RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440445.5

AFF3-211, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene AFF3, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF3-211ENST00000440445 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
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AFF3-211ENST00000440445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.06■■■■■ 4.96
AFF3-211ENST00000440445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.73■■■■■ 4.91
AFF3-211ENST00000440445 IQGAP2Q13576 1575 aa45.71■■■■■ 4.91
AFF3-211ENST00000440445 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.59■■■■■ 4.89
AFF3-211ENST00000440445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.58■■■■■ 4.89
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AFF3-211ENST00000440445 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.48■■■■■ 4.87
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AFF3-211ENST00000440445 EEA1Q15075 1411 aa45.11■■■■■ 4.81
AFF3-211ENST00000440445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.1■■■■■ 4.81
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AFF3-211ENST00000440445 KDM6BO15054 1643 aa44.71■■■■■ 4.75
AFF3-211ENST00000440445 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.69■■■■■ 4.74
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AFF3-211ENST00000440445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.64■■■■■ 4.74
AFF3-211ENST00000440445 P3H3Q8IVL6 736 aa44.6■■■■■ 4.73
AFF3-211ENST00000440445 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.47■■■■■ 4.71
AFF3-211ENST00000440445 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.46■■■■■ 4.71
AFF3-211ENST00000440445 ATP10BO94823 1461 aa44.43■■■■■ 4.7
AFF3-211ENST00000440445 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.42■■■■■ 4.7
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AFF3-211ENST00000440445 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.41■■■■■ 4.7
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AFF3-211ENST00000440445 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
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AFF3-211ENST00000440445 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.31■■■■■ 4.68
AFF3-211ENST00000440445 CD109Q6YHK3 1445 aa44.31■■■■■ 4.68
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AFF3-211ENST00000440445 FMN1Q68DA7 1419 aa43.99■■■■■ 4.63
AFF3-211ENST00000440445 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.96■■■■■ 4.63
AFF3-211ENST00000440445 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.95■■■■■ 4.63
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AFF3-211ENST00000440445 HECW1Q76N89 1606 aa43.88■■■■■ 4.61
AFF3-211ENST00000440445 NEO1Q92859 1461 aa43.87■■■■■ 4.61
AFF3-211ENST00000440445 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
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AFF3-211ENST00000440445 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.67■■■■■ 4.58
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AFF3-211ENST00000440445 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.61■■■■■ 4.57
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AFF3-211ENST00000440445 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.56■■■■■ 4.56
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AFF3-211ENST00000440445 CLIP1P30622 1438 aa43.51■■■■■ 4.56
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AFF3-211ENST00000440445 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.48■■■■■ 4.55
AFF3-211ENST00000440445 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.43■■■■■ 4.54
AFF3-211ENST00000440445 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.38■■■■■ 4.54
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AFF3-211ENST00000440445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.31■■■■■ 4.52
AFF3-211ENST00000440445 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.29■■■■■ 4.52
AFF3-211ENST00000440445 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.28■■■■■ 4.52
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