RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 JPH4Q96JJ6 628 aa27.63■■■□□ 2.01
RBM39-215ENST00000442447 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
RBM39-215ENST00000442447 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.58■■■□□ 2.01
RBM39-215ENST00000442447 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
RBM39-215ENST00000442447 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
RBM39-215ENST00000442447 IQGAP2Q13576 1575 aa27.4■■□□□ 1.98
RBM39-215ENST00000442447 PRXQ9BXM0 1461 aa27.32■■□□□ 1.96
RBM39-215ENST00000442447 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.3■■□□□ 1.96
RBM39-215ENST00000442447 PTPRGP23470 1445 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 DISP1Q96F81 1524 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.24■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.22■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.22■■□□□ 1.95
RBM39-215ENST00000442447 EEA1Q15075 1411 aa27.18■■□□□ 1.94
RBM39-215ENST00000442447 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
RBM39-215ENST00000442447 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.15■■□□□ 1.94
RBM39-215ENST00000442447 KIAA0556O60303 1618 aa27.15■■□□□ 1.94
RBM39-215ENST00000442447 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RBM39-215ENST00000442447 MAPKBP1O60336 1514 aa27.1■■□□□ 1.93
RBM39-215ENST00000442447 UACAQ9BZF9 1416 aa27.06■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 GOLGA3Q08378 1498 aa27.06■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.04■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 ABCC2Q92887 1545 aa27.04■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.03■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.02■■□□□ 1.92
RBM39-215ENST00000442447 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.98■■□□□ 1.91
RBM39-215ENST00000442447 DIP2BQ9P265 1576 aa26.97■■□□□ 1.91
RBM39-215ENST00000442447 KIF21BO75037 1637 aa26.94■■□□□ 1.9
RBM39-215ENST00000442447 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
RBM39-215ENST00000442447 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.91■■□□□ 1.9
RBM39-215ENST00000442447 ASXL2Q76L83 1435 aa26.9■■□□□ 1.9
RBM39-215ENST00000442447 P3H3Q8IVL6 736 aa26.9■■□□□ 1.9
RBM39-215ENST00000442447 ABCA8O94911 1581 aa26.87■■□□□ 1.89
RBM39-215ENST00000442447 SAMD9Q5K651 1589 aa26.87■■□□□ 1.89
RBM39-215ENST00000442447 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
RBM39-215ENST00000442447 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RBM39-215ENST00000442447 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.82■■□□□ 1.88
RBM39-215ENST00000442447 TSPOAP1O95153 1857 aa26.76■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 GLI2P10070 1586 aa26.75■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.73■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.72■■□□□ 1.87
RBM39-215ENST00000442447 ARID3CA6NKF2 412 aa26.7■■□□□ 1.86
RBM39-215ENST00000442447 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.7■■□□□ 1.86
RBM39-215ENST00000442447 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.67■■□□□ 1.86
RBM39-215ENST00000442447 ATP10BO94823 1461 aa26.64■■□□□ 1.86
RBM39-215ENST00000442447 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
RBM39-215ENST00000442447 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.63■■□□□ 1.85
RBM39-215ENST00000442447 KDM6BO15054 1643 aa26.61■■□□□ 1.85
RBM39-215ENST00000442447 KCNH8Q96L42 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
RBM39-215ENST00000442447 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
RBM39-215ENST00000442447 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.54■■□□□ 1.84
RBM39-215ENST00000442447 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RBM39-215ENST00000442447 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RBM39-215ENST00000442447 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.52■■□□□ 1.84
RBM39-215ENST00000442447 CD109Q6YHK3 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
RBM39-215ENST00000442447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.5■■□□□ 1.83
RBM39-215ENST00000442447 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.45■■□□□ 1.83
RBM39-215ENST00000442447 FMN1Q68DA7 1419 aa26.45■■□□□ 1.82
RBM39-215ENST00000442447 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RBM39-215ENST00000442447 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.4■■□□□ 1.82
RBM39-215ENST00000442447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
RBM39-215ENST00000442447 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.38■■□□□ 1.81
RBM39-215ENST00000442447 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RBM39-215ENST00000442447 HECW1Q76N89 1606 aa26.36■■□□□ 1.81
RBM39-215ENST00000442447 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
RBM39-215ENST00000442447 CLIP1P30622 1438 aa26.29■■□□□ 1.8
RBM39-215ENST00000442447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.23■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.22■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.22■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.21■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 NEO1Q92859 1461 aa26.21■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.2■■□□□ 1.79
RBM39-215ENST00000442447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RBM39-215ENST00000442447 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.15■■□□□ 1.78
RBM39-215ENST00000442447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.15■■□□□ 1.78
RBM39-215ENST00000442447 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
RBM39-215ENST00000442447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.14■■□□□ 1.78
RBM39-215ENST00000442447 FANCAO15360 1455 aa26.13■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 KIF14Q15058 1648 aa26.12■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 CEP162Q5TB80 1403 aa26.12■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 RAPGEF3O95398 923 aa26.11■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 AKNAQ7Z591 1439 aa26.09■■□□□ 1.77
RBM39-215ENST00000442447 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.07■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 PLCH2O75038 1416 aa26.07■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 ADGRL1O94910 1474 aa26.06■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.06■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.03■■□□□ 1.76
RBM39-215ENST00000442447 RICTORQ6R327 1708 aa26■■□□□ 1.75
RBM39-215ENST00000442447 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.97■■□□□ 1.75
RBM39-215ENST00000442447 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.96■■□□□ 1.75
RBM39-215ENST00000442447 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.95■■□□□ 1.74
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