RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448576.6

GATAD2A-209, Transcript of GATA zinc finger domain containing 2A, humanhuman

TSL 3

Gene GATAD2A, Length 271 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2A-209ENST00000448576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.51
GATAD2A-209ENST00000448576 JPH4Q96JJ6 628 aa49.43■■■■■ 5.5
GATAD2A-209ENST00000448576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.32■■■■■ 5.49
GATAD2A-209ENST00000448576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.22■■■■■ 5.47
GATAD2A-209ENST00000448576 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.02■■■■■ 5.44
GATAD2A-209ENST00000448576 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.01■■■■■ 5.44
GATAD2A-209ENST00000448576 IQGAP2Q13576 1575 aa48.94■■■■■ 5.43
GATAD2A-209ENST00000448576 MAPKBP1O60336 1514 aa48.85■■■■■ 5.41
GATAD2A-209ENST00000448576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.85■■■■■ 5.41
GATAD2A-209ENST00000448576 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.75■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 PTPRGP23470 1445 aa48.73■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.72■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 DIP2BQ9P265 1576 aa48.69■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 DISP1Q96F81 1524 aa48.69■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.69■■■■■ 5.39
GATAD2A-209ENST00000448576 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.69■■■■■ 5.38
GATAD2A-209ENST00000448576 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.65■■■■■ 5.38
GATAD2A-209ENST00000448576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.59■■■■■ 5.37
GATAD2A-209ENST00000448576 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
GATAD2A-209ENST00000448576 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.54■■■■■ 5.36
GATAD2A-209ENST00000448576 KIAA0556O60303 1618 aa48.53■■■■■ 5.36
GATAD2A-209ENST00000448576 ABCC2Q92887 1545 aa48.52■■■■■ 5.36
GATAD2A-209ENST00000448576 PRXQ9BXM0 1461 aa48.48■■■■■ 5.35
GATAD2A-209ENST00000448576 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.48■■■■■ 5.35
GATAD2A-209ENST00000448576 UACAQ9BZF9 1416 aa48.41■■■■■ 5.34
GATAD2A-209ENST00000448576 TSPOAP1O95153 1857 aa48.33■■■■■ 5.33
GATAD2A-209ENST00000448576 ASXL2Q76L83 1435 aa48.29■■■■■ 5.32
GATAD2A-209ENST00000448576 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.27■■■■■ 5.32
GATAD2A-209ENST00000448576 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.23■■■■■ 5.31
GATAD2A-209ENST00000448576 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
GATAD2A-209ENST00000448576 GOLGA3Q08378 1498 aa48.19■■■■■ 5.31
GATAD2A-209ENST00000448576 GLI2P10070 1586 aa48.18■■■■■ 5.3
GATAD2A-209ENST00000448576 KDM6BO15054 1643 aa48.14■■■■■ 5.3
GATAD2A-209ENST00000448576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
GATAD2A-209ENST00000448576 ABCA8O94911 1581 aa48.06■■■■■ 5.28
GATAD2A-209ENST00000448576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.04■■■■■ 5.28
GATAD2A-209ENST00000448576 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
GATAD2A-209ENST00000448576 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.98■■■■■ 5.27
GATAD2A-209ENST00000448576 EEA1Q15075 1411 aa47.97■■■■■ 5.27
GATAD2A-209ENST00000448576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.95■■■■■ 5.27
GATAD2A-209ENST00000448576 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.89■■■■■ 5.26
GATAD2A-209ENST00000448576 SAMD9Q5K651 1589 aa47.88■■■■■ 5.26
GATAD2A-209ENST00000448576 P3H3Q8IVL6 736 aa47.72■■■■■ 5.23
GATAD2A-209ENST00000448576 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.69■■■■■ 5.22
GATAD2A-209ENST00000448576 KIF21BO75037 1637 aa47.69■■■■■ 5.22
GATAD2A-209ENST00000448576 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
GATAD2A-209ENST00000448576 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.65■■■■■ 5.22
GATAD2A-209ENST00000448576 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
GATAD2A-209ENST00000448576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.59■■■■■ 5.21
GATAD2A-209ENST00000448576 ATP10BO94823 1461 aa47.59■■■■■ 5.21
GATAD2A-209ENST00000448576 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.52■■■■■ 5.2
GATAD2A-209ENST00000448576 CD109Q6YHK3 1445 aa47.5■■■■■ 5.19
GATAD2A-209ENST00000448576 ARID3CA6NKF2 412 aa47.5■■■■■ 5.19
GATAD2A-209ENST00000448576 KCNH8Q96L42 1107 aa47.5■■■■■ 5.19
GATAD2A-209ENST00000448576 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.48■■■■■ 5.19
GATAD2A-209ENST00000448576 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.47■■■■■ 5.19
GATAD2A-209ENST00000448576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.43■■■■■ 5.18
GATAD2A-209ENST00000448576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
GATAD2A-209ENST00000448576 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.4■■■■■ 5.18
GATAD2A-209ENST00000448576 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
GATAD2A-209ENST00000448576 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.36■■■■■ 5.17
GATAD2A-209ENST00000448576 ADGRL1O94910 1474 aa47.2■■■■■ 5.15
GATAD2A-209ENST00000448576 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.15■■■■■ 5.14
GATAD2A-209ENST00000448576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.14
GATAD2A-209ENST00000448576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.13■■■■■ 5.14
GATAD2A-209ENST00000448576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.12■■■■■ 5.13
GATAD2A-209ENST00000448576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
GATAD2A-209ENST00000448576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.03■■■■■ 5.12
GATAD2A-209ENST00000448576 NEO1Q92859 1461 aa46.99■■■■■ 5.11
GATAD2A-209ENST00000448576 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
GATAD2A-209ENST00000448576 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.98■■■■■ 5.11
GATAD2A-209ENST00000448576 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.92■■■■■ 5.1
GATAD2A-209ENST00000448576 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.92■■■■■ 5.16e-9■■■■□ 20.6
GATAD2A-209ENST00000448576 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.9■■■■■ 5.1
GATAD2A-209ENST00000448576 FMN1Q68DA7 1419 aa46.9■■■■■ 5.1
GATAD2A-209ENST00000448576 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.9■■■■■ 5.1
GATAD2A-209ENST00000448576 HECW1Q76N89 1606 aa46.89■■■■■ 5.1
GATAD2A-209ENST00000448576 RAPGEF3O95398 923 aa46.78■■■■■ 5.08
GATAD2A-209ENST00000448576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.77■■■■■ 5.08
GATAD2A-209ENST00000448576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.75■■■■■ 5.07
GATAD2A-209ENST00000448576 RICTORQ6R327 1708 aa46.74■■■■■ 5.07
GATAD2A-209ENST00000448576 FANCAO15360 1455 aa46.73■■■■■ 5.07
GATAD2A-209ENST00000448576 AKNAQ7Z591 1439 aa46.68■■■■■ 5.06
GATAD2A-209ENST00000448576 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
GATAD2A-209ENST00000448576 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.05
GATAD2A-209ENST00000448576 KIF14Q15058 1648 aa46.6■■■■■ 5.05
GATAD2A-209ENST00000448576 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.59■■■■■ 5.05
GATAD2A-209ENST00000448576 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.57■■■■■ 5.05
GATAD2A-209ENST00000448576 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
GATAD2A-209ENST00000448576 PLCH2O75038 1416 aa46.55■■■■■ 5.04
GATAD2A-209ENST00000448576 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.55■■■■■ 5.04
GATAD2A-209ENST00000448576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.53■■■■■ 5.04
GATAD2A-209ENST00000448576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
GATAD2A-209ENST00000448576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.48■■■■■ 5.03
GATAD2A-209ENST00000448576 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.48■■■■■ 5.03
GATAD2A-209ENST00000448576 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.47■■■■■ 5.03
GATAD2A-209ENST00000448576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
GATAD2A-209ENST00000448576 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.38■■■■■ 5.02
GATAD2A-209ENST00000448576 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.38■■■■■ 5.02
GATAD2A-209ENST00000448576 CLIP1P30622 1438 aa46.37■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms