RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438298.6

TRAF3IP2-AS1-202, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 1,106 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADAMTS12P58397 1594 aa21.3■■□□□ 1
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NUP160Q12769 1436 aa21.26■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CEP170Q5SW79 1584 aa21.24■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.24■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.23■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.22■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SHROOM2Q13796 1616 aa21.18■□□□□ 0.98
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 JPH4Q96JJ6 628 aa21.06■□□□□ 0.96
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.99■□□□□ 0.95
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.97■□□□□ 0.95
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 IGF1RP08069 1367 aa20.92■□□□□ 0.94
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIF27Q86VH2 1401 aa20.91■□□□□ 0.94
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CUL7Q14999 1698 aa20.89■□□□□ 0.94
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.89■□□□□ 0.94
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAPKBP1O60336 1514 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.84■□□□□ 0.93
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.82■□□□□ 0.92
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DIP2BQ9P265 1576 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.77■□□□□ 0.92
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PTPRGP23470 1445 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 IQGAP2Q13576 1575 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TSPOAP1O95153 1857 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KDM6BO15054 1643 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCC2Q92887 1545 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DISP1Q96F81 1524 aa20.58■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ASXL2Q76L83 1435 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 UACAQ9BZF9 1416 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GLI2P10070 1586 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIAA0556O60303 1618 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GOLGA3Q08378 1498 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PRXQ9BXM0 1461 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCA8O94911 1581 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADGRL1O94910 1474 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KCNH8Q96L42 1107 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CD109Q6YHK3 1445 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 P3H3Q8IVL6 736 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ATP10BO94823 1461 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SAMD9Q5K651 1589 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARID3CA6NKF2 412 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.04■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EEA1Q15075 1411 aa20.03■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 KIF21BO75037 1637 aa20.03■□□□□ 0.8
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NEO1Q92859 1461 aa19.99■□□□□ 0.79
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RAPGEF3O95398 923 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.9■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.9■□□□□ 0.78
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 PTPRMP28827 1452 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.84■□□□□ 0.77
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.83■□□□□ 0.77
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 AKNAQ7Z591 1439 aa19.83■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 RICTORQ6R327 1708 aa19.82■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 FANCAO15360 1455 aa19.81■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.81■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.78■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 MADDQ8WXG6 1647 aa19.78■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.75■□□□□ 0.75
TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms