RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454825.1

REXO4-204, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3

Gene REXO4, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-204ENST00000454825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
REXO4-204ENST00000454825 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.18■■■■■ 4.34
REXO4-204ENST00000454825 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.11■■■■■ 4.33
REXO4-204ENST00000454825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
REXO4-204ENST00000454825 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.87■■■■■ 4.29
REXO4-204ENST00000454825 IQGAP2Q13576 1575 aa41.82■■■■■ 4.29
REXO4-204ENST00000454825 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.69■■■■■ 4.27
REXO4-204ENST00000454825 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.63■■■■■ 4.26
REXO4-204ENST00000454825 PRXQ9BXM0 1461 aa41.61■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 PTPRGP23470 1445 aa41.6■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 DISP1Q96F81 1524 aa41.59■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.58■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.58■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.57■■■■■ 4.25
REXO4-204ENST00000454825 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.55■■■■■ 4.24
REXO4-204ENST00000454825 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
REXO4-204ENST00000454825 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.23
REXO4-204ENST00000454825 MAPKBP1O60336 1514 aa41.48■■■■■ 4.23
REXO4-204ENST00000454825 KIAA0556O60303 1618 aa41.44■■■■■ 4.22
REXO4-204ENST00000454825 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.4■■■■■ 4.22
REXO4-204ENST00000454825 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.35■■■■■ 4.21
REXO4-204ENST00000454825 ABCC2Q92887 1545 aa41.32■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.31■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 EEA1Q15075 1411 aa41.31■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 DIP2BQ9P265 1576 aa41.31■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 UACAQ9BZF9 1416 aa41.3■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.27■■■■■ 4.2
REXO4-204ENST00000454825 GOLGA3Q08378 1498 aa41.23■■■■■ 4.19
REXO4-204ENST00000454825 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.2■■■■■ 4.19
REXO4-204ENST00000454825 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
REXO4-204ENST00000454825 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.13■■■■■ 4.18
REXO4-204ENST00000454825 ASXL2Q76L83 1435 aa41.12■■■■■ 4.17
REXO4-204ENST00000454825 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
REXO4-204ENST00000454825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
REXO4-204ENST00000454825 TSPOAP1O95153 1857 aa41.06■■■■■ 4.16
REXO4-204ENST00000454825 ABCA8O94911 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
REXO4-204ENST00000454825 KIF21BO75037 1637 aa41.02■■■■■ 4.16
REXO4-204ENST00000454825 SAMD9Q5K651 1589 aa40.99■■■■■ 4.15
REXO4-204ENST00000454825 P3H3Q8IVL6 736 aa40.98■■■■■ 4.15
REXO4-204ENST00000454825 GLI2P10070 1586 aa40.95■■■■■ 4.15
REXO4-204ENST00000454825 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
REXO4-204ENST00000454825 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
REXO4-204ENST00000454825 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
REXO4-204ENST00000454825 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.81■■■■■ 4.12
REXO4-204ENST00000454825 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.78■■■■■ 4.12
REXO4-204ENST00000454825 KDM6BO15054 1643 aa40.78■■■■■ 4.12
REXO4-204ENST00000454825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.72■■■■■ 4.11
REXO4-204ENST00000454825 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.71■■■■■ 4.11
REXO4-204ENST00000454825 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.71■■■■■ 4.11
REXO4-204ENST00000454825 ATP10BO94823 1461 aa40.69■■■■■ 4.1
REXO4-204ENST00000454825 ARID3CA6NKF2 412 aa40.68■■■■■ 4.1
REXO4-204ENST00000454825 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.65■■■■■ 4.1
REXO4-204ENST00000454825 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
REXO4-204ENST00000454825 KCNH8Q96L42 1107 aa40.6■■■■■ 4.09
REXO4-204ENST00000454825 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
REXO4-204ENST00000454825 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.56■■■■■ 4.08
REXO4-204ENST00000454825 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.53■■■■■ 4.08
REXO4-204ENST00000454825 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
REXO4-204ENST00000454825 CD109Q6YHK3 1445 aa40.49■■■■■ 4.07
REXO4-204ENST00000454825 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.45■■■■■ 4.07
REXO4-204ENST00000454825 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.41■■■■■ 4.06
REXO4-204ENST00000454825 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
REXO4-204ENST00000454825 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
REXO4-204ENST00000454825 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.37■■■■■ 4.05
REXO4-204ENST00000454825 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
REXO4-204ENST00000454825 FMN1Q68DA7 1419 aa40.25■■■■■ 4.03
REXO4-204ENST00000454825 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
REXO4-204ENST00000454825 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.21■■■■■ 4.03
REXO4-204ENST00000454825 HECW1Q76N89 1606 aa40.17■■■■■ 4.02
REXO4-204ENST00000454825 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.12■■■■■ 4.01
REXO4-204ENST00000454825 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.12■■■■■ 4.01
REXO4-204ENST00000454825 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
REXO4-204ENST00000454825 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
REXO4-204ENST00000454825 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.08■■■■■ 4.01
REXO4-204ENST00000454825 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.05■■■■■ 4
REXO4-204ENST00000454825 NEO1Q92859 1461 aa40.04■■■■■ 4
REXO4-204ENST00000454825 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.03■■■■■ 4
REXO4-204ENST00000454825 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
REXO4-204ENST00000454825 CLIP1P30622 1438 aa39.95■■■■□ 3.99
REXO4-204ENST00000454825 ADGRL1O94910 1474 aa39.94■■■■□ 3.98
REXO4-204ENST00000454825 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.91■■■■□ 3.98
REXO4-204ENST00000454825 RAPGEF3O95398 923 aa39.9■■■■□ 3.98
REXO4-204ENST00000454825 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.89■■■■□ 3.98
REXO4-204ENST00000454825 FANCAO15360 1455 aa39.88■■■■□ 3.98
REXO4-204ENST00000454825 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
REXO4-204ENST00000454825 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.87■■■■□ 3.97
REXO4-204ENST00000454825 KIF14Q15058 1648 aa39.87■■■■□ 3.97
REXO4-204ENST00000454825 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
REXO4-204ENST00000454825 AKNAQ7Z591 1439 aa39.84■■■■□ 3.97
REXO4-204ENST00000454825 PLCH2O75038 1416 aa39.8■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 RICTORQ6R327 1708 aa39.79■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.79■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.79■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.79■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
REXO4-204ENST00000454825 CEP162Q5TB80 1403 aa39.65■■■■□ 3.94
REXO4-204ENST00000454825 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.61■■■■□ 3.93
REXO4-204ENST00000454825 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.61■■■■□ 3.93
REXO4-204ENST00000454825 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.6■■■■□ 3.93
REXO4-204ENST00000454825 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.6■■■■□ 3.93
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