RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 JPH4Q96JJ6 628 aa44.09■■■■■ 4.65
CITED1-210ENST00000454225 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.64
CITED1-210ENST00000454225 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44■■■■■ 4.63
CITED1-210ENST00000454225 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
CITED1-210ENST00000454225 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.83■■■■■ 4.61
CITED1-210ENST00000454225 IQGAP2Q13576 1575 aa43.71■■■■■ 4.59
CITED1-210ENST00000454225 PRXQ9BXM0 1461 aa43.56■■■■■ 4.56
CITED1-210ENST00000454225 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.56■■■■■ 4.56
CITED1-210ENST00000454225 PTPRGP23470 1445 aa43.48■■■■■ 4.55
CITED1-210ENST00000454225 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
CITED1-210ENST00000454225 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.45■■■■■ 4.55
CITED1-210ENST00000454225 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.45■■■■■ 4.55
CITED1-210ENST00000454225 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.45■■■■■ 4.55
CITED1-210ENST00000454225 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.44■■■■■ 4.54
CITED1-210ENST00000454225 DISP1Q96F81 1524 aa43.43■■■■■ 4.54
CITED1-210ENST00000454225 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.42■■■■■ 4.54
CITED1-210ENST00000454225 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
CITED1-210ENST00000454225 EEA1Q15075 1411 aa43.36■■■■■ 4.53
CITED1-210ENST00000454225 KIAA0556O60303 1618 aa43.31■■■■■ 4.52
CITED1-210ENST00000454225 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.3■■■■■ 4.52
CITED1-210ENST00000454225 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
CITED1-210ENST00000454225 MAPKBP1O60336 1514 aa43.23■■■■■ 4.51
CITED1-210ENST00000454225 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.18■■■■■ 4.5
CITED1-210ENST00000454225 UACAQ9BZF9 1416 aa43.16■■■■■ 4.5
CITED1-210ENST00000454225 GOLGA3Q08378 1498 aa43.16■■■■■ 4.5
CITED1-210ENST00000454225 ABCC2Q92887 1545 aa43.13■■■■■ 4.5
CITED1-210ENST00000454225 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.13■■■■■ 4.49
CITED1-210ENST00000454225 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.11■■■■■ 4.49
CITED1-210ENST00000454225 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.07■■■■■ 4.49
CITED1-210ENST00000454225 DIP2BQ9P265 1576 aa43.04■■■■■ 4.48
CITED1-210ENST00000454225 KIF21BO75037 1637 aa42.97■■■■■ 4.47
CITED1-210ENST00000454225 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.94■■■■■ 4.47
CITED1-210ENST00000454225 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.92■■■■■ 4.46
CITED1-210ENST00000454225 ASXL2Q76L83 1435 aa42.92■■■■■ 4.46
CITED1-210ENST00000454225 P3H3Q8IVL6 736 aa42.91■■■■■ 4.46
CITED1-210ENST00000454225 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
CITED1-210ENST00000454225 ABCA8O94911 1581 aa42.86■■■■■ 4.45
CITED1-210ENST00000454225 SAMD9Q5K651 1589 aa42.86■■■■■ 4.45
CITED1-210ENST00000454225 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
CITED1-210ENST00000454225 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.78■■■■■ 4.44
CITED1-210ENST00000454225 TSPOAP1O95153 1857 aa42.74■■■■■ 4.43
CITED1-210ENST00000454225 GLI2P10070 1586 aa42.69■■■■■ 4.42
CITED1-210ENST00000454225 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
CITED1-210ENST00000454225 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
CITED1-210ENST00000454225 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.63■■■■■ 4.42
CITED1-210ENST00000454225 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.63■■■■■ 4.42
CITED1-210ENST00000454225 ARID3CA6NKF2 412 aa42.59■■■■■ 4.41
CITED1-210ENST00000454225 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.57■■■■■ 4.41
CITED1-210ENST00000454225 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.55■■■■■ 4.4
CITED1-210ENST00000454225 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
CITED1-210ENST00000454225 ATP10BO94823 1461 aa42.5■■■■■ 4.39
CITED1-210ENST00000454225 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.49■■■■■ 4.39
CITED1-210ENST00000454225 KDM6BO15054 1643 aa42.48■■■■■ 4.39
CITED1-210ENST00000454225 KCNH8Q96L42 1107 aa42.45■■■■■ 4.39
CITED1-210ENST00000454225 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
CITED1-210ENST00000454225 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
CITED1-210ENST00000454225 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
CITED1-210ENST00000454225 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.32■■■■■ 4.37
CITED1-210ENST00000454225 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.32■■■■■ 4.37
CITED1-210ENST00000454225 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.29■■■■■ 4.36
CITED1-210ENST00000454225 CD109Q6YHK3 1445 aa42.29■■■■■ 4.36
CITED1-210ENST00000454225 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.2■■■■■ 4.35
CITED1-210ENST00000454225 FMN1Q68DA7 1419 aa42.19■■■■■ 4.34
CITED1-210ENST00000454225 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
CITED1-210ENST00000454225 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.12■■■■■ 4.33
CITED1-210ENST00000454225 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.09■■■■■ 4.33
CITED1-210ENST00000454225 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
CITED1-210ENST00000454225 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
CITED1-210ENST00000454225 HECW1Q76N89 1606 aa42.06■■■■■ 4.32
CITED1-210ENST00000454225 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
CITED1-210ENST00000454225 CLIP1P30622 1438 aa41.93■■■■■ 4.3
CITED1-210ENST00000454225 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.85■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.83■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.82■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.82■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 NEO1Q92859 1461 aa41.82■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.82■■■■■ 4.29
CITED1-210ENST00000454225 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
CITED1-210ENST00000454225 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.71■■■■■ 4.27
CITED1-210ENST00000454225 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CITED1-210ENST00000454225 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.7■■■■■ 4.27
CITED1-210ENST00000454225 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
CITED1-210ENST00000454225 FANCAO15360 1455 aa41.68■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 KIF14Q15058 1648 aa41.66■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 RAPGEF3O95398 923 aa41.66■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.65■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 CEP162Q5TB80 1403 aa41.64■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 AKNAQ7Z591 1439 aa41.63■■■■■ 4.26
CITED1-210ENST00000454225 PLCH2O75038 1416 aa41.6■■■■■ 4.25
CITED1-210ENST00000454225 ADGRL1O94910 1474 aa41.59■■■■■ 4.25
CITED1-210ENST00000454225 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.58■■■■■ 4.25
CITED1-210ENST00000454225 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.57■■■■■ 4.25
CITED1-210ENST00000454225 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.56■■■■■ 4.24
CITED1-210ENST00000454225 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
CITED1-210ENST00000454225 RICTORQ6R327 1708 aa41.48■■■■■ 4.23
CITED1-210ENST00000454225 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.45■■■■■ 4.23
CITED1-210ENST00000454225 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.42■■■■■ 4.22
CITED1-210ENST00000454225 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.4■■■■■ 4.22
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