RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 JPH4Q96JJ6 628 aa47.28■■■■■ 5.16
FAAP20-210ENST00000440825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
FAAP20-210ENST00000440825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.14■■■■■ 5.14
FAAP20-210ENST00000440825 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.96■■■■■ 5.11
FAAP20-210ENST00000440825 IQGAP2Q13576 1575 aa46.85■■■■■ 5.09
FAAP20-210ENST00000440825 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
FAAP20-210ENST00000440825 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.71■■■■■ 5.07
FAAP20-210ENST00000440825 PRXQ9BXM0 1461 aa46.62■■■■■ 5.05
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRGP23470 1445 aa46.62■■■■■ 5.05
FAAP20-210ENST00000440825 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
FAAP20-210ENST00000440825 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.58■■■■■ 5.05
FAAP20-210ENST00000440825 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.57■■■■■ 5.05
FAAP20-210ENST00000440825 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.56■■■■■ 5.04
FAAP20-210ENST00000440825 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.54■■■■■ 5.04
FAAP20-210ENST00000440825 DISP1Q96F81 1524 aa46.53■■■■■ 5.04
FAAP20-210ENST00000440825 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.52■■■■■ 5.04
FAAP20-210ENST00000440825 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
FAAP20-210ENST00000440825 EEA1Q15075 1411 aa46.41■■■■■ 5.02
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA0556O60303 1618 aa46.39■■■■■ 5.02
FAAP20-210ENST00000440825 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.39■■■■■ 5.02
FAAP20-210ENST00000440825 MAPKBP1O60336 1514 aa46.31■■■■■ 5
FAAP20-210ENST00000440825 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.28■■■■■ 5
FAAP20-210ENST00000440825 UACAQ9BZF9 1416 aa46.26■■■■■ 5
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA3Q08378 1498 aa46.25■■■■■ 5
FAAP20-210ENST00000440825 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.23■■■■■ 4.99
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC2Q92887 1545 aa46.22■■■■■ 4.99
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.2■■■■■ 4.99
FAAP20-210ENST00000440825 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.17■■■■■ 4.98
FAAP20-210ENST00000440825 DIP2BQ9P265 1576 aa46.13■■■■■ 4.97
FAAP20-210ENST00000440825 P3H3Q8IVL6 736 aa46.09■■■■■ 4.97
FAAP20-210ENST00000440825 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
FAAP20-210ENST00000440825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.04■■■■■ 4.96
FAAP20-210ENST00000440825 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.04■■■■■ 4.96
FAAP20-210ENST00000440825 ASXL2Q76L83 1435 aa46.02■■■■■ 4.96
FAAP20-210ENST00000440825 KIF21BO75037 1637 aa46.01■■■■■ 4.96
FAAP20-210ENST00000440825 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.98■■■■■ 4.95
FAAP20-210ENST00000440825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA8O94911 1581 aa45.89■■■■■ 4.94
FAAP20-210ENST00000440825 TSPOAP1O95153 1857 aa45.89■■■■■ 4.94
FAAP20-210ENST00000440825 SAMD9Q5K651 1589 aa45.88■■■■■ 4.94
FAAP20-210ENST00000440825 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
FAAP20-210ENST00000440825 ARID3CA6NKF2 412 aa45.77■■■■■ 4.92
FAAP20-210ENST00000440825 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
FAAP20-210ENST00000440825 GLI2P10070 1586 aa45.71■■■■■ 4.91
FAAP20-210ENST00000440825 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.71■■■■■ 4.91
FAAP20-210ENST00000440825 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.68■■■■■ 4.9
FAAP20-210ENST00000440825 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.61■■■■■ 4.89
FAAP20-210ENST00000440825 KCNH8Q96L42 1107 aa45.6■■■■■ 4.89
FAAP20-210ENST00000440825 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.59■■■■■ 4.89
FAAP20-210ENST00000440825 KDM6BO15054 1643 aa45.58■■■■■ 4.89
FAAP20-210ENST00000440825 ATP10BO94823 1461 aa45.55■■■■■ 4.88
FAAP20-210ENST00000440825 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.53■■■■■ 4.88
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
FAAP20-210ENST00000440825 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
FAAP20-210ENST00000440825 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.38■■■■■ 4.86
FAAP20-210ENST00000440825 CD109Q6YHK3 1445 aa45.35■■■■■ 4.85
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.33■■■■■ 4.85
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.33■■■■■ 4.85
FAAP20-210ENST00000440825 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
FAAP20-210ENST00000440825 FMN1Q68DA7 1419 aa45.2■■■■■ 4.83
FAAP20-210ENST00000440825 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
FAAP20-210ENST00000440825 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.2■■■■■ 4.83
FAAP20-210ENST00000440825 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.16■■■■■ 4.82
FAAP20-210ENST00000440825 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.12■■■■■ 4.81
FAAP20-210ENST00000440825 HECW1Q76N89 1606 aa45.08■■■■■ 4.81
FAAP20-210ENST00000440825 CLIP1P30622 1438 aa44.93■■■■■ 4.78
FAAP20-210ENST00000440825 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.775e-8■■■□□ 16
FAAP20-210ENST00000440825 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
FAAP20-210ENST00000440825 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
FAAP20-210ENST00000440825 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.83■■■■■ 4.77
FAAP20-210ENST00000440825 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.82■■■■■ 4.77
FAAP20-210ENST00000440825 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.81■■■■■ 4.76
FAAP20-210ENST00000440825 NEO1Q92859 1461 aa44.8■■■■■ 4.76
FAAP20-210ENST00000440825 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.79■■■■■ 4.76
FAAP20-210ENST00000440825 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.79■■■■■ 4.76
FAAP20-210ENST00000440825 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.75■■■■■ 4.75
FAAP20-210ENST00000440825 RAPGEF3O95398 923 aa44.71■■■■■ 4.75
FAAP20-210ENST00000440825 FANCAO15360 1455 aa44.69■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.67■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.66■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 KIF14Q15058 1648 aa44.66■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.65■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 AKNAQ7Z591 1439 aa44.64■■■■■ 4.74
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRL1O94910 1474 aa44.61■■■■■ 4.73
FAAP20-210ENST00000440825 CEP162Q5TB80 1403 aa44.61■■■■■ 4.73
FAAP20-210ENST00000440825 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.6■■■■■ 4.73
FAAP20-210ENST00000440825 PLCH2O75038 1416 aa44.57■■■■■ 4.72
FAAP20-210ENST00000440825 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.55■■■■■ 4.72
FAAP20-210ENST00000440825 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
FAAP20-210ENST00000440825 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.54■■■■■ 4.72
FAAP20-210ENST00000440825 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.46■■■■■ 4.71
FAAP20-210ENST00000440825 RICTORQ6R327 1708 aa44.44■■■■■ 4.71
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.43■■■■■ 4.7
FAAP20-210ENST00000440825 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.4■■■■■ 4.7
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