RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442166.2

PCOLCE-AS1-201, PCOLCE antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCOLCE-AS1, Length 2,537 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.113e-6■■■■□ 21.9
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PBRM1Q86U86 1689 aa28.21■■■□□ 2.11
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.21■■■□□ 2.11
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 WDR62O43379 1518 aa28.18■■■□□ 2.1
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TIAM1Q13009 1591 aa28.15■■■□□ 2.1
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.15■■■□□ 2.1
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.13■■■□□ 2.09
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ERCC6Q03468 1493 aa28.12■■■□□ 2.09
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 IFT140Q96RY7 1462 aa28.07■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MAP3K1Q13233 1512 aa28.07■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ADAMTS12P58397 1594 aa28.05■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GRIN2BQ13224 1484 aa28.03■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SAMD9Q5K651 1589 aa28.03■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.03■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.02■■■□□ 2.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.99■■■□□ 2.07
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.98■■■□□ 2.07
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.96■■■□□ 2.07
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FMN1Q68DA7 1419 aa27.95■■■□□ 2.06
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.94■■■□□ 2.06
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.9■■■□□ 2.06
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 IQGAP2Q13576 1575 aa27.89■■■□□ 2.05
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.87■■■□□ 2.05
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ITGAEP38570 1179 aa27.84■■■□□ 2.05
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GRIN2AQ12879 1464 aa27.75■■■□□ 2.03
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.7■■■□□ 2.03
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.69■■■□□ 2.02
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.69■■■□□ 2.02
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SYNJ2O15056 1496 aa27.63■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DISP1Q96F81 1524 aa27.62■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FBLN2P98095 1184 aa27.62■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CEP170Q5SW79 1584 aa27.61■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.61■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIAA0556O60303 1618 aa27.61■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HECW1Q76N89 1606 aa27.6■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.58■■■□□ 2.01
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.57■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NCOA2Q15596 1464 aa27.57■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARID3CA6NKF2 412 aa27.56■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.56■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.56■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.52■■■□□ 2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.5■■□□□ 1.99
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.48■■□□□ 1.99
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NUP160Q12769 1436 aa27.47■■□□□ 1.99
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARHGEF11O15085 1522 aa27.45■■□□□ 1.99
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.4■■□□□ 1.98
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PTPRKQ15262 1439 aa27.4■■□□□ 1.98
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 JPH4Q96JJ6 628 aa27.39■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MAPKBP1O60336 1514 aa27.38■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.37■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.34■■□□□ 1.97
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.29■■□□□ 1.96
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CHD1O14646 1710 aa27.27■■□□□ 1.96
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HFM1A2PYH4 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NAIPQ13075 1403 aa27.2■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MIA2Q96PC5 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.17■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.16■■□□□ 1.94
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.13■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCA8O94911 1581 aa27.13■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIF14Q15058 1648 aa27.11■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NEUROD1Q13562 356 aa27.1■■□□□ 1.93
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 UACAQ9BZF9 1416 aa27.07■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.06■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KDM6BO15054 1643 aa27.04■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ATP10BO94823 1461 aa27.04■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.04■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PTPRGP23470 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DAPK1P53355 1430 aa27.01■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SHROOM2Q13796 1616 aa27■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 AKNAQ7Z591 1439 aa26.99■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.98■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCC5O15440 1437 aa26.98■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.97■■□□□ 1.91
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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