RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 KIF27Q86VH2 1401 aa46.27■■■■■ 5
UPP1-208ENST00000436673 CUL7Q14999 1698 aa46.11■■■■■ 4.97
UPP1-208ENST00000436673 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.07■■■■■ 4.97
UPP1-208ENST00000436673 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.95■■■■■ 4.95
UPP1-208ENST00000436673 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.8■■■■■ 4.92
UPP1-208ENST00000436673 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.92
UPP1-208ENST00000436673 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.79■■■■■ 4.92
UPP1-208ENST00000436673 MAPKBP1O60336 1514 aa45.73■■■■■ 4.91
UPP1-208ENST00000436673 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.69■■■■■ 4.91
UPP1-208ENST00000436673 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.65■■■■■ 4.9
UPP1-208ENST00000436673 PTPRGP23470 1445 aa45.64■■■■■ 4.9
UPP1-208ENST00000436673 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.6■■■■■ 4.89
UPP1-208ENST00000436673 IQGAP2Q13576 1575 aa45.6■■■■■ 4.89
UPP1-208ENST00000436673 DIP2BQ9P265 1576 aa45.56■■■■■ 4.88
UPP1-208ENST00000436673 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.56■■■■■ 4.88
UPP1-208ENST00000436673 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.52■■■■■ 4.88
UPP1-208ENST00000436673 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
UPP1-208ENST00000436673 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
UPP1-208ENST00000436673 DISP1Q96F81 1524 aa45.42■■■■■ 4.86
UPP1-208ENST00000436673 ABCC2Q92887 1545 aa45.38■■■■■ 4.86
UPP1-208ENST00000436673 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.35■■■■■ 4.85
UPP1-208ENST00000436673 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.32■■■■■ 4.85
UPP1-208ENST00000436673 UACAQ9BZF9 1416 aa45.29■■■■■ 4.84
UPP1-208ENST00000436673 ASXL2Q76L83 1435 aa45.22■■■■■ 4.83
UPP1-208ENST00000436673 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.19■■■■■ 4.82
UPP1-208ENST00000436673 KIAA0556O60303 1618 aa45.19■■■■■ 4.82
UPP1-208ENST00000436673 TSPOAP1O95153 1857 aa45.16■■■■■ 4.82
UPP1-208ENST00000436673 KDM6BO15054 1643 aa45.12■■■■■ 4.81
UPP1-208ENST00000436673 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
UPP1-208ENST00000436673 PRXQ9BXM0 1461 aa45.09■■■■■ 4.81
UPP1-208ENST00000436673 GLI2P10070 1586 aa45.08■■■■■ 4.81
UPP1-208ENST00000436673 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.07■■■■■ 4.81
UPP1-208ENST00000436673 GOLGA3Q08378 1498 aa44.98■■■■■ 4.79
UPP1-208ENST00000436673 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
UPP1-208ENST00000436673 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
UPP1-208ENST00000436673 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
UPP1-208ENST00000436673 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.81■■■■■ 4.76
UPP1-208ENST00000436673 ABCA8O94911 1581 aa44.8■■■■■ 4.76
UPP1-208ENST00000436673 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.78■■■■■ 4.76
UPP1-208ENST00000436673 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.75■■■■■ 4.75
UPP1-208ENST00000436673 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.72■■■■■ 4.75
UPP1-208ENST00000436673 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.71■■■■■ 4.75
UPP1-208ENST00000436673 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
UPP1-208ENST00000436673 P3H3Q8IVL6 736 aa44.59■■■■■ 4.73
UPP1-208ENST00000436673 EEA1Q15075 1411 aa44.56■■■■■ 4.72
UPP1-208ENST00000436673 KCNH8Q96L42 1107 aa44.55■■■■■ 4.72
UPP1-208ENST00000436673 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
UPP1-208ENST00000436673 CD109Q6YHK3 1445 aa44.51■■■■■ 4.72
UPP1-208ENST00000436673 SAMD9Q5K651 1589 aa44.49■■■■■ 4.71
UPP1-208ENST00000436673 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.49■■■■■ 4.71
UPP1-208ENST00000436673 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.47■■■■■ 4.71
UPP1-208ENST00000436673 ATP10BO94823 1461 aa44.45■■■■■ 4.71
UPP1-208ENST00000436673 ARID3CA6NKF2 412 aa44.43■■■■■ 4.7
UPP1-208ENST00000436673 ADGRL1O94910 1474 aa44.34■■■■■ 4.69
UPP1-208ENST00000436673 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.29■■■■■ 4.68
UPP1-208ENST00000436673 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
UPP1-208ENST00000436673 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.21■■■■■ 4.67
UPP1-208ENST00000436673 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 KIF21BO75037 1637 aa44.17■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.17■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.14■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
UPP1-208ENST00000436673 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.06■■■■■ 4.64
UPP1-208ENST00000436673 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.05■■■■■ 4.64
UPP1-208ENST00000436673 NEO1Q92859 1461 aa43.96■■■■■ 4.63
UPP1-208ENST00000436673 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.95■■■■■ 4.63
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.94■■■■■ 4.62
UPP1-208ENST00000436673 RAPGEF3O95398 923 aa43.88■■■■■ 4.62
UPP1-208ENST00000436673 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
UPP1-208ENST00000436673 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.85■■■■■ 4.61
UPP1-208ENST00000436673 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.75■■■■■ 4.59
UPP1-208ENST00000436673 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.75■■■■■ 4.59
UPP1-208ENST00000436673 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
UPP1-208ENST00000436673 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.71■■■■■ 4.59
UPP1-208ENST00000436673 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.7■■■■■ 4.59
UPP1-208ENST00000436673 FMN1Q68DA7 1419 aa43.69■■■■■ 4.58
UPP1-208ENST00000436673 FANCAO15360 1455 aa43.68■■■■■ 4.58
UPP1-208ENST00000436673 AKNAQ7Z591 1439 aa43.67■■■■■ 4.58
UPP1-208ENST00000436673 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.67■■■■■ 4.58
UPP1-208ENST00000436673 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
UPP1-208ENST00000436673 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.62■■■■■ 4.57
UPP1-208ENST00000436673 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
UPP1-208ENST00000436673 HECW1Q76N89 1606 aa43.58■■■■■ 4.57
UPP1-208ENST00000436673 RICTORQ6R327 1708 aa43.56■■■■■ 4.56
UPP1-208ENST00000436673 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.56■■■■■ 4.56
UPP1-208ENST00000436673 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.52■■■■■ 4.56
UPP1-208ENST00000436673 PLCH2O75038 1416 aa43.5■■■■■ 4.55
UPP1-208ENST00000436673 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
UPP1-208ENST00000436673 PTPRMP28827 1452 aa43.49■■■■■ 4.55
UPP1-208ENST00000436673 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.47■■■■■ 4.55
UPP1-208ENST00000436673 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
UPP1-208ENST00000436673 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.44■■■■■ 4.54
UPP1-208ENST00000436673 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.38■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.36■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 MADDQ8WXG6 1647 aa43.36■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.35■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.34■■■■■ 4.53
UPP1-208ENST00000436673 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms