RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442730.1

HDLBP-220, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-220ENST00000442730 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
HDLBP-220ENST00000442730 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.82■■■■□ 3.65
HDLBP-220ENST00000442730 JPH4Q96JJ6 628 aa37.81■■■■□ 3.64
HDLBP-220ENST00000442730 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.65■■■■□ 3.62
HDLBP-220ENST00000442730 IQGAP2Q13576 1575 aa37.58■■■■□ 3.61
HDLBP-220ENST00000442730 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
HDLBP-220ENST00000442730 PRXQ9BXM0 1461 aa37.47■■■■□ 3.59
HDLBP-220ENST00000442730 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.39■■■■□ 3.58
HDLBP-220ENST00000442730 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.37■■■■□ 3.57
HDLBP-220ENST00000442730 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.36■■■■□ 3.57
HDLBP-220ENST00000442730 DISP1Q96F81 1524 aa37.36■■■■□ 3.57
HDLBP-220ENST00000442730 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.34■■■■□ 3.57
HDLBP-220ENST00000442730 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.31■■■■□ 3.56
HDLBP-220ENST00000442730 PTPRGP23470 1445 aa37.31■■■■□ 3.56
HDLBP-220ENST00000442730 EEA1Q15075 1411 aa37.28■■■■□ 3.56
HDLBP-220ENST00000442730 KIAA0556O60303 1618 aa37.25■■■■□ 3.55
HDLBP-220ENST00000442730 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.24■■■■□ 3.55
HDLBP-220ENST00000442730 MAPKBP1O60336 1514 aa37.2■■■■□ 3.55
HDLBP-220ENST00000442730 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
HDLBP-220ENST00000442730 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.15■■■■□ 3.54
HDLBP-220ENST00000442730 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
HDLBP-220ENST00000442730 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.09■■■■□ 3.53
HDLBP-220ENST00000442730 GOLGA3Q08378 1498 aa37.09■■■■□ 3.53
HDLBP-220ENST00000442730 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.09■■■■□ 3.53
HDLBP-220ENST00000442730 ABCC2Q92887 1545 aa37.08■■■■□ 3.53
HDLBP-220ENST00000442730 UACAQ9BZF9 1416 aa37.07■■■■□ 3.52
HDLBP-220ENST00000442730 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.04■■■■□ 3.52
HDLBP-220ENST00000442730 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
HDLBP-220ENST00000442730 DIP2BQ9P265 1576 aa37■■■■□ 3.51
HDLBP-220ENST00000442730 KIF21BO75037 1637 aa36.98■■■■□ 3.51
HDLBP-220ENST00000442730 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.91■■■■□ 3.5
HDLBP-220ENST00000442730 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.9■■■■□ 3.5
HDLBP-220ENST00000442730 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.89■■■■□ 3.5
HDLBP-220ENST00000442730 SAMD9Q5K651 1589 aa36.88■■■■□ 3.49
HDLBP-220ENST00000442730 ASXL2Q76L83 1435 aa36.86■■■■□ 3.49
HDLBP-220ENST00000442730 ABCA8O94911 1581 aa36.86■■■■□ 3.49
HDLBP-220ENST00000442730 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
HDLBP-220ENST00000442730 P3H3Q8IVL6 736 aa36.73■■■■□ 3.47
HDLBP-220ENST00000442730 GLI2P10070 1586 aa36.71■■■■□ 3.47
HDLBP-220ENST00000442730 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
HDLBP-220ENST00000442730 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.64■■■■□ 3.46
HDLBP-220ENST00000442730 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.63■■■■□ 3.45
HDLBP-220ENST00000442730 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
HDLBP-220ENST00000442730 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.61■■■■□ 3.45
HDLBP-220ENST00000442730 TSPOAP1O95153 1857 aa36.61■■■■□ 3.45
HDLBP-220ENST00000442730 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.57■■■■□ 3.44
HDLBP-220ENST00000442730 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.57■■■■□ 3.44
HDLBP-220ENST00000442730 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
HDLBP-220ENST00000442730 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
HDLBP-220ENST00000442730 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.54■■■■□ 3.44
HDLBP-220ENST00000442730 ATP10BO94823 1461 aa36.5■■■■□ 3.43
HDLBP-220ENST00000442730 KDM6BO15054 1643 aa36.48■■■■□ 3.43
HDLBP-220ENST00000442730 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
HDLBP-220ENST00000442730 ARID3CA6NKF2 412 aa36.46■■■■□ 3.43
HDLBP-220ENST00000442730 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.38■■■■□ 3.41
HDLBP-220ENST00000442730 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.36■■■■□ 3.41
HDLBP-220ENST00000442730 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.35■■■■□ 3.41
HDLBP-220ENST00000442730 KCNH8Q96L42 1107 aa36.34■■■■□ 3.41
HDLBP-220ENST00000442730 CD109Q6YHK3 1445 aa36.28■■■■□ 3.4
HDLBP-220ENST00000442730 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.28■■■■□ 3.4
HDLBP-220ENST00000442730 FMN1Q68DA7 1419 aa36.25■■■■□ 3.39
HDLBP-220ENST00000442730 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.23■■■■□ 3.39
HDLBP-220ENST00000442730 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HDLBP-220ENST00000442730 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
HDLBP-220ENST00000442730 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
HDLBP-220ENST00000442730 HECW1Q76N89 1606 aa36.16■■■■□ 3.38
HDLBP-220ENST00000442730 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
HDLBP-220ENST00000442730 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.07■■■■□ 3.36
HDLBP-220ENST00000442730 CLIP1P30622 1438 aa36.02■■■■□ 3.36
HDLBP-220ENST00000442730 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.98■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.97■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.96■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.96■■■■□ 3.35
HDLBP-220ENST00000442730 NEO1Q92859 1461 aa35.94■■■■□ 3.34
HDLBP-220ENST00000442730 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.92■■■■□ 3.34
HDLBP-220ENST00000442730 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
HDLBP-220ENST00000442730 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.87■■■■□ 3.33
HDLBP-220ENST00000442730 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.85■■■■□ 3.33
HDLBP-220ENST00000442730 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
HDLBP-220ENST00000442730 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
HDLBP-220ENST00000442730 KIF14Q15058 1648 aa35.82■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.81■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 FANCAO15360 1455 aa35.8■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 CEP162Q5TB80 1403 aa35.79■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.78■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.77■■■■□ 3.32
HDLBP-220ENST00000442730 PLCH2O75038 1416 aa35.74■■■■□ 3.31
HDLBP-220ENST00000442730 AKNAQ7Z591 1439 aa35.74■■■■□ 3.31
HDLBP-220ENST00000442730 ADGRL1O94910 1474 aa35.72■■■■□ 3.31
HDLBP-220ENST00000442730 RAPGEF3O95398 923 aa35.71■■■■□ 3.31
HDLBP-220ENST00000442730 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.71■■■■□ 3.31
HDLBP-220ENST00000442730 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
HDLBP-220ENST00000442730 RICTORQ6R327 1708 aa35.66■■■■□ 3.3
HDLBP-220ENST00000442730 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.6■■■■□ 3.29
HDLBP-220ENST00000442730 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.57■■■■□ 3.28
HDLBP-220ENST00000442730 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.57■■■■□ 3.28
HDLBP-220ENST00000442730 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.56■■■■□ 3.28
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