RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.55■■■■■ 4.88
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.29■■■■■ 4.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIP2BQ9P265 1576 aa44.75■■■■■ 4.75
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.06■■■■■ 4.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.06■■■■■ 4.64
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P3H3Q8IVL6 736 aa43.98■■■■■ 4.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.96■■■■■ 4.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD9Q5K651 1589 aa43.89■■■■■ 4.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH8Q96L42 1107 aa43.85■■■■■ 4.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.39■■■■■ 4.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.38■■■■■ 4.54
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEO1Q92859 1461 aa43.25■■■■■ 4.51
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMN1Q68DA7 1419 aa43.13■■■■■ 4.49
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.82■■■■■ 4.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.8■■■■■ 4.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.78■■■■■ 4.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.74■■■■■ 4.43
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.74■■■■■ 4.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.74■■■■■ 4.43
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.72■■■■■ 4.43
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.69■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.68■■■■■ 4.42
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