RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444811.6

NELFE-206, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-206ENST00000444811 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
NELFE-206ENST00000444811 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.28■■■□□ 2.92
NELFE-206ENST00000444811 JPH4Q96JJ6 628 aa33.27■■■□□ 2.92
NELFE-206ENST00000444811 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
NELFE-206ENST00000444811 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
NELFE-206ENST00000444811 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.18■■■□□ 2.9
NELFE-206ENST00000444811 PRXQ9BXM0 1461 aa33.14■■■□□ 2.9
NELFE-206ENST00000444811 IQGAP2Q13576 1575 aa33.08■■■□□ 2.89
NELFE-206ENST00000444811 EEA1Q15075 1411 aa33.04■■■□□ 2.88
NELFE-206ENST00000444811 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.04■■■□□ 2.88
NELFE-206ENST00000444811 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.94■■■□□ 2.86
NELFE-206ENST00000444811 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.92■■■□□ 2.86
NELFE-206ENST00000444811 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
NELFE-206ENST00000444811 DISP1Q96F81 1524 aa32.89■■■□□ 2.86
NELFE-206ENST00000444811 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.88■■■□□ 2.85
NELFE-206ENST00000444811 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.82■■■□□ 2.84
NELFE-206ENST00000444811 PTPRGP23470 1445 aa32.79■■■□□ 2.84
NELFE-206ENST00000444811 KIAA0556O60303 1618 aa32.79■■■□□ 2.84
NELFE-206ENST00000444811 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.77■■■□□ 2.84
NELFE-206ENST00000444811 KIF21BO75037 1637 aa32.75■■■□□ 2.83
NELFE-206ENST00000444811 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
NELFE-206ENST00000444811 GOLGA3Q08378 1498 aa32.66■■■□□ 2.82
NELFE-206ENST00000444811 UACAQ9BZF9 1416 aa32.6■■■□□ 2.81
NELFE-206ENST00000444811 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.59■■■□□ 2.81
NELFE-206ENST00000444811 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
NELFE-206ENST00000444811 MAPKBP1O60336 1514 aa32.56■■■□□ 2.8
NELFE-206ENST00000444811 ABCC2Q92887 1545 aa32.55■■■□□ 2.8
NELFE-206ENST00000444811 SAMD9Q5K651 1589 aa32.54■■■□□ 2.8
NELFE-206ENST00000444811 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.52■■■□□ 2.8
NELFE-206ENST00000444811 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
NELFE-206ENST00000444811 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.48■■■□□ 2.79
NELFE-206ENST00000444811 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.48■■■□□ 2.79
NELFE-206ENST00000444811 P3H3Q8IVL6 736 aa32.47■■■□□ 2.79
NELFE-206ENST00000444811 ABCA8O94911 1581 aa32.45■■■□□ 2.79
NELFE-206ENST00000444811 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.43■■■□□ 2.78
NELFE-206ENST00000444811 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.42■■■□□ 2.78
NELFE-206ENST00000444811 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
NELFE-206ENST00000444811 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
NELFE-206ENST00000444811 DIP2BQ9P265 1576 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-206ENST00000444811 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
NELFE-206ENST00000444811 ASXL2Q76L83 1435 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-206ENST00000444811 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-206ENST00000444811 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.34■■■□□ 2.77
NELFE-206ENST00000444811 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.32■■■□□ 2.76
NELFE-206ENST00000444811 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.23■■■□□ 2.75
NELFE-206ENST00000444811 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.21■■■□□ 2.75
NELFE-206ENST00000444811 GLI2P10070 1586 aa32.18■■■□□ 2.74
NELFE-206ENST00000444811 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
NELFE-206ENST00000444811 ATP10BO94823 1461 aa32.16■■■□□ 2.74
NELFE-206ENST00000444811 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.16■■■□□ 2.74
NELFE-206ENST00000444811 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
NELFE-206ENST00000444811 ARID3CA6NKF2 412 aa32.12■■■□□ 2.73
NELFE-206ENST00000444811 TSPOAP1O95153 1857 aa32.08■■■□□ 2.73
NELFE-206ENST00000444811 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.04■■■□□ 2.72
NELFE-206ENST00000444811 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
NELFE-206ENST00000444811 FMN1Q68DA7 1419 aa32.01■■■□□ 2.72
NELFE-206ENST00000444811 KDM6BO15054 1643 aa31.97■■■□□ 2.71
NELFE-206ENST00000444811 KCNH8Q96L42 1107 aa31.96■■■□□ 2.71
NELFE-206ENST00000444811 CLIP1P30622 1438 aa31.93■■■□□ 2.7
NELFE-206ENST00000444811 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
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NELFE-206ENST00000444811 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.91■■■□□ 2.7
NELFE-206ENST00000444811 HECW1Q76N89 1606 aa31.9■■■□□ 2.7
NELFE-206ENST00000444811 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
NELFE-206ENST00000444811 CD109Q6YHK3 1445 aa31.86■■■□□ 2.69
NELFE-206ENST00000444811 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.86■■■□□ 2.69
NELFE-206ENST00000444811 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.83■■■□□ 2.69
NELFE-206ENST00000444811 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.83■■■□□ 2.69
NELFE-206ENST00000444811 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.83■■■□□ 2.69
NELFE-206ENST00000444811 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.81■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.81■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.8■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.79■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 CEP162Q5TB80 1403 aa31.78■■■□□ 2.68
NELFE-206ENST00000444811 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
NELFE-206ENST00000444811 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.7■■■□□ 2.66
NELFE-206ENST00000444811 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.663e-7■□□□□ 8.5
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NELFE-206ENST00000444811 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.64■■■□□ 2.66
NELFE-206ENST00000444811 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
NELFE-206ENST00000444811 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
NELFE-206ENST00000444811 KIF14Q15058 1648 aa31.57■■■□□ 2.64
NELFE-206ENST00000444811 NEO1Q92859 1461 aa31.56■■■□□ 2.64
NELFE-206ENST00000444811 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.55■■■□□ 2.64
NELFE-206ENST00000444811 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.53■■■□□ 2.64
NELFE-206ENST00000444811 ADGRL1O94910 1474 aa31.48■■■□□ 2.63
NELFE-206ENST00000444811 PLCH2O75038 1416 aa31.48■■■□□ 2.63
NELFE-206ENST00000444811 FANCAO15360 1455 aa31.46■■■□□ 2.63
NELFE-206ENST00000444811 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-206ENST00000444811 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.44■■■□□ 2.62
NELFE-206ENST00000444811 AKNAQ7Z591 1439 aa31.43■■■□□ 2.62
NELFE-206ENST00000444811 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.41■■■□□ 2.62
NELFE-206ENST00000444811 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.39■■■□□ 2.62
NELFE-206ENST00000444811 RAPGEF3O95398 923 aa31.37■■■□□ 2.61
NELFE-206ENST00000444811 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
NELFE-206ENST00000444811 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.32■■■□□ 2.61
NELFE-206ENST00000444811 RICTORQ6R327 1708 aa31.32■■■□□ 2.6
NELFE-206ENST00000444811 PREX2Q70Z35 1606 aa31.31■■■□□ 2.6
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