RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441670.1

CCDC74B-208, Transcript of coiled-coil domain containing 74B, human

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene CCDC74B, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC74B-208	ENST00000441670	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.97	■■■■□ 3.03
CCDC74B-208	ENST00000441670	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
CCDC74B-208	ENST00000441670	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		33.94	■■■■□ 3.02
CCDC74B-208	ENST00000441670	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCDC74B-208	ENST00000441670	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CCDC74B-208	ENST00000441670	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.78	■■■■□ 3
CCDC74B-208	ENST00000441670	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.73	■■■□□ 2.99
CCDC74B-208	ENST00000441670	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CCDC74B-208	ENST00000441670	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CCDC74B-208	ENST00000441670	EEA1	Q15075	1411 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CCDC74B-208	ENST00000441670	PTPRG	P23470	1445 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CCDC74B-208	ENST00000441670	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.63	■■■□□ 2.97
CCDC74B-208	ENST00000441670	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
CCDC74B-208	ENST00000441670	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CCDC74B-208	ENST00000441670	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CCDC74B-208	ENST00000441670	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CCDC74B-208	ENST00000441670	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CCDC74B-208	ENST00000441670	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCDC74B-208	ENST00000441670	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CCDC74B-208	ENST00000441670	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CCDC74B-208	ENST00000441670	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CCDC74B-208	ENST00000441670	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CCDC74B-208	ENST00000441670	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CCDC74B-208	ENST00000441670	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CCDC74B-208	ENST00000441670	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CCDC74B-208	ENST00000441670	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CCDC74B-208	ENST00000441670	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.28	■■■□□ 2.92
CCDC74B-208	ENST00000441670	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CCDC74B-208	ENST00000441670	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CCDC74B-208	ENST00000441670	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CCDC74B-208	ENST00000441670	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CCDC74B-208	ENST00000441670	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CCDC74B-208	ENST00000441670	KIF21B	O75037	1637 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CCDC74B-208	ENST00000441670	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CCDC74B-208	ENST00000441670	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CCDC74B-208	ENST00000441670	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CCDC74B-208	ENST00000441670	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CCDC74B-208	ENST00000441670	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CCDC74B-208	ENST00000441670	ABCA8	O94911	1581 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CCDC74B-208	ENST00000441670	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CCDC74B-208	ENST00000441670	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CCDC74B-208	ENST00000441670	GLI2	P10070	1586 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CCDC74B-208	ENST00000441670	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CCDC74B-208	ENST00000441670	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CCDC74B-208	ENST00000441670	ATP10B	O94823	1461 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CCDC74B-208	ENST00000441670	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CCDC74B-208	ENST00000441670	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CCDC74B-208	ENST00000441670	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CCDC74B-208	ENST00000441670	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CCDC74B-208	ENST00000441670	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CCDC74B-208	ENST00000441670	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CCDC74B-208	ENST00000441670	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CCDC74B-208	ENST00000441670	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CCDC74B-208	ENST00000441670	KDM6B	O15054	1643 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CCDC74B-208	ENST00000441670	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CCDC74B-208	ENST00000441670	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CCDC74B-208	ENST00000441670	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CCDC74B-208	ENST00000441670	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CCDC74B-208	ENST00000441670	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.54	■■■□□ 2.8
CCDC74B-208	ENST00000441670	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
CCDC74B-208	ENST00000441670	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CCDC74B-208	ENST00000441670	CLIP1	P30622	1438 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CCDC74B-208	ENST00000441670	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CCDC74B-208	ENST00000441670	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CCDC74B-208	ENST00000441670	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CCDC74B-208	ENST00000441670	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CCDC74B-208	ENST00000441670	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
CCDC74B-208	ENST00000441670	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CCDC74B-208	ENST00000441670	NEO1	Q92859	1461 aa		32.32	■■■□□ 2.76
CCDC74B-208	ENST00000441670	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CCDC74B-208	ENST00000441670	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CCDC74B-208	ENST00000441670	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.26	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.24	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	FANCA	O15360	1455 aa		32.21	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.2	■■■□□ 2.75
CCDC74B-208	ENST00000441670	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	PLCH2	O75038	1416 aa		32.17	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	KIF14	Q15058	1648 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CCDC74B-208	ENST00000441670	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
CCDC74B-208	ENST00000441670	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CCDC74B-208	ENST00000441670	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CCDC74B-208	ENST00000441670	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.03	■■■□□ 2.72
CCDC74B-208	ENST00000441670	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.01	■■■□□ 2.72
CCDC74B-208	ENST00000441670	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32	■■■□□ 2.71
CCDC74B-208	ENST00000441670	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.98	■■■□□ 2.71
CCDC74B-208	ENST00000441670	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CCDC74B-208	ENST00000441670	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71

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