RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	CEP170	Q5SW79	1584 aa		19.39	■□□□□ 0.69
TCL6-204	ENST00000460130	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		19.38	■□□□□ 0.69
TCL6-204	ENST00000460130	NUP160	Q12769	1436 aa		19.36	■□□□□ 0.69
TCL6-204	ENST00000460130	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		19.35	■□□□□ 0.69
TCL6-204	ENST00000460130	CLIP1	P30622	1438 aa		19.34	■□□□□ 0.69
TCL6-204	ENST00000460130	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		19.3	■□□□□ 0.68
TCL6-204	ENST00000460130	IQGAP2	Q13576	1575 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TCL6-204	ENST00000460130	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		19.27	■□□□□ 0.68
TCL6-204	ENST00000460130	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	19.27	■□□□□ 0.68
TCL6-204	ENST00000460130	ARAP1	Q96P48	1450 aa		19.25	■□□□□ 0.67
TCL6-204	ENST00000460130	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		19.24	■□□□□ 0.67
TCL6-204	ENST00000460130	JPH4	Q96JJ6	628 aa		19.22	■□□□□ 0.67
TCL6-204	ENST00000460130	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		19.18	■□□□□ 0.66
TCL6-204	ENST00000460130	SHROOM2	Q13796	1616 aa		19.18	■□□□□ 0.66
TCL6-204	ENST00000460130	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		19.16	■□□□□ 0.66
TCL6-204	ENST00000460130	P3H3	Q8IVL6	736 aa		19.13	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	SAMD9	Q5K651	1589 aa		19.12	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		19.1	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		19.1	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	DISP1	Q96F81	1524 aa		19.1	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	KIAA0556	O60303	1618 aa		19.09	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		19.08	■□□□□ 0.65
TCL6-204	ENST00000460130	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	19.04	■□□□□ 0.64
TCL6-204	ENST00000460130	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		19.03	■□□□□ 0.64
TCL6-204	ENST00000460130	ARHGEF11	O15085	1522 aa		19.01	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		19	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		19	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		19	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	PTPRG	P23470	1445 aa		18.96	■□□□□ 0.63
TCL6-204	ENST00000460130	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		18.94	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	MAP3K1	Q13233	1512 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	FMN1	Q68DA7	1419 aa		18.91	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		18.9	■□□□□ 0.62
TCL6-204	ENST00000460130	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		18.89	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		18.88	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	TIAM1	Q13009	1591 aa		18.88	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		18.87	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		18.86	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	ABCA8	O94911	1581 aa		18.85	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	UACA	Q9BZF9	1416 aa		18.84	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
TCL6-204	ENST00000460130	HECW1	Q76N89	1606 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TCL6-204	ENST00000460130	ARID3C	A6NKF2	412 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TCL6-204	ENST00000460130	ABCC2	Q92887	1545 aa		18.79	■□□□□ 0.6
TCL6-204	ENST00000460130	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TCL6-204	ENST00000460130	APLP2	Q06481	763 aa		18.78	■□□□□ 0.6
TCL6-204	ENST00000460130	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		18.77	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		18.77	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	ATP10B	O94823	1461 aa		18.71	■□□□□ 0.59
TCL6-204	ENST00000460130	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	18.7	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		18.69	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		18.68	■□□□□ 0.58
TCL6-204	ENST00000460130	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
TCL6-204	ENST00000460130	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TCL6-204	ENST00000460130	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TCL6-204	ENST00000460130	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TCL6-204	ENST00000460130	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TCL6-204	ENST00000460130	ASXL2	Q76L83	1435 aa		18.57	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		18.56	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	KCNH8	Q96L42	1107 aa		18.55	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	MAPKBP1	O60336	1514 aa		18.54	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	NCOA2	Q15596	1464 aa		18.53	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		18.52	■□□□□ 0.56
TCL6-204	ENST00000460130	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TCL6-204	ENST00000460130	KIF14	Q15058	1648 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TCL6-204	ENST00000460130	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		18.45	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		18.44	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	18.43	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		18.42	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	DIP2B	Q9P265	1576 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	HRC	P23327	699 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.54
TCL6-204	ENST00000460130	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TCL6-204	ENST00000460130	GLI2	P10070	1586 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TCL6-204	ENST00000460130	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TCL6-204	ENST00000460130	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TCL6-204	ENST00000460130	TSPOAP1	O95153	1857 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TCL6-204	ENST00000460130	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		18.35	■□□□□ 0.53

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