RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRAME-208ENST00000438888 IGF1RP08069 1367 aa21.52■■□□□ 1.04
PRAME-208ENST00000438888 CUL7Q14999 1698 aa21.47■■□□□ 1.03
PRAME-208ENST00000438888 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.47■■□□□ 1.03
PRAME-208ENST00000438888 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.45■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.42■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.41■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-208ENST00000438888 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.38■■□□□ 1.01
PRAME-208ENST00000438888 MAPKBP1O60336 1514 aa21.37■■□□□ 1.01
PRAME-208ENST00000438888 DIP2BQ9P265 1576 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-208ENST00000438888 PTPRGP23470 1445 aa21.32■■□□□ 1
PRAME-208ENST00000438888 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.29■■□□□ 1
PRAME-208ENST00000438888 IQGAP2Q13576 1575 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-208ENST00000438888 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.26■□□□□ 0.99
PRAME-208ENST00000438888 ABCC2Q92887 1545 aa21.2■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 TSPOAP1O95153 1857 aa21.2■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.19■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 KDM6BO15054 1643 aa21.18■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 DISP1Q96F81 1524 aa21.18■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 ASXL2Q76L83 1435 aa21.16■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 UACAQ9BZF9 1416 aa21.14■□□□□ 0.98
PRAME-208ENST00000438888 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.12■□□□□ 0.97
PRAME-208ENST00000438888 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.11■□□□□ 0.97
PRAME-208ENST00000438888 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.11■□□□□ 0.97
PRAME-208ENST00000438888 KIAA0556O60303 1618 aa21.09■□□□□ 0.97
PRAME-208ENST00000438888 GLI2P10070 1586 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-208ENST00000438888 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-208ENST00000438888 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PRAME-208ENST00000438888 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
PRAME-208ENST00000438888 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PRAME-208ENST00000438888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21■□□□□ 0.95
PRAME-208ENST00000438888 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21■□□□□ 0.95
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA3Q08378 1498 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 PRXQ9BXM0 1461 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.91■□□□□ 0.94
PRAME-208ENST00000438888 ARID3CA6NKF2 412 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-208ENST00000438888 KCNH8Q96L42 1107 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-208ENST00000438888 ABCA8O94911 1581 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-208ENST00000438888 P3H3Q8IVL6 736 aa20.87■□□□□ 0.93
PRAME-208ENST00000438888 ADGRL1O94910 1474 aa20.85■□□□□ 0.93
PRAME-208ENST00000438888 CD109Q6YHK3 1445 aa20.82■□□□□ 0.92
PRAME-208ENST00000438888 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-208ENST00000438888 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-208ENST00000438888 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PRAME-208ENST00000438888 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.77■□□□□ 0.91
PRAME-208ENST00000438888 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PRAME-208ENST00000438888 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.76■□□□□ 0.91
PRAME-208ENST00000438888 ATP10BO94823 1461 aa20.73■□□□□ 0.91
PRAME-208ENST00000438888 SAMD9Q5K651 1589 aa20.7■□□□□ 0.9
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PRAME-208ENST00000438888 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PRAME-208ENST00000438888 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.66■□□□□ 0.9
PRAME-208ENST00000438888 EEA1Q15075 1411 aa20.64■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.64■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 KIF21BO75037 1637 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.58■□□□□ 0.89
PRAME-208ENST00000438888 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAME-208ENST00000438888 RAPGEF3O95398 923 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-208ENST00000438888 NEO1Q92859 1461 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.49■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.48■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAME-208ENST00000438888 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.868e-20■■□□□ 11.4
PRAME-208ENST00000438888 FANCAO15360 1455 aa20.41■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.41■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 AKNAQ7Z591 1439 aa20.4■□□□□ 0.86
PRAME-208ENST00000438888 PTPRMP28827 1452 aa20.39■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.38■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.36■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.35■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 MADDQ8WXG6 1647 aa20.35■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 RICTORQ6R327 1708 aa20.34■□□□□ 0.85
PRAME-208ENST00000438888 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.32■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 FMN1Q68DA7 1419 aa20.32■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 HECW1Q76N89 1606 aa20.31■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.31■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.28■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 PLCH2O75038 1416 aa20.27■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PRAME-208ENST00000438888 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.27■□□□□ 0.83
PRAME-208ENST00000438888 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.27■□□□□ 0.83
PRAME-208ENST00000438888 MLECQ14165 292 aa20.25■□□□□ 0.83
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