RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-208ENST00000437028 CUL7Q14999 1698 aa26.9■■□□□ 1.9
SNHG11-208ENST00000437028 IGF1RP08069 1367 aa26.86■■□□□ 1.89
SNHG11-208ENST00000437028 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.82■■□□□ 1.88
SNHG11-208ENST00000437028 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
SNHG11-208ENST00000437028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.71■■□□□ 1.87
SNHG11-208ENST00000437028 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.7■■□□□ 1.87
SNHG11-208ENST00000437028 MAPKBP1O60336 1514 aa26.66■■□□□ 1.86
SNHG11-208ENST00000437028 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.65■■□□□ 1.86
SNHG11-208ENST00000437028 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.62■■□□□ 1.85
SNHG11-208ENST00000437028 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SNHG11-208ENST00000437028 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.6■■□□□ 1.85
SNHG11-208ENST00000437028 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.58■■□□□ 1.85
SNHG11-208ENST00000437028 IQGAP2Q13576 1575 aa26.57■■□□□ 1.84
SNHG11-208ENST00000437028 PTPRGP23470 1445 aa26.56■■□□□ 1.84
SNHG11-208ENST00000437028 DIP2BQ9P265 1576 aa26.54■■□□□ 1.84
SNHG11-208ENST00000437028 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.53■■□□□ 1.84
SNHG11-208ENST00000437028 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.49■■□□□ 1.83
SNHG11-208ENST00000437028 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SNHG11-208ENST00000437028 ABCC2Q92887 1545 aa26.43■■□□□ 1.82
SNHG11-208ENST00000437028 DISP1Q96F81 1524 aa26.39■■□□□ 1.82
SNHG11-208ENST00000437028 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.39■■□□□ 1.82
SNHG11-208ENST00000437028 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.39■■□□□ 1.82
SNHG11-208ENST00000437028 UACAQ9BZF9 1416 aa26.37■■□□□ 1.81
SNHG11-208ENST00000437028 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.36■■□□□ 1.81
SNHG11-208ENST00000437028 KDM6BO15054 1643 aa26.35■■□□□ 1.81
SNHG11-208ENST00000437028 TSPOAP1O95153 1857 aa26.34■■□□□ 1.81
SNHG11-208ENST00000437028 ASXL2Q76L83 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
SNHG11-208ENST00000437028 KIAA0556O60303 1618 aa26.32■■□□□ 1.8
SNHG11-208ENST00000437028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.3■■□□□ 1.8
SNHG11-208ENST00000437028 GLI2P10070 1586 aa26.28■■□□□ 1.8
SNHG11-208ENST00000437028 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
SNHG11-208ENST00000437028 GOLGA3Q08378 1498 aa26.24■■□□□ 1.79
SNHG11-208ENST00000437028 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SNHG11-208ENST00000437028 PRXQ9BXM0 1461 aa26.19■■□□□ 1.78
SNHG11-208ENST00000437028 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SNHG11-208ENST00000437028 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SNHG11-208ENST00000437028 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.12■■□□□ 1.77
SNHG11-208ENST00000437028 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.11■■□□□ 1.77
SNHG11-208ENST00000437028 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SNHG11-208ENST00000437028 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.09■■□□□ 1.77
SNHG11-208ENST00000437028 ABCA8O94911 1581 aa26.06■■□□□ 1.76
SNHG11-208ENST00000437028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26■■□□□ 1.75
SNHG11-208ENST00000437028 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.98■■□□□ 1.75
SNHG11-208ENST00000437028 EEA1Q15075 1411 aa25.97■■□□□ 1.75
SNHG11-208ENST00000437028 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.96■■□□□ 1.75
SNHG11-208ENST00000437028 CD109Q6YHK3 1445 aa25.93■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.92■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 KCNH8Q96L42 1107 aa25.91■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 SAMD9Q5K651 1589 aa25.9■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 P3H3Q8IVL6 736 aa25.89■■□□□ 1.74
SNHG11-208ENST00000437028 ADGRL1O94910 1474 aa25.85■■□□□ 1.73
SNHG11-208ENST00000437028 ATP10BO94823 1461 aa25.83■■□□□ 1.73
SNHG11-208ENST00000437028 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.81■■□□□ 1.72
SNHG11-208ENST00000437028 ARID3CA6NKF2 412 aa25.8■■□□□ 1.72
SNHG11-208ENST00000437028 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.74■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 KIF21BO75037 1637 aa25.72■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.71■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.71■■□□□ 1.71
SNHG11-208ENST00000437028 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SNHG11-208ENST00000437028 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.69■■□□□ 1.7
SNHG11-208ENST00000437028 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.69■■□□□ 1.7
SNHG11-208ENST00000437028 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SNHG11-208ENST00000437028 NEO1Q92859 1461 aa25.63■■□□□ 1.69
SNHG11-208ENST00000437028 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.6■■□□□ 1.69
SNHG11-208ENST00000437028 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SNHG11-208ENST00000437028 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.51■■□□□ 1.67
SNHG11-208ENST00000437028 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.51■■□□□ 1.67
SNHG11-208ENST00000437028 RAPGEF3O95398 923 aa25.5■■□□□ 1.67
SNHG11-208ENST00000437028 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.48■■□□□ 1.67
SNHG11-208ENST00000437028 FMN1Q68DA7 1419 aa25.46■■□□□ 1.67
SNHG11-208ENST00000437028 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.44■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 FANCAO15360 1455 aa25.44■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 HECW1Q76N89 1606 aa25.42■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.42■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 AKNAQ7Z591 1439 aa25.42■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.4■■□□□ 1.66
SNHG11-208ENST00000437028 RICTORQ6R327 1708 aa25.38■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.38■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.37■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.34■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 PTPRMP28827 1452 aa25.33■■□□□ 1.65
SNHG11-208ENST00000437028 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.32■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 PLCH2O75038 1416 aa25.31■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.29■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.28■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.27■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.27■■□□□ 1.64
SNHG11-208ENST00000437028 KIF14Q15058 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG11-208ENST00000437028 MADDQ8WXG6 1647 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG11-208ENST00000437028 CLIP1P30622 1438 aa25.26■■□□□ 1.63
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