RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439048.1

MMS19-210, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, humanhuman

TSL 5

Gene MMS19, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19-210ENST00000439048 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.02■■■□□ 2.56
MMS19-210ENST00000439048 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
MMS19-210ENST00000439048 JPH4Q96JJ6 628 aa30.98■■■□□ 2.55
MMS19-210ENST00000439048 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.96■■■□□ 2.55
MMS19-210ENST00000439048 IQGAP2Q13576 1575 aa30.87■■■□□ 2.53
MMS19-210ENST00000439048 PRXQ9BXM0 1461 aa30.79■■■□□ 2.52
MMS19-210ENST00000439048 EEA1Q15075 1411 aa30.76■■■□□ 2.51
MMS19-210ENST00000439048 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.74■■■□□ 2.51
MMS19-210ENST00000439048 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.72■■■□□ 2.51
MMS19-210ENST00000439048 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.69■■■□□ 2.5
MMS19-210ENST00000439048 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
MMS19-210ENST00000439048 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.68■■■□□ 2.5
MMS19-210ENST00000439048 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.67■■■□□ 2.5
MMS19-210ENST00000439048 DISP1Q96F81 1524 aa30.62■■■□□ 2.49
MMS19-210ENST00000439048 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.6■■■□□ 2.49
MMS19-210ENST00000439048 PTPRGP23470 1445 aa30.59■■■□□ 2.49
MMS19-210ENST00000439048 KIAA0556O60303 1618 aa30.58■■■□□ 2.49
MMS19-210ENST00000439048 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.58■■■□□ 2.49
MMS19-210ENST00000439048 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
MMS19-210ENST00000439048 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
MMS19-210ENST00000439048 GOLGA3Q08378 1498 aa30.5■■■□□ 2.47
MMS19-210ENST00000439048 KIF21BO75037 1637 aa30.48■■■□□ 2.47
MMS19-210ENST00000439048 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
MMS19-210ENST00000439048 MAPKBP1O60336 1514 aa30.42■■■□□ 2.46
MMS19-210ENST00000439048 UACAQ9BZF9 1416 aa30.39■■■□□ 2.46
MMS19-210ENST00000439048 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.39■■■□□ 2.46
MMS19-210ENST00000439048 ABCC2Q92887 1545 aa30.38■■■□□ 2.45
MMS19-210ENST00000439048 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.32■■■□□ 2.44
MMS19-210ENST00000439048 SAMD9Q5K651 1589 aa30.31■■■□□ 2.44
MMS19-210ENST00000439048 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.28■■■□□ 2.44
MMS19-210ENST00000439048 DIP2BQ9P265 1576 aa30.27■■■□□ 2.44
MMS19-210ENST00000439048 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.25■■■□□ 2.43
MMS19-210ENST00000439048 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.24■■■□□ 2.43
MMS19-210ENST00000439048 ABCA8O94911 1581 aa30.22■■■□□ 2.43
MMS19-210ENST00000439048 P3H3Q8IVL6 736 aa30.21■■■□□ 2.43
MMS19-210ENST00000439048 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
MMS19-210ENST00000439048 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.19■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.19■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 ASXL2Q76L83 1435 aa30.19■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.17■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
MMS19-210ENST00000439048 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.1■■■□□ 2.41
MMS19-210ENST00000439048 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.06■■■□□ 2.4
MMS19-210ENST00000439048 GLI2P10070 1586 aa30.04■■■□□ 2.4
MMS19-210ENST00000439048 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.03■■■□□ 2.4
MMS19-210ENST00000439048 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
MMS19-210ENST00000439048 TSPOAP1O95153 1857 aa29.99■■■□□ 2.39
MMS19-210ENST00000439048 ARID3CA6NKF2 412 aa29.95■■■□□ 2.39
MMS19-210ENST00000439048 ATP10BO94823 1461 aa29.93■■■□□ 2.38
MMS19-210ENST00000439048 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
MMS19-210ENST00000439048 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.93■■■□□ 2.38
MMS19-210ENST00000439048 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.92■■■□□ 2.38
MMS19-210ENST00000439048 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
MMS19-210ENST00000439048 FMN1Q68DA7 1419 aa29.86■■■□□ 2.37
MMS19-210ENST00000439048 KDM6BO15054 1643 aa29.84■■■□□ 2.37
MMS19-210ENST00000439048 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 KCNH8Q96L42 1107 aa29.82■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.82■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.8■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 HECW1Q76N89 1606 aa29.78■■■□□ 2.36
MMS19-210ENST00000439048 CD109Q6YHK3 1445 aa29.74■■■□□ 2.35
MMS19-210ENST00000439048 CLIP1P30622 1438 aa29.71■■■□□ 2.35
MMS19-210ENST00000439048 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
MMS19-210ENST00000439048 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.71■■■□□ 2.35
MMS19-210ENST00000439048 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.7■■■□□ 2.34
MMS19-210ENST00000439048 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
MMS19-210ENST00000439048 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.65■■■□□ 2.34
MMS19-210ENST00000439048 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
MMS19-210ENST00000439048 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.59■■■□□ 2.33
MMS19-210ENST00000439048 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.56■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.55■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.54■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 CEP162Q5TB80 1403 aa29.54■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.52■■■□□ 2.32
MMS19-210ENST00000439048 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.324e-8■■■■■ 52.5
MMS19-210ENST00000439048 NEO1Q92859 1461 aa29.48■■■□□ 2.31
MMS19-210ENST00000439048 KIF14Q15058 1648 aa29.46■■■□□ 2.31
MMS19-210ENST00000439048 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.45■■■□□ 2.31
MMS19-210ENST00000439048 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.45■■■□□ 2.31
MMS19-210ENST00000439048 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
MMS19-210ENST00000439048 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.43■■■□□ 2.3
MMS19-210ENST00000439048 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.41■■■□□ 2.3
MMS19-210ENST00000439048 FANCAO15360 1455 aa29.38■■■□□ 2.29
MMS19-210ENST00000439048 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.36■■■□□ 2.29
MMS19-210ENST00000439048 PLCH2O75038 1416 aa29.32■■■□□ 2.28
MMS19-210ENST00000439048 AKNAQ7Z591 1439 aa29.3■■■□□ 2.28
MMS19-210ENST00000439048 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.28■■■□□ 2.28
MMS19-210ENST00000439048 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
MMS19-210ENST00000439048 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 RAPGEF3O95398 923 aa29.24■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.24■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 ADGRL1O94910 1474 aa29.23■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 RICTORQ6R327 1708 aa29.22■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 PREX2Q70Z35 1606 aa29.21■■■□□ 2.27
MMS19-210ENST00000439048 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.2■■■□□ 2.26
MMS19-210ENST00000439048 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.19■■■□□ 2.26
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