Q92887 1545 aa39.68■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 UACAQ9BZF9 1416 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA3Q08378 1498 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.67■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
HOXB3-202ENST00000460160 DIP2BQ9P265 1576 aa39.61■■■■□ 3.93
HOXB3-202ENST00000460160 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.56■■■■□ 3.92
HOXB3-202ENST00000460160 KIF21BO75037 1637 aa39.51■■■■□ 3.92
HOXB3-202ENST00000460160 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.51■■■■□ 3.92
HOXB3-202ENST00000460160 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-202ENST00000460160 ASXL2Q76L83 1435 aa39.47■■■■□ 3.91
HOXB3-202ENST00000460160 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
HOXB3-202ENST00000460160 SAMD9Q5K651 1589 aa39.43■■■■□ 3.9
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA8O94911 1581 aa39.42■■■■□ 3.9
HOXB3-202ENST00000460160 P3H3Q8IVL6 736 aa39.36■■■■□ 3.89
HOXB3-202ENST00000460160 TSPOAP1O95153 1857 aa39.33■■■■□ 3.89
HOXB3-202ENST00000460160 GLI2P10070 1586 aa39.3■■■■□ 3.88
HOXB3-202ENST00000460160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
HOXB3-202ENST00000460160 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
HOXB3-202ENST00000460160 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.2■■■■□ 3.87
HOXB3-202ENST00000460160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.17■■■■□ 3.86
HOXB3-202ENST00000460160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.16■■■■□ 3.86
HOXB3-202ENST00000460160 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.14■■■■□ 3.86
HOXB3-202ENST00000460160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.12■■■■□ 3.85
HOXB3-202ENST00000460160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.12■■■■□ 3.85
HOXB3-202ENST00000460160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
HOXB3-202ENST00000460160 ATP10BO94823 1461 aa39.08■■■■□ 3.85
HOXB3-202ENST00000460160 KDM6BO15054 1643 aa39.07■■■■□ 3.85
HOXB3-202ENST00000460160 ARID3CA6NKF2 412 aa39.06■■■■□ 3.84
HOXB3-202ENST00000460160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
HOXB3-202ENST00000460160 KCNH8Q96L42 1107 aa38.97■■■■□ 3.83
HOXB3-202ENST00000460160 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXB3-202ENST00000460160 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.92■■■■□ 3.82
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.9■■■■□ 3.82
HOXB3-202ENST00000460160 CD109Q6YHK3 1445 aa38.86■■■■□ 3.81
HOXB3-202ENST00000460160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.83■■■■□ 3.81
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
HOXB3-202ENST00000460160 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
HOXB3-202ENST00000460160 FMN1Q68DA7 1419 aa38.76■■■■□ 3.8
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.76■■■■□ 3.8
HOXB3-202ENST00000460160 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
HOXB3-202ENST00000460160 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.65■■■■□ 3.78
HOXB3-202ENST00000460160 HECW1Q76N89 1606 aa38.65■■■■□ 3.78
HOXB3-202ENST00000460160 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
HOXB3-202ENST00000460160 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
HOXB3-202ENST00000460160 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.52■■■■□ 3.76
HOXB3-202ENST00000460160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.51■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.5■■■■□ 3.751e-8■■□□□ 11.7
HOXB3-202ENST00000460160 CLIP1P30622 1438 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 NEO1Q92859 1461 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.46■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
HOXB3-202ENST00000460160 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXB3-202ENST00000460160 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.38■■■■□ 3.74
HOXB3-202ENST00000460160 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
HOXB3-202ENST00000460160 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.32■■■■□ 3.73
HOXB3-202ENST00000460160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
HOXB3-202ENST00000460160 FANCAO15360 1455 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 KIF14Q15058 1648 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.31■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 RAPGEF3O95398 923 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 AKNAQ7Z591 1439 aa38.26■■■■□ 3.72
HOXB3-202ENST00000460160 PLCH2O75038 1416 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-202ENST00000460160 ADGRL1O94910 1474 aa38.25■■■■□ 3.71
HOXB3-202ENST00000460160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXB3-202ENST00000460160 CEP162Q5TB80 1403 aa38.23■■■■□ 3.71
HOXB3-202ENST00000460160 RICTORQ6R327 1708 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXB3-202ENST00000460160 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
HOXB3-202ENST00000460160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.07■■■■□ 3.69
HOXB3-202ENST00000460160 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.04■■■■□ 3.68
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